New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 928888 = | 55 (1.040) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 6.3% | coding (16734/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | 928940 = | 38 (0.760) | coding (16682/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
CACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGC > NC_002947/928795‑929086 | gaccgcaccggacctgaccccgcctgcggctgccggcaacctgctgttcagtgccgacggcggtaccctcaccggtactggcgaagtgggtgcCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCAc > 3:102672‑M1/94‑149 (MQ=255) ccGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTc > 5:40233/1‑149 (MQ=255) ccGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTc > 8:80665/1‑149 (MQ=255) ccGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTc < 7:80665/149‑1 (MQ=255) gcgcgGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGc < 6:40233/149‑1 (MQ=255) tCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCAcc > 5:280147/1‑124 (MQ=255) tCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCAcc < 6:280147/124‑1 (MQ=255) tCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTa > 3:232466/1‑149 (MQ=255) aCCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTAc < 6:244798/148‑1 (MQ=255) ccGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTAccg < 4:232466/149‑1 (MQ=255) tGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCa < 4:37612/147‑1 (MQ=255) tGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCa > 3:37612/1‑147 (MQ=255) ggCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACt > 4:131762/1‑148 (MQ=255) gCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCa < 3:99694/145‑1 (MQ=255) gCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTg > 8:327342/1‑148 (MQ=255) ccGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGaa > 5:194644/1‑149 (MQ=255) tCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAAcagcag > 7:304291/1‑149 (MQ=255) gAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTg > 5:159879/1‑149 (MQ=255) aGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTAcc < 3:285649/123‑1 (MQ=255) gggCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGt < 2:199060/116‑1 (MQ=255) gggCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGt > 1:199060/1‑116 (MQ=255) ggCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAAcagcag > 2:110479/1‑139 (MQ=255) ggCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCCCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAAcagcag < 1:110479/139‑1 (MQ=255) tCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGcc > 3:192331/1‑149 (MQ=255) aGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCg > 6:114470/1‑148 (MQ=255) ggTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCgggg > 4:55518/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCa < 4:192331/149‑1 (MQ=255) aaGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAg < 8:304291/149‑1 (MQ=255) aaGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAg < 6:194644/149‑1 (MQ=255) gTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGaa > 8:99442/1‑113 (MQ=255) gCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCg < 3:205280/124‑1 (MQ=255) gCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCg > 4:205280/1‑124 (MQ=255) gtgccaccgtcaccgtacgcagcgccggcggtaccgtgctgcagaccgcgacggtgGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTc > 3:102672‑M2/57‑149 (MQ=255) ccgtcaccgtacgcagcgccggcggtaccgtgctgcagaccgcgacggtgGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAgcg > 5:182309‑M2/51‑147 (MQ=255) ctTCGCTGTCTGCAGCACGGTAGCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGTCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGTGTCAGGTCCGGTGCg > 8:74433‑M1/3‑139 (MQ=255) GTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGt < 7:219780‑M1/149‑1 (MQ=255) TCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTg < 3:225599‑M1/149‑1 (MQ=255) TCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTg < 1:250871‑M1/149‑1 (MQ=255) ggTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCtg < 4:225599/149‑1 (MQ=255) gTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCtgt < 5:114470/149‑1 (MQ=255) gcagcgccggcggtaccgtgctgcagaccgcgacggtgGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGac < 6:182309‑M2/111‑1 (MQ=255) cagcaCGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGaca > 2:86299/1‑149 (MQ=255) gcaCGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGAcaca > 7:259208/1‑149 (MQ=255) gTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTAcc < 5:214370/149‑1 (MQ=255) gTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTAcc < 2:250871/149‑1 (MQ=255) ccgccgGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCgg < 3:131762/148‑1 (MQ=255) gcgcTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTc < 6:159879/149‑1 (MQ=255) cgcTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCg < 8:259208/149‑1 (MQ=255) gtgacggtgGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGa > 2:143238/1‑148 (MQ=255) gtgacggtgGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGa < 1:143238/148‑1 (MQ=255) tgGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCGGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAgc > 8:257289‑M2/3‑149 (MQ=255) | CACGTTGCCGCGCGGGTCGCTGAGGGTCACCGAAAGGATCTGGCCGTTGTCCTGAGGCGGGCTCAGGGTCACGGTGAAGGTGCCGTCCGCCTGCACCGTCGCGGTCTGCAGCACGGTACCGCCGGCGCTGCGTACGGTGACGGTGGCACCCACTTCGCCAGTACCGGTGAGGGTACCGCCGTCGGCACTGAACAGCAGGTTGCCGGCAGCCGCAGGCGGGGTCAGGTCCGGTGCGGTCAGCGCAGTGCCTGTGGACACATTACCGGCGCTGTCGGTGAGGGTGACGCTGAGC > NC_002947/928795‑929086 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |