| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5982220 = | 53 (0.960) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 5.0% | coding (2865/5049 nt) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
| ? | NC_002947 | 5982264 = | 63 (1.190) | coding (2909/5049 nt) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase | |||||
TGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGATTCGCTGTTCATGGGCCGCTACCTGCCGGACGTG > NC_002947/5982117‑5982412 | tggttgcaggcatagcagctcatcgccaggtcaccgctcaggcgcgccgagtcgaccgcgtccagcgcggtacgtcgggcgaattccatgggcgaggtccaggCGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGcc > 5:98090‑M1/104‑149 (MQ=255) gCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCt < 2:130137/148‑1 (MQ=255) cTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGTCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGa < 5:282098/149‑1 (MQ=255) tGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGAc > 8:322094/1‑149 (MQ=255) gTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCt > 4:322279/1‑149 (MQ=255) cGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGc < 7:152267/149‑1 (MQ=255) cGAGCGTTTTGGCTCTTACCATTATGGCCATGCGTGTTGACTGGCCGCGCTCAAGCTGATCCCACGGCACCGGTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTCGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGccc < 7:151464/149‑1 (MQ=255) cGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGccc > 8:315569/1‑149 (MQ=255) cGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGccc > 6:189154/1‑149 (MQ=255) gCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGAc < 7:322094/149‑1 (MQ=255) cgcTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTGCCgcgc < 3:322279/149‑1 (MQ=255) cgcTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCgcgc > 3:69365/1‑149 (MQ=255) cTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTAcc < 7:278364/143‑1 (MQ=255) cTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTAcc > 8:278364/1‑143 (MQ=255) aCCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGAc > 7:295201/1‑149 (MQ=255) ccATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGAc < 8:295201/148‑1 (MQ=255) cATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGcc < 2:47035/129‑1 (MQ=255) tgatgGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATg > 3:229105/1‑118 (MQ=255) tgatgGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATg < 4:229105/118‑1 (MQ=255) tgatgGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCgg < 7:4742/149‑1 (MQ=255) gatgGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGt < 7:315569/149‑1 (MQ=255) atgGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTc < 5:104487/149‑1 (MQ=255) cTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGgcgc < 3:117632/149‑1 (MQ=255) gTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGgcgcgc > 3:39042/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCt > 8:101556/1‑147 (MQ=255) tGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGc > 8:149199/1‑93 (MQ=255) tGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGc < 7:149199/93‑1 (MQ=255) aaGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGc < 7:101556/149‑1 (MQ=255) gCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGa > 3:310719/1‑149 (MQ=255) cTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGa < 8:179424/96‑1 (MQ=255) cTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGa > 7:179424/1‑96 (MQ=255) aTCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGa < 4:69365/148‑1 (MQ=255) gAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGAt > 8:77765/1‑143 (MQ=255) gAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGAt < 7:77765/143‑1 (MQ=255) gAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAgctg > 2:162917/1‑149 (MQ=255) gCAGGGTTTCGACGGTGTTCTGACCAGGGCGGTGCTGGCCCTGGATAAGGTCAGGGCCTGGACCTCGCCCATGTAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAg < 6:230265/141‑1 (MQ=255) gCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACcgcg < 5:251148/94‑1 (MQ=255) gCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACcgcg > 6:251148/1‑94 (MQ=255) gCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCTCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAg > 5:230265/1‑141 (MQ=255) tttCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGc > 3:307135/1‑148 (MQ=255) tttCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGc > 7:163910/1‑148 (MQ=255) ttCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGAACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCaa > 6:52134/1‑149 (MQ=255) tCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCaa < 5:189154/148‑1 (MQ=255) ggcgctgacctgatccagggccagcagcgcgctggtcagatcagcgCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAacca > 5:98090‑M2/47‑149 (MQ=255) gACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGAcgcg < 5:62940/93‑1 (MQ=255) gACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGAcgcg > 6:62940/1‑93 (MQ=255) gACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAacca > 1:285202/1‑149 (MQ=255) aCGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGAc < 2:346064/119‑1 (MQ=255) aCGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGAc > 1:346064/1‑119 (MQ=255) aCGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGAACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAaccac < 5:52134/149‑1 (MQ=255) GCTGATCTGAACAGCGTGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCctgcaacgccct < 4:57425‑M1/149‑6 (MQ=255) ATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGtt < 5:293026‑M1/149‑1 (MQ=255) gatccagggccagcagcgcgctggtcagatcagcgCCTGGACCTCGCCCAt < 6:148885‑M2/16‑1 (MQ=255) gatccagggccagcagcgcgctggtcagatcagcgCCTGGACCTCGCCCAt > 5:148885‑M2/36‑51 (MQ=255) aCCAGCGCGCTGCTGGCCCGCGATCAGGGCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGCCGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTc < 6:293026/146‑1 (MQ=255) cAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGAtt > 5:292375/1‑149 (MQ=255) cAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGAtt > 6:276937/1‑149 (MQ=255) aGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGTAATTCGCCCGACGTACGGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGATTc < 1:162917/149‑1 (MQ=255) aGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGATTc > 2:304038/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGATTCGCt < 8:163910/149‑1 (MQ=255) cgcTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGATTCGCTg < 5:276937/149‑1 (MQ=255) cgcTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGATTCGCTg > 4:187111/1‑149 (MQ=255) tgctgGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTgg < 1:123461/102‑1 (MQ=255) tgctgGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTgg > 2:123461/1‑102 (MQ=255) gCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGATTCGCTGTTCATggg > 3:75948/1‑149 (MQ=255) cccTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGATTCGCTGTTCATGGGc < 1:304038/149‑1 (MQ=255) ccTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGt < 7:154449/126‑1 (MQ=255) ccTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGCACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGt > 8:154449/1‑126 (MQ=255) cTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGATTCGCTGTTCATGGGCCg > 1:154766/1‑149 (MQ=255) aTCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGATTCGCTGTTCATGGGCCGCTAc < 2:154766/149‑1 (MQ=255) ggTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCgcgc < 3:25596/47‑1 (MQ=255) ggTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCgcgc > 4:25596/1‑47 (MQ=255) ggTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGATTCGCTGTTCATGGGCCGCTACCTGc > 1:168296/1‑149 (MQ=255) gcgCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGATTCGCTGTTCATGGGCCGCTACCTGCCGGAc < 6:292375‑M2/146‑1 (MQ=255) ccTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGATTCGCTGTTCATGGGCCGCTACCTGCCGGACGTg < 4:310719/149‑1 (MQ=255) | TGGCCTGGTACGGCGTGATGATTGCCGAGCGTTTTGGCGCTTACCATGATGGCCATGCCTGTTGCCTGGCCGCGCTCAAGCTGATCGAACGGCACGGTTTCGACGCTGATCTGACCAGCGCGCTGCTGGCCCTGGATCAGGTCAGCGCCTGGACCTCGCCCATGGAATTCGCCCGACGTACCGCGCTGGACGCGGTCGACTCGGCGCGCCTGAGCGGTGACCTGGCGATGAGCTGCTATGCCTGCAACCACCTGGTTTCAGATTCGCTGTTCATGGGCCGCTACCTGCCGGACGTG > NC_002947/5982117‑5982412 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |