New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 606408 | 40 (0.760) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 7.8% | coding (236/744 nt) | PP_0521 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 606463 | 33 (0.660) | coding (291/744 nt) | PP_0521 | hypothetical protein |
TTAGCGAGGAGTGGCTCGACTACACCAACGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACATGGACCATATCTATGCCCTGGGGCTGGCCAGCAAACCTGTGCCTACCCTGGAGACCATCGGCAAGTACCGGTT > NC_002947/606264‑606555 | ttAGCGAGGAGTGGCTCGACTACACCAACGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAg < 1:347488/149‑1 (MQ=255) tAGCGAGGAGTGGCTCGACTACACCAACGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAgg > 8:244579/1‑149 (MQ=255) gagTGGCTCGACTACACCAACGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGc > 5:281127/1‑149 (MQ=255) gagTGGCTCGACTACACCAACGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGc < 4:29484/149‑1 (MQ=255) gCTCGACTACACCAACGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTgg < 6:219611/148‑1 (MQ=255) aCTACACCAACGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGc < 8:240008/149‑1 (MQ=255) aCTACACCAACGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGc < 2:276543/149‑1 (MQ=255) tACACCAACGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTc < 2:232183/149‑1 (MQ=255) tctaaCGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGt < 5:257537/145‑1 (MQ=255) acCAACGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTa > 4:68814/1‑149 (MQ=255) ccAACGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGAGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTa > 8:280355/1‑148 (MQ=255) cAACGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTAc > 8:48130/1‑148 (MQ=255) aCGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGt > 6:257537/1‑144 (MQ=255) cGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAgg < 1:158981/149‑1 (MQ=255) cGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAgg < 7:244579/149‑1 (MQ=255) ccGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGaa < 6:281127/149‑1 (MQ=255) ccGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGGTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGaa < 2:47939/149‑1 (MQ=255) gTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAac < 5:297326/149‑1 (MQ=255) gggTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAAcgacga > 1:222114/1‑148 (MQ=255) ggTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAAcgacga < 4:154442/147‑1 (MQ=255) tGGCCTGGGATGTGCTGCGCATAGTGTTCGAGCCGGCCGGACTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAAc < 5:305369/149‑1 (MQ=255) tGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAAc < 7:48130/149‑1 (MQ=255) ggATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAAcc > 2:224887/1‑143 (MQ=255) ggATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAAcc < 1:224887/143‑1 (MQ=255) gATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACcc < 6:214177‑M2/149‑3 (MQ=255) gcgcAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACccgc > 6:268368‑M2/1‑139 (MQ=255) gcgcAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGACCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACccgcgagatc < 5:268368‑M2/149‑11 (MQ=255) cgcAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGgtacaggttgtcgtcgttctcttccttgtacgagccaacccaggcatcagcctcgccgcgcttga < 3:30945‑M1/148‑66 (MQ=255) cgcAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGc < 2:222114/148‑1 (MQ=255) cgcAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCa > 6:213952/1‑149 (MQ=255) cAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGgtacaggttgtcgtcgttctcttccttgtacgagccaacccaggcatcagcctcgccgcgc < 1:190688‑M1/142‑62 (MQ=255) cAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGgtacaggttgtcgtcgttctcttccttgtacgagccaacccaggcatcagcctcgccgcgc > 2:190688‑M1/1‑81 (MQ=255) cAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACt > 4:231735/1‑149 (MQ=255) aaGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTc < 7:280355/149‑1 (MQ=255) ttCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACAt < 3:231735/149‑1 (MQ=255) ttCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACAt > 1:325263/1‑149 (MQ=255) aGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACATGGAc < 2:94828/149‑1 (MQ=255) ccggccggAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACATGGACCa < 5:214177/149‑1 (MQ=255) ggtggtTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACATg < 2:120064/130‑1 (MQ=255) ccAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACATGGACCATATCTATGCCCTGGGGCTGGc > 7:292925/1‑147 (MQ=255) ccAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACATGGACCATATCTATGCCCTGGGGCTGGCCa < 5:213952/149‑1 (MQ=255) cccTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACATGGACCATATCTATGCCCTGGGGCTGGCCAGCAAACCtgt < 3:68814/149‑1 (MQ=255) cccTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACATGGACCATATCTATGCCCTGGGGCTGGCCAGCAAACCtgt < 8:292925/149‑1 (MQ=255) tACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACATGGACCATATCTATGCCCTGGGGCTGGCCAGCAAACCtgtg < 5:354407/147‑1 (MQ=255) tACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACATGGACCATATCTATGCCCTGGGGCTGGCCAGCAAACCtgtg > 6:354407/1‑147 (MQ=255) cGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACATGGACCATATCTATGCCCTgggg > 2:223398/1‑123 (MQ=255) cGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACATGGACCATATCTATGCCCTgggg < 1:223398/123‑1 (MQ=255) tCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACccgcgcttgaccaggccaaccgcccggctgtagggcgcgctctgggtaaccaccttgactccggccggctcgaacactttgcg < 3:30945‑M2/148‑84 (MQ=255) gatctcgcgggtacaggttgtcgtcgttctcttccttgtacgagccaacccaggcatcagcctcgccgcgcttgaccaggccaaccgcccggctgtaggtcgcgctctgggtaaccaccttgactccggccggctcgaacactttgcgc < 5:268368‑M1/144‑140 (MQ=255) aGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACATGGACCATATCTATGCCCTGGGGCTGGCCAGCAAACCTGTGCCTACCCTGGAGACCATCGGCAAGTAc > 1:35489/1‑149 (MQ=255) gcgcGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACccgcgcttgaccaggccaaccgcccggctgtagggcgcgctctgggtaaccaccttgactccggccggctcgaacactttg > 2:190688‑M2/1‑61 (MQ=255) gcgcGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACccgcgcttgaccaggccaaccgcccggctgtagggcgcgctctgggtaaccaccttgactccggccggctcgaacactttg < 1:190688‑M2/142‑82 (MQ=255) gcgGgtacaggttgtcgtcgttctcttccttgtacgagccaacccaggcatcagcctcgccgcgcttgaccaggccaaccgcccggctgtagggcgcgctctgggtaaccaccttgactccggccggctcgaacactttgcgc > 6:268368‑M1/1‑4 (MQ=255) gggtacaggttgtcgtcgttctcttccttgtacgagccaacccaggcatcagcctcgccgcgcttgaccaggccaaccgcccggctgtagggcgcgctctgggtaaccaccttgactccggccggctcgaacactttgcgcagcacatc < 6:214177‑M1/149‑148 (MQ=255) | TTAGCGAGGAGTGGCTCGACTACACCAACGCCGACGGTACCGGGGTGGCCTGGGATGTGCTGCGCAAAGTGTTCGAGCCGGCCGGAGTCAAGGTGGTTACCCAGAGCGCGCCCTACAGCCGGGCGGTTGGCCTGGTCAAGCGCGGCGAGGCTGATGCCTGGGTTGGCTCGTACAAGGAAGAGAACGACGACAACCTGTACCCGCGCTGGCACTTCGACATGGACCATATCTATGCCCTGGGGCTGGCCAGCAAACCTGTGCCTACCCTGGAGACCATCGGCAAGTACCGGTT > NC_002947/606264‑606555 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |