New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1260815 | 31 (0.560) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 8.8% | coding (636/2451 nt) | PP_1103 | DEAD box family ATP‑dependent helicase |
? | NC_002947 | = 1260846 | 33 (0.640) | coding (605/2451 nt) | PP_1103 | DEAD box family ATP‑dependent helicase |
GCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCA > NC_002947/1260702‑1260989 | gCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAgc < 6:103923‑M2/147‑3 (MQ=255) aTCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAgcaaga < 8:7669‑M2/149‑7 (MQ=255) aTCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAgcaaga < 3:329338‑M2/149‑7 (MQ=255) cGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAgcaagac < 1:342701‑M2/148‑8 (MQ=255) tcGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCcg > 8:143916/1‑149 (MQ=255) gTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCcgtg > 1:137301/1‑149 (MQ=255) tGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCcgtgc < 4:329338/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACAt > 5:183682/1‑136 (MQ=255) aCCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACAt < 6:183682/136‑1 (MQ=255) gTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAgg < 7:7669/148‑1 (MQ=255) gTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAg < 2:137301/147‑1 (MQ=255) gTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGt > 7:29813/1‑149 (MQ=255) cGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGc > 3:27236/1‑143 (MQ=255) cGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGc < 4:27236/143‑1 (MQ=255) gAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGc > 4:254979/1‑149 (MQ=255) cAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAgg < 7:312593/145‑1 (MQ=255) cAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAgg < 7:8040/145‑1 (MQ=255) gCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGcc > 3:245071/1‑148 (MQ=255) aTGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACaa < 2:342701/149‑1 (MQ=255) tCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGccc < 4:245071/148‑1 (MQ=255) cAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCa < 8:60816/148‑1 (MQ=255) gCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGt < 7:143916/149‑1 (MQ=255) gggAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAg > 7:307312/1‑149 (MQ=255) gggAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAg < 5:103923/149‑1 (MQ=255) cTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGt > 2:165952/1‑149 (MQ=255) cTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTc > 1:287184/1‑128 (MQ=255) cTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTc < 2:287184/128‑1 (MQ=255) cTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGGCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGc > 6:232427/1‑149 (MQ=255) gcagcaGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAgg < 8:29813/149‑1 (MQ=255) gCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTg > 3:292725/1‑148 (MQ=255) aGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAg < 4:292725/149‑1 (MQ=255) ccTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAgcaagacaaggcactgcaagtcgacaccctgctgccaaaagcgatcgagcgcttcccttgggctggacacatgggcctgaagatgctcgaccaggtctgtcacg > 4:127095‑M2/1‑42 (MQ=255) ccTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAgcaagacaaggcactgcaagtcgacaccctgctgccaaaagcgatcgagcgcttcccttgggctggacacatgggcctgaagatgctcgaccaggtctgtcacg < 3:127095‑M2/146‑105 (MQ=255) ttGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAgcaagacaaggcactgcaagtcgacaccctgctgccaaaagcgatcgagcgcttcccttgggctggacacatgggcctgaagatgctcgaccaggtctgtcac < 6:172047‑M2/143‑104 (MQ=255) gCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCgcgc > 2:237316/1‑149 (MQ=255) cGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAgg > 1:129270/1‑124 (MQ=255) cGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCtt > 4:46600/1‑149 (MQ=255) cGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGGTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCTATGCCGCAGGCGCGCCAAgg < 2:129270/124‑1 (MQ=255) ccTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCttgtt < 3:254979/149‑1 (MQ=255) aCCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAag > 2:89482/1‑149 (MQ=255) aCCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAag > 5:243142/1‑149 (MQ=255) cagcagGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAag > 3:248040/1‑147 (MQ=255) gcagGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAagcagc < 1:165952/149‑1 (MQ=255) gggCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCa < 6:243142/148‑1 (MQ=255) gcagcaAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGc < 6:302645/140‑1 (MQ=255) gcagcaAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGc > 5:302645/1‑140 (MQ=255) | GCATCGATCTCGTGACAGACCTGGTCGAGCATCTTCAGGCCCATGTGTCCAGCCCAAGGGAAGCGCTCGATCGCTTTTGGCAGCAGGGTGTCGACTTGCAGTGCCTTGTCTTGCCGGCCTTGCACCAGCAGGCCGCCCTGGGGCAGCAAGACATCCCGTGCGTGTTGCAGGTTGCCGAGGGTTGCCGACAAGCCCCAGGTCGGTAGGCCCGGGTGCCAATGCCGCAGGCGCGCCAAGGCCAGCTGCAGTTGTACCCCGCGCTTGTTGCCAAGCAGCTCGTGCCATTCA > NC_002947/1260702‑1260989 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |