| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1137997 = | 40 (0.760) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 7.6% | coding (473/930 nt) | arcC | carbamate kinase |
| ? | NC_002947 | 1138051 = | 35 (0.700) | coding (419/930 nt) | arcC | carbamate kinase | |||||
CTTTGTCGATCACCGCCTCGATGCCTTTGAGCTTGCGGTTTTCATCGTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCAC > NC_002947/1137851‑1138142 | atttGTCGATCAACGCCTCGATGCCTTTGAGCTTGCGGTTTTCATCGTACATGTTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAAATTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCggg > 7:154927/2‑149 (MQ=255) ggcaacctgctggccttcgaggtgccgttcgccaccttgctcacccaagtggaagtggacgccaacgaccctgccttcaaggacccgaccaagttcatcggcccggtctacagcaaggaagaggccgagcgcctggccaaggaaaaggg < 7:121831‑M1/3‑1 (MQ=255) ggcaacctgctggccttcgaggtgccgttcgccaccttgctcacccaagtggaagtggacgccaacgaccctgccttcaaggacccgaccaagttcatcggcccggtctacagcaaggaagaggccgagcgcctggccaaggaaaagg > 7:180473‑M1/147‑148 (MQ=255) tGTCGATCACCGCCTCGATGCCTTTGAGCTTGCGGTTTTCATCGTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGggct < 8:198662/148‑1 (MQ=255) tGTCGATCACCGCCTCGATGCCTTTGAGCTTGCGGTTTTCATCGTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGggct < 3:262765/148‑1 (MQ=255) acctgctggccttcgaggtgccgttcgccaccttgctcacccaagtggaagtggacgccaacgaccctgccttcaaggacccgaccaagttcatcggcccggtctacagcaaggaagaggccgagcgcctggccaaggaaaaGggctgg > 3:81852‑M1/143‑149 (MQ=255) acctgctggccttcgaggtgccgttcgccaccttgctcacccaagtggaagtggacgccaacgaccctgccttcaaggacccgaccaagttcatcggcccggtctacagcaaggaagaggccgagcgcctggccaaggaaaaGggctgg > 5:362939‑M1/143‑149 (MQ=255) gATCACCGCCTCGATGCCTTTGAGCTTGCGGTTTTCATCGTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGggctggct < 6:256741/148‑1 (MQ=255) aTCACCGCCTCGATGCCTTTGAGCTTGCGGTTTTCATCGTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGGTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTAc > 2:53428/1‑149 (MQ=255) tCACCGCCTCGATGCCTTTGAGCTTGCGGTTTTCATCGTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTAc > 8:113328/1‑148 (MQ=255) ccTCGATGCCTTTGAGCTTGCGGTTTTCATCGTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACgcgg > 3:250303/1‑149 (MQ=255) gATGCCTTTGAGCTTGCGGTTTTCATCGTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACgcggcg < 3:344463/147‑1 (MQ=255) gCCTTTGAGCTTGCGGTTTTCATCGTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTAc < 4:250303/148‑1 (MQ=255) tGAGCTTGCGGTTTTCATCGTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTc < 7:113328/148‑1 (MQ=255) ttGCGGTTTTCATCGTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCgg > 3:231359/1‑116 (MQ=255) ttGCGGTTTTCATCGTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCgg < 4:231359/116‑1 (MQ=255) ttgctcacccaagtggaagtggacgccaacgaccctgccttcaaggacccgaccaagttcatcggcccggtctacagcaaggaagaggccgagcgcctggccaaggaaaaGggctgg < 5:21520‑M1/7‑1 (MQ=255) ttgctcacccaagtggaagtggacgccaacgaccctgccttcaaggacccgaccaagttcatcggcccggtctacagcaaggaagaggccgagcgcctggccaaggaaaaGggctgg > 6:21520‑M1/111‑117 (MQ=255) aTCGTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTGTCGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGac > 1:218332/1‑148 (MQ=255) tCGTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGaccac > 2:116623/1‑149 (MQ=255) ccaagtggaagtggacgccaacgaccctgccttcaaggacccgaccaagttcatcggcccggtctacagcaaggaagaggccgagcgcctggccaaggaaaaGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGaccac < 7:132107‑M1/47‑1 (MQ=255) gTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTg > 6:347854/1‑142 (MQ=255) gTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTg < 5:347854/142‑1 (MQ=255) ggATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTcc < 5:127109/149‑1 (MQ=255) acgccaacgaccctgccttcaaggacccgaccaagttcatcggcccggtctacagcaaggaagaggccgagcgcctggccaaggaaaaGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCt > 8:132107‑M1/89‑149 (MQ=255) aTGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTAGGGTTTCGGGCTGGCTACCAc > 6:76085/1‑101 (MQ=255) aTGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTAGGGTTTCGGGCTGGCTACCAc < 5:76085/101‑1 (MQ=255) cgccACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGcc > 4:43230/1‑136 (MQ=255) cgccACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGcc < 3:43230/136‑1 (MQ=255) ccACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAg < 2:218332/149‑1 (MQ=255) gCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCt > 2:253884/1‑149 (MQ=255) gcAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCct > 6:155247/1‑149 (MQ=255) ggacccgaccaagttcatcggcccggtctacagcaaggaagaggccgagcgcctggccaaggaaaaGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGccc < 8:256311‑M1/54‑1 (MQ=255) tgctgcTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTg < 4:155822/149‑1 (MQ=255) gctgctTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCctct < 6:111055/139‑1 (MQ=255) gctgctTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCctct > 5:111055/1‑139 (MQ=255) tgctTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTAc < 8:178524/80‑1 (MQ=255) tgctTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTAc > 7:178524/1‑80 (MQ=255) ctTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGAc > 2:317606/1‑149 (MQ=255) ttttttCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCg < 8:24955/128‑1 (MQ=255) ttttttCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCg > 7:24955/1‑128 (MQ=255) ttttttCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGAcc > 7:35241/1‑149 (MQ=255) tCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGc < 1:317606/148‑1 (MQ=255) agcagcCACTTGATCGGGGTAATTTCGACCATGCGCTTGGGTTTGGGGCTGGCTCCCAGGCGGCGGAACTTGTCGCCGCCGGCCTTGACCACCCTGCCCTTTTCCTTGGCCAGTCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGAt < 1:53428/149‑1 (MQ=255) gcCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAAc < 1:253884/149‑1 (MQ=255) aCTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGc > 7:167222/1‑138 (MQ=255) aCTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGc < 8:167222/138‑1 (MQ=255) gggCGAATTTCGAAGCTGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTCCCACGCGGCCGCACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCGCGGCCTCTTCCTTGCTCTAGCCCGGGCCGATGAACTTGGTCggg < 8:154927/147‑1 (MQ=255) gCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCAGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCt > 3:269746/1‑149 (MQ=255) gAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACt > 7:26515/1‑128 (MQ=255) gAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACt < 8:26515/128‑1 (MQ=255) gAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCAGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCa < 4:269746/148‑1 (MQ=255) aaGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAgg < 1:116623/149‑1 (MQ=255) aGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAggg < 5:155247/149‑1 (MQ=255) tttCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGtcca > 8:269596/1‑149 (MQ=255) ttCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAgg > 4:324429/1‑134 (MQ=255) ttCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAgg < 3:324429/134‑1 (MQ=255) tCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGtccac < 4:153017/148‑1 (MQ=255) | CTTTGTCGATCACCGCCTCGATGCCTTTGAGCTTGCGGTTTTCATCGTACATGGTGGGGATGCCGCCACCGCCTG‑CGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCAC > NC_002947/1137851‑1138142 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |