New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4400544 = | 42 (0.760) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 8.9% | coding (614/1272 nt) | PP_3879 | HK97 family portal protein |
? | NC_002947 | 4400580 = | 42 (0.790) | coding (578/1272 nt) | PP_3879 | HK97 family portal protein |
GTTGTCGATCCCCGAGAACTTGTTGCCCCACTGATCGAGGATGCGGTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATGGGTAGCGGGTCGTGCCCACCAACCCGGTAGACGGGGAGCAAAT > NC_002947/4400435‑4400727 | gTTGTCGATCCCCGAGAACTTGTTGCCCCACTGATCGAGGATGCGGTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTca > 2:339333/1‑149 (MQ=255) gTTGTCGATCCCCGAGAACTTGTTGCCCCACTGATCGAGGATGCGGTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTc > 4:241318/1‑148 (MQ=255) gTTGTCGATCCCCGAGAACTTGTTGCCCCACTGATCGAGGATGCGGTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTc < 3:241318/148‑1 (MQ=255) ttGTCGATCCCCGAGAACTTGTTGCCCCACTGATCGAGGATGCGGTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTcac < 2:289934/149‑1 (MQ=255) cccatgcggctgattcatcatgtgcgctggcacacgaagaaccattacaccggcctctctccggttgagctgcacgccgatgccgtaggcctggcgcaggctgtgagGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTcaca > 7:29941‑M1/108‑149 (MQ=255) tCGATCCCCGAGAACTTGTTGCCCCACTGATCGAGGATGCGGTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGc < 7:305986/149‑1 (MQ=255) gATCCCCGAGAACTTGTTGCCCCACTGATCGAGGATGCGGTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCt > 5:250370/1‑149 (MQ=255) cccGAGAACTTGTTGCCCCACTGATCGAGGATGCGGTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTgcgc < 7:291938/149‑1 (MQ=255) gagaACTTGTTGCCCCACTGATCGAGGATGCGGTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAg < 3:352334/149‑1 (MQ=255) gagaACTTGTTGCCCCACTGATCGAGGATGCGGTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCT‑AATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCCCAGCCTGCGCCAgc > 8:294460/1‑148 (MQ=255) tcatcatgtgcgctggcacacgaagaaccattacaccggcctctctccggttgagctgcacgccgatgccgtaggcctggcgcaggctgtgagGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTca > 8:274661‑M1/94‑133 (MQ=255) tcatcatgtgcgctggcacacgaagaaccattacaccggcctctctccggttgagctgcacgccgatgccgtaggcctggcgcaggctgtgagGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTca < 7:274661‑M1/40‑1 (MQ=255) gttgCCCCACTGATCGAGGATGCGGTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACg < 2:7251/148‑1 (MQ=255) cccACTGATCGAGGATGCGGTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCg < 2:215798/149‑1 (MQ=255) ggATGCGGTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGAGTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGGGGAGCta > 6:41914/1‑147 (MQ=255) cGGTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCgg < 6:250370/149‑1 (MQ=255) gTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCg > 8:274292/1‑146 (MQ=255) cTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGc < 1:2279/148‑1 (MQ=255) tCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATg > 8:98743/1‑149 (MQ=255) ccTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGgt > 3:161755/1‑142 (MQ=255) ccTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGgt < 4:161755/142‑1 (MQ=255) cTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCGATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGt > 2:225235/1‑149 (MQ=255) cTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCTCCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATg < 4:154683/147‑1 (MQ=255) cTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATc > 7:210334/1‑111 (MQ=255) cTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATc < 8:210334/111‑1 (MQ=255) cTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGc < 8:99774/137‑1 (MQ=255) cTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGc > 7:99774/1‑137 (MQ=255) cTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGt > 5:164189/1‑149 (MQ=255) ttGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGttcttc < 7:706/149‑1 (MQ=255) cGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCgtgt > 4:275673/1‑149 (MQ=255) gcgcTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGAGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACatgat < 5:41914/149‑1 (MQ=255) gcTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAACTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACatga > 5:78829/1‑146 (MQ=255) gcTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAACTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACatga < 6:78829/146‑1 (MQ=255) tCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATg > 7:332154/1‑119 (MQ=255) tCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATg < 8:332154/119‑1 (MQ=255) tCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTAAACCGGAGACAGCCCGGTGTACTGGTTCTTCGAGTGCCAGCGCACATGATGaa > 4:224013/1‑148 (MQ=255) aaTGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCa < 6:164189/149‑1 (MQ=255) ccacTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCa < 7:249881/125‑1 (MQ=255) ccacTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCa > 8:249881/1‑125 (MQ=255) cacTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATg > 5:212669/1‑149 (MQ=255) tgtgaggcagtacgcgggcaagtcatttgccaacggcactgcCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATggg > 7:29941‑M2/43‑149 (MQ=255) cTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATggg < 7:98743/149‑1 (MQ=255) tgaggcagtacgcgggcaagtcatttgccaacggcactgcCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACAtgatga < 7:274661‑M2/93‑1 (MQ=255) tgaggcagtacgcgggcaagtcatttgccaacggcactgcCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACAtgatga > 8:274661‑M2/41‑133 (MQ=255) aCCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATGGGTAg < 1:225235/149‑1 (MQ=255) GCAGTGCCGTTGGCAATTGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATGGGTAGCgg > 7:294460‑M1/1‑149 (MQ=255) aaaTGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATGGGTAGCGGGTCGTGCCCACCaa > 6:115736/1‑149 (MQ=255) aaaTGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATGGGTAGCGGGTCGTGCCCACCaa > 2:163487/1‑149 (MQ=255) aTGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATGGGTAGCGGGTCGTGCCCACCAAcc < 7:274292/149‑1 (MQ=255) cTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATGGGTAGCGGGTCGTGCCCACCAACCCgg > 1:15781/1‑148 (MQ=255) gccaacggcactgcCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATGGGTAGCGGGTCGTGCCCACCAACCCGGTa < 8:29941‑M2/134‑1 (MQ=255) cccGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATGGGTAGCGGGTCGTGCCCACCAACCCGGTAGa < 3:275673/148‑1 (MQ=255) ccGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCgg > 4:278517/1‑69 (MQ=255) ccGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCgg < 3:278517/69‑1 (MQ=255) cgcgTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATGGGTAGCGGGTCGTGCCCACCAACCCGGTAGACgg < 6:212669/149‑1 (MQ=255) cgcgTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATGGGTAGCGGGTCGTGCCCACCAACCCGGTAGACgg < 1:339333/149‑1 (MQ=255) gTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATGGGTAGCGGGTCGTGCCCACCAACCCGGTAGACGGGGa < 1:163487/149‑1 (MQ=255) cCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATGGGTAGCGGGTCGTGCCCACCAACCCGGTAGACGGGGAGCAAAt > 4:341768‑M2/2‑149 (MQ=255) | GTTGTCGATCCCCGAGAACTTGTTGCCCCACTGATCGAGGATGCGGTCAATACTGGACTGCTCCTTGATTGGCGGTGCCTCTTTCGGGCGCTCAATGACACCACTCACCGCAGTGCCGTTGGCAAATGACTTGCCCGCGTACTGCCTCACAGCCTGCGCCAGGCCTACGGCATCGGCGTGCAGCTCAACCGGAGAGAGGCCGGTGTAATGGTTCTTCGTGTGCCAGCGCACATGATGAATCAGCCGCATGGGTAGCGGGTCGTGCCCACCAACCCGGTAGACGGGGAGCAAAT > NC_002947/4400435‑4400727 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |