New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5983463 | 63 (1.140) | 5 (0.090) | 5/248 | NT | 7.6% | coding (4108/5049 nt) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | = 5983500 | 60 (1.120) | coding (4145/5049 nt) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
GTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGCGGTGTCGCTACAAACGGCCAAGTTCTACACGCG > NC_002947/5983354‑5983647 | gTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgc < 7:115346‑M2/149‑3 (MQ=255) cATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTgg > 7:102586/1‑149 (MQ=255) aTGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGt > 3:91217/1‑149 (MQ=255) tGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGt > 4:300546/1‑148 (MQ=255) ccAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGt > 1:46899/1‑144 (MQ=255) ccAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGt < 2:46899/144‑1 (MQ=255) cAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATc > 1:303761/1‑147 (MQ=255) aGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAg > 4:267601/1‑149 (MQ=255) gCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAggg < 2:212981/149‑1 (MQ=255) cGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTg > 5:174290/1‑149 (MQ=255) tCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGAt < 3:267601/149‑1 (MQ=255) atcaACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCAGGAGGCCTTCCGCAAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCt > 8:324173/1‑149 (MQ=255) tcaACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTg < 6:174290/149‑1 (MQ=255) accaccATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCCCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTg < 7:39452/144‑1 (MQ=255) accaccATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCCCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTg > 8:39452/1‑144 (MQ=255) accaTGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCt < 4:91217/149‑1 (MQ=255) tGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGaa < 5:94610/149‑1 (MQ=255) cgcACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGaaa < 4:246567/148‑1 (MQ=255) cgcACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGaaa < 4:99625/148‑1 (MQ=255) gCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctg > 7:274979‑M2/1‑97 (MQ=255) gCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctg < 8:274979‑M2/101‑5 (MQ=255) gCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTc > 4:346449/1‑149 (MQ=255) aCCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGAGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAACCCGCCTCGT‑Gc > 1:237940/1‑149 (MQ=255) ccGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑Gcc > 2:356315/1‑149 (MQ=255) ccGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑Gcc > 8:312411/1‑149 (MQ=255) cGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑Gcc > 7:70090/1‑148 (MQ=255) cTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGtt < 3:300546/149‑1 (MQ=255) tCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTc > 8:110811/1‑149 (MQ=255) tCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTc > 1:15055/1‑149 (MQ=255) tCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTc > 1:9353/1‑149 (MQ=255) aCGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGc < 8:115346/149‑1 (MQ=255) cGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGt < 1:217952/132‑1 (MQ=255) cGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGt > 2:217952/1‑132 (MQ=255) cGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCa < 7:312411/149‑1 (MQ=255) cGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCa < 1:356315/149‑1 (MQ=255) gCCCTCAGTGACTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGGTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCGGATCGGACGGGTGTAGCGGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTACTGCAgg > 8:340166/1‑146 (MQ=255) cccTCAGGGAGGGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCACGCGCGCCACGCCCGCGCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTc < 2:303761/147‑1 (MQ=255) ccTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAgc > 3:123403/1‑149 (MQ=255) cTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTgg > 6:269744/1‑112 (MQ=255) cTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTgg < 5:269744/112‑1 (MQ=255) agtgagtgCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCt > 4:80532/1‑149 (MQ=255) tgagtgCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTgg < 7:318934/149‑1 (MQ=255) gtgCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGcc < 7:324173/148‑1 (MQ=255) ccGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCt > 5:110751/1‑149 (MQ=255) ggAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTgg < 8:102586/149‑1 (MQ=255) ggAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTgg < 3:346449/149‑1 (MQ=255) aGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGa > 6:289595/1‑148 (MQ=255) gCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTc < 7:337140/120‑1 (MQ=255) gCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTc > 8:337140/1‑120 (MQ=255) cTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATcc > 6:1589/1‑149 (MQ=255) cTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATcc > 7:111846/1‑149 (MQ=255) cGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATcctcg < 2:47594/148‑1 (MQ=255) aCAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagggcatcgttgagcaccagcggtttgcgggtgcgcatggtggtg > 7:321152‑M2/1‑42 (MQ=255) aCAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagggcatcgttgagcaccagcggtttgcgggtgcgcatggtggtg < 8:321152‑M2/119‑78 (MQ=255) cTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCt < 2:339682/119‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCt > 1:339682/1‑119 (MQ=255) cTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCgcagg > 3:306106/1‑148 (MQ=255) gCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCAgctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagggcatcgttgagcaccagcggtttgcgggtgcgcatggtggtgttgatgaccgacaacggtgcctgggtcatgaacttc < 1:92739‑M2/149‑114 (MQ=255) cAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGc < 6:56253/149‑1 (MQ=255) aGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGCg < 2:15055/149‑1 (MQ=255) aGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGCg < 2:9353/149‑1 (MQ=255) cgcgcAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTCGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGCGgt < 1:107681/149‑1 (MQ=255) cgcAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagggcatcgttgagcaccagcggtttgcgggtgcgcatggtg < 3:215970‑M2/103‑75 (MQ=255) cgcAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagggcatcgttgagcaccagcggtttgcgggtgcgcatggtg > 4:215970‑M2/1‑29 (MQ=255) cgcAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGCGGTGTc < 5:289595/149‑1 (MQ=255) gcAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGCGGTGTCg < 1:183112/149‑1 (MQ=255) ccGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGCGGTGTCGCTACaaa > 7:319655/1‑149 (MQ=255) ccGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGCGGTGTCGCTACaaa < 3:80532/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGCGGTGTCGCTACAAACGGcc > 6:57420/1‑148 (MQ=255) cTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGCGGTGTCGCTACAAACGGCCAAGtt < 4:306106/149‑1 (MQ=255) tgtgCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGCGGTGTCGCTACAAACGGCCAAGTTc > 4:14194/1‑149 (MQ=255) cctgccGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGCg < 7:47659/121‑1 (MQ=255) cctgccGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGCg > 8:47659/1‑121 (MQ=255) ctgccGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTc > 8:279828/1‑72 (MQ=255) ctgccGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTc < 7:279828/72‑1 (MQ=255) gccGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAAc > 1:3901/1‑64 (MQ=255) gccGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAAc < 2:3901/64‑1 (MQ=255) ccGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGCGGTGTCGCTACAAACGGCCAAGTTCTACAcgcg > 5:357959/1‑149 (MQ=255) | GTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGT‑GCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGGCAGCGGTGTCGCTACAAACGGCCAAGTTCTACACGCG > NC_002947/5983354‑5983647 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |