New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6161701 = | 25 (0.450) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 9.8% | coding (109/312 nt) | PP_5403 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 6161732 = | 31 (0.580) | coding (140/312 nt) | PP_5403 | hypothetical protein |
TGATGAAAATCACTGGTCGTGTAGAAACGGAAGCGGTGGTCGACGTGAGCTGCGACGTATGCGGCTCCTCCACACGTTTGGAAACCGGCAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTGAAGGTGATCCACAGCAGCCCGAGGATGACTTCGGCCTCGCTTCCAGG > NC_002947/6161597‑6161877 | accttgaaacatgttggttatgcgccgctcttgcttgaggtaagcgatggtctggaagaagcaaggttcacataggtgcgcctcatagcgctctccgtcatgcaGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGgaga > 4:182080‑M1/105‑148 (MQ=255) acatgttggttatgcgccgctcttgcttgaggtaagcgatggtctggaagaagcaaggttcacataggtgcacctcatagcgctctccgtcatgcaGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGc > 2:262520‑M1/97‑130 (MQ=255) acatgttggttatgcgccgctcttgcttgaggtaagcgatggtctggaagaagcaaggttcacataggtgcacctcatagcgctctccgtcatgcaGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGc < 1:262520‑M1/34‑1 (MQ=255) ggAAGCGGTGGTCGACGTGAGCTGCGACGTATGCGGCTCCTCCACACGTTTGGAAACCGGCAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCtt > 7:187156/1‑149 (MQ=255) gCGGTGGTCGACGTGAGCTGCGACGTATGCGGCTCCTCCACACGTTTGGAAACCGGCAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGctt > 8:3783/1‑149 (MQ=255) tggtCGACGTGAGCTGCGACGTATGCGGCTCCTCCACACGTTTGGAAACCGGCAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCttcttc < 7:3783/149‑1 (MQ=255) tCGACGTGAGCTGCGACGTATGCGGCTCCTCCACACGTTTGGAAACCGGCAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCttcttc > 6:336427/1‑146 (MQ=255) gACGTGAGCTGCGACGTATGCGGCTCCTCCACACGTTTGGAAACCGGCAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGgaga > 3:83950/1‑107 (MQ=255) gACGTGAGCTGCGACGTATGCGGCTCCTCCACACGTTTGGAAACCGGCAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGgaga < 4:83950/107‑1 (MQ=255) aGCTGCGACGTATGCGGCTCCTCCACACGTTTGGAAACCGGCAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCg < 5:336427/148‑1 (MQ=255) tGCGGCTCCTCCACACGTTTGGAAACCGGCAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTAt < 1:297161/109‑1 (MQ=255) tGCGGCTCCTCCACACGTTTGGAAACCGGCAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTAt > 2:297161/1‑109 (MQ=255) ggCTCCTCCACACGTTTGGAAACCGGCAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTcaagcaa > 4:266684/1‑147 (MQ=255) ccACACGTTTGGAAACCGGCAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAgcggcg > 4:244462/1‑148 (MQ=255) tttGGAAACCGGCAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAAcc > 6:199964/1‑148 (MQ=255) ggAAACCGGCAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACa > 7:235320/1‑149 (MQ=255) cAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTGAAg < 3:266684/149‑1 (MQ=255) tctccgtcatgcagtgcaccaaagccccagtgcgcgtggagcacTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGCGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTCAAGGt > 4:182080‑M2/45‑148 (MQ=255) tCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTGAAGGt > 5:203777/1‑148 (MQ=255) ttCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGAACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCATACCATCGC‑GAACTCAAGGAAGAGCGGCGGCTTAGCAACATGTTTGAATGTGATc > 6:336607/1‑149 (MQ=255) tCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGt < 5:218461/137‑1 (MQ=255) tCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGt > 6:218461/1‑137 (MQ=255) aGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTGAAGGTGATcc < 8:187156/148‑1 (MQ=255) aGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATCACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCAACGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTATGAAGGTGATCca > 3:148637/1‑149 (MQ=255) gTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTGAAGGTGATCcac > 5:63053/1‑149 (MQ=255) gcagtgcaccaaagccccagtgcgcgtggagcacTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGt < 1:262520‑M2/96‑1 (MQ=255) gcagtgcaccaaagccccagtgcgcgtggagcacTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGt > 2:262520‑M2/35‑130 (MQ=255) ggTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTGAAGGTGATCCACagcagc > 5:236884/1‑149 (MQ=255) CTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTGAAGGTGATCCACAGCAGCCCGa > 5:199964‑M1/1‑149 (MQ=255) ccACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTGAAGGTGATCCACAGCAGCCCGAg > 2:132332/1‑148 (MQ=255) cACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTGAAGGTGATCCACAGCAGCCCGAgg < 6:203777/148‑1 (MQ=255) aCGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGt < 5:310209/120‑1 (MQ=255) aCGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGt > 6:310209/1‑120 (MQ=255) aCGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTGAAGGTGATCCACAGCAGCCCGAGGAt < 8:235320/149‑1 (MQ=255) aCGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTGAAGGTGATCCACAGCAGCCCGAGGAt > 8:62467/1‑149 (MQ=255) gcgcACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTGAAGGTGATCCACAGCAGCCCGAGGATGa < 6:63053/149‑1 (MQ=255) aCTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTGAAGGTGATCCACAGCAGCCCGAGGATGACTTc > 7:320798/1‑149 (MQ=255) gggCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCaa < 6:72401/105‑1 (MQ=255) ggTGCACTGCATGACGGATAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGtt < 7:268178/104‑1 (MQ=255) ggTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGtt > 8:268178/1‑104 (MQ=255) acTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTGAAGGTGATCCACAGCAGCCCGAGGATGACTTCGGCCTCGCTTCCAgg > 2:331717‑M2/3‑148 (MQ=255) | TGATGAAAATCACTGGTCGTGTAGAAACGGAAGCGGTGGTCGACGTGAGCTGCGACGTATGCGGCTCCTCCACACGTTTGGAAACCGGCAGTCTTCAGTATGGGGTGCTCCACGCGCACTGGGGCTTTGGTGCACTGCATGACGGAGAGCGCTATGAGGTGCACCTATGTGAACCTTGCTTCTTCCAGACCATCGCTTACCTCAAGCAAGAGCGGCGCATAACCAACATGTTTGAAGGTGATCCACAGCAGCCCGAGGATGACTTCGGCCTCGCTTCCAGG > NC_002947/6161597‑6161877 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |