New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 928888 = | 55 (1.040) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 6.3% | coding (16734/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | 928940 = | 38 (0.760) | coding (16682/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
GATGACCGGCGCGTTGGCATCCACATCCGGTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAG > NC_002947/928741‑929019 | gctcagcgtcaccctcaccgacagcgccggtaatgtgtccacaggcactgcgctgaccgcaccggacctgaccccgcccgcggctgccggcaacctgctgttcagtgccgacggcggtaccctcaccggtactggcgaagtgggtgcCa > 8:257289‑M1/148‑149 (MQ=255) gATGACCGGCGCGTTGGCATCCACATCCGGTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCa > 4:35595/1‑149 (MQ=255) gcgcGTTGGCATCCACATCCGGTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTcgcg < 3:35595/149‑1 (MQ=255) ggCATCCACATCCGGTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTgc < 2:255970/148‑1 (MQ=255) gCATCCACATCCGGTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTgca < 7:296337/148‑1 (MQ=255) aTCCACATCCGGTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTgcagca > 2:209249/1‑149 (MQ=255) aTCCACATCCGGTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTgcagca > 8:231527/1‑149 (MQ=255) cacaTCCGGTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACgg > 4:99694/1‑149 (MQ=255) acaTCCGGTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACgg > 7:140458/1‑148 (MQ=255) caTCCGGTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCt < 4:23947/138‑1 (MQ=255) caTCCGGTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCt > 3:23947/1‑138 (MQ=255) caTCCGGTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTa > 3:188272/1‑149 (MQ=255) ccGGTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTg > 6:203541/1‑136 (MQ=255) ccGGTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTg < 5:203541/136‑1 (MQ=255) ggTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTAccgcc < 1:209249/149‑1 (MQ=255) ggTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTAccgcc < 7:231527/149‑1 (MQ=255) tGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCgg < 4:188272/149‑1 (MQ=255) tgacgttgacgtTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTgc > 7:190494/1‑128 (MQ=255) tgacgttgacgtTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTgc < 8:190494/128‑1 (MQ=255) gtccacaggcactgcgctgaccgcaccggacctgaccccgcctgcggctgccggcaacctgctgttcagtgccgacggcggtaccctcaccggtactggcgaagtgggtgcCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGc < 6:182309‑M1/38‑1 (MQ=255) tgacgttgCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTgc > 1:197165/1‑122 (MQ=255) tgacgttgCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTgc < 2:197165/122‑1 (MQ=255) acgttgCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTacgg < 8:140458/148‑1 (MQ=255) gCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTacggtgacgg > 5:244798/1‑149 (MQ=255) cgctgaccgcaccggacctgaccccgcctgcggctgccggcaacctgctgttcagtgccgacggcggtaccctcaccggtactggcgaagtgggtgcCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTacggtgacgg > 5:182309‑M1/98‑147 (MQ=255) ccGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTacggtgacggtg > 3:205922/1‑149 (MQ=255) gaccgcaccggacctgaccccgcctgcggctgccggcaacctgctgttcagtgccgacggcggtaccctcaccggtactggcgaagtgggtgcCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCAc > 3:102672‑M1/94‑149 (MQ=255) ccGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTc > 8:80665/1‑149 (MQ=255) ccGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTc > 5:40233/1‑149 (MQ=255) ccGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTc < 7:80665/149‑1 (MQ=255) gcgcgGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGc < 6:40233/149‑1 (MQ=255) tGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTacg > 4:257934/1‑116 (MQ=255) tGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTacg < 3:257934/116‑1 (MQ=255) tCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCAcc > 5:280147/1‑124 (MQ=255) tCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCAcc < 6:280147/124‑1 (MQ=255) tCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTa > 3:232466/1‑149 (MQ=255) aCCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTAc < 6:244798/148‑1 (MQ=255) ccGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTAccg < 4:232466/149‑1 (MQ=255) tGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCa < 4:37612/147‑1 (MQ=255) tGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCa > 3:37612/1‑147 (MQ=255) ggCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACt > 4:131762/1‑148 (MQ=255) gCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCa < 3:99694/145‑1 (MQ=255) gCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTg > 8:327342/1‑148 (MQ=255) ccGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGaa > 5:194644/1‑149 (MQ=255) tCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAAcagcag > 7:304291/1‑149 (MQ=255) gAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTg > 5:159879/1‑149 (MQ=255) aGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTAcc < 3:285649/123‑1 (MQ=255) gggCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGt < 2:199060/116‑1 (MQ=255) gggCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGt > 1:199060/1‑116 (MQ=255) ggCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAAcagcag > 2:110479/1‑139 (MQ=255) ggCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCCCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAAcagcag < 1:110479/139‑1 (MQ=255) tCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGcc > 3:192331/1‑149 (MQ=255) aGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCg > 6:114470/1‑148 (MQ=255) ggTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCgggg > 4:55518/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCa < 4:192331/149‑1 (MQ=255) aaGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAg < 6:194644/149‑1 (MQ=255) aaGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAg < 8:304291/149‑1 (MQ=255) gTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGaa > 8:99442/1‑113 (MQ=255) gCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCg > 4:205280/1‑124 (MQ=255) gCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCg < 3:205280/124‑1 (MQ=255) | GATGACCGGCGCGTTGGCATCCACATCCGGTGCAGTGACGTTGACGTTGCCCGACACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAG > NC_002947/928741‑929019 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |