New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 364566 = | 59 (1.070) | 3 (0.060) | 3/234 | NT | 5.4% | intergenic (‑33/+91) | PP_0303/caiX | dehydrocarnitine cleavage enzyme/carnitine uptake ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 364649 = | 51 (1.010) | intergenic (‑116/+8) | PP_0303/caiX | dehydrocarnitine cleavage enzyme/carnitine uptake ABC transporter substrate‑binding protein |
AGGGCGCAGGTGATGATGACGTCGTGGTTCATGGTGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTC > NC_002947/364502‑364791 | aGGGCGCAGGTGATGATGACGTCGTGGTTCATGGTGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAgg < 8:254090/149‑1 (MQ=255) gggCGCAGGTGATGATGACGTCGTGGTTCATGGTGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAggg < 5:121111/149‑1 (MQ=255) ggCGCAGGTGATGATGACGTCGTGGTTCATGGTGCAGTTCCTTGTGATGCTCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATAAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAggg > 1:84708/1‑149 (MQ=255) ggCGCAGGTGATGATGACGTCGTGGTTCATGGTGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGc < 1:164014/149‑1 (MQ=255) gaCGTCGTGGTTCATGGTGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCgg > 1:6003/1‑149 (MQ=255) gtGGTTCATGGTGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCt > 7:338620/1‑149 (MQ=255) gTTCATGGTGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCtt > 4:303441/1‑147 (MQ=255) gTTCATGGTGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGa < 4:328482/149‑1 (MQ=255) gTTCATGGTGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGa < 8:176485/149‑1 (MQ=255) ttCATGGTGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAg < 3:123766/149‑1 (MQ=255) aTGGTGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTg > 1:22667/1‑144 (MQ=255) aTGGTGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTg < 2:22667/144‑1 (MQ=255) aTGGTGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGtt > 3:67944/1‑149 (MQ=255) gTGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTc < 7:262704/149‑1 (MQ=255) tGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTcc > 5:282612/1‑149 (MQ=255) gCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTg > 6:285795/1‑127 (MQ=255) gCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTg < 5:285795/127‑1 (MQ=255) cTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCgg > 4:280301/1‑149 (MQ=255) cGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAgg > 7:305436/1‑125 (MQ=255) cGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAgg < 8:305436/125‑1 (MQ=255) tttgCTTTTTGGCGGGCTTGCACGATCCCACAGGATCAATGTTATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGTAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAggt < 2:117699/146‑1 (MQ=255) ttGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAggt > 3:277361/1‑149 (MQ=255) ggCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAggtgg > 2:266943/1‑149 (MQ=255) ggCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCAACAGGATCATTGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGTAGCGGGCTTGCCCGCGATAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAATCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAggtg < 2:185645/148‑1 (MQ=255) gCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCgg > 6:127335/1‑106 (MQ=255) gCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCgg < 5:127335/106‑1 (MQ=255) gCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCa < 2:7333/126‑1 (MQ=255) gCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCa > 1:7333/1‑126 (MQ=255) tttttCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTca > 4:239113/1‑149 (MQ=255) tttttCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTca > 2:60203/1‑149 (MQ=255) TTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTg > 3:106488‑M1/1‑98 (MQ=255) TTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTg < 4:106488‑M1/98‑1 (MQ=255) GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCt < 1:355190‑M1/149‑1 (MQ=255) GGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCaa > 4:21460‑M1/1‑149 (MQ=255) CATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGc > 3:303441‑M1/1‑149 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGc > 6:184531/1‑149 (MQ=255) gctcccacgggtacagcgccacactcgggatcacattgatcctgtgggagcgggcatgcccgcgaaaGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCggg > 3:79859‑M2/68‑149 (MQ=255) ctcccacgggtacagcgccacactcgggatcacattgatcctgtgggagcgggcatgcccgcgaaaGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGc > 7:245446‑M2/67‑149 (MQ=255) cTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGc < 3:239113/149‑1 (MQ=255) ccACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCtt < 1:60203/149‑1 (MQ=255) ccACAGGATCAATGTGATCCCGAGGGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCtt < 3:280301/149‑1 (MQ=255) cacgggtacagcgccacactcgggatcacattgatcctgtgggagcgggcatgcccgcgaaaGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTg < 8:245446‑M2/87‑1 (MQ=255) cacaGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCg < 5:49018/99‑1 (MQ=255) cacaGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCg > 6:49018/1‑99 (MQ=255) acaGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGc > 5:257322/1‑85 (MQ=255) acaGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGc < 6:257322/85‑1 (MQ=255) gATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTc > 2:106553/1‑149 (MQ=255) tCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCgg < 6:282612/149‑1 (MQ=255) tCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCgg > 3:36575/1‑149 (MQ=255) aaTGTGATCCCGAGTGTGGCGCGGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCggg < 8:205480/148‑1 (MQ=255) tgtgATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTGAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGggtg < 1:106553/149‑1 (MQ=255) tgtgATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGggtg < 2:286463/149‑1 (MQ=255) cGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCtt > 1:96776/1‑147 (MQ=255) cGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGa < 4:36575/149‑1 (MQ=255) gtgGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCAc > 6:312090/1‑149 (MQ=255) cgcTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGc < 2:96776/149‑1 (MQ=255) tACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCggg < 2:84708/147‑1 (MQ=255) tACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCt < 1:266943/149‑1 (MQ=255) cccGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGa > 1:1971/1‑149 (MQ=255) ccGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGAt < 4:277361/149‑1 (MQ=255) gTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTc < 2:76184/149‑1 (MQ=255) tGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTc > 8:150354/1‑148 (MQ=255) gggAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTc > 8:31438/1‑147 (MQ=255) ggCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTc < 3:85056/149‑1 (MQ=255) ttGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCtt < 4:67944/149‑1 (MQ=255) cccgcgaaaGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTCTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTtgtg < 5:312090‑M2/140‑1 (MQ=255) gcgaaaGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTc > 8:158126‑M2/7‑149 (MQ=255) | AGGGCGCAGGTGATGATGACGTCGTGGTTCATGGTGCAGTTCCTTGTGATG‑TCGGTGTTGGCTTTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGATCAATGTGATCCCGAGTGTGGCGCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTC > NC_002947/364502‑364791 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |