New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1137997 = | 40 (0.760) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 7.6% | coding (473/930 nt) | arcC | carbamate kinase |
? | NC_002947 | 1138051 = | 35 (0.700) | coding (419/930 nt) | arcC | carbamate kinase |
GGATGCCGCCACCGCCTGCGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCAAGGTGGCGAACGGCACCTCGAAGGCCAGCAGGTTGCCCAG > NC_002947/1137908‑1138199 | ggATGCCGCCACCGCCTGCGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTcc < 5:127109/149‑1 (MQ=255) acgccaacgaccctgccttcaaggacccgaccaagttcatcggcccggtctacagcaaggaagaggccgagcgcctggccaaggaaaaGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCt > 8:132107‑M1/89‑149 (MQ=255) ccACCGCCTGCGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAg < 2:218332/149‑1 (MQ=255) gCCTGCGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCt > 2:253884/1‑149 (MQ=255) gcAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCct > 6:155247/1‑149 (MQ=255) tgctgcTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTg < 4:155822/149‑1 (MQ=255) gctgctTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCctct > 5:111055/1‑139 (MQ=255) gctgctTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCctct < 6:111055/139‑1 (MQ=255) ctTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGAc > 2:317606/1‑149 (MQ=255) ttttttCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCg > 7:24955/1‑128 (MQ=255) ttttttCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCg < 8:24955/128‑1 (MQ=255) ttttttCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGAcc > 7:35241/1‑149 (MQ=255) tCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGc < 1:317606/148‑1 (MQ=255) agcagcCACTTGATCGGGGTAATTTCGACCATGCGCTTGGGTTTGGGGCTGGCTCCCAGGCGGCGGAACTTGTCGCCGCCGGCCTTGACCACCCTGCCCTTTTCCTTGGCCAGTCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGAt < 1:53428/149‑1 (MQ=255) gcCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAAc < 1:253884/149‑1 (MQ=255) aCTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGc > 7:167222/1‑138 (MQ=255) aCTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGc < 8:167222/138‑1 (MQ=255) gggCGAATTTCGAAGCTGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTCCCACGCGGCCGCACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCGCGGCCTCTTCCTTGCTCTAGCCCGGGCCGATGAACTTGGTCggg < 8:154927/147‑1 (MQ=255) gCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCAGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCt > 3:269746/1‑149 (MQ=255) gAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACt < 8:26515/128‑1 (MQ=255) gAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACt > 7:26515/1‑128 (MQ=255) gAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCAGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCa < 4:269746/148‑1 (MQ=255) aaGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAgg < 1:116623/149‑1 (MQ=255) aGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAggg < 5:155247/149‑1 (MQ=255) aggaaaagggctgggtggtcaaggccgacggcgacaagtaccgccgcgtggtagccagcccTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGt > 8:132107‑M2/62‑149 (MQ=255) tttCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGtcca > 8:269596/1‑149 (MQ=255) ttCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAgg > 4:324429/1‑134 (MQ=255) ttCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAgg < 3:324429/134‑1 (MQ=255) tCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGtccac < 4:153017/148‑1 (MQ=255) gggctgggtggtcaaggccgacggcgacaagtaccgccgcgtggtagccagcccTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTcc < 8:256311‑M2/66‑1 (MQ=255) GCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTccacttccactt > 7:269596‑M1/1‑148 (MQ=255) gtggtcaaggccgacggcgacaagtaccgccgcgtggtagccagcccTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTgg < 7:132107‑M2/102‑1 (MQ=255) tACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTggg > 8:162670/1‑149 (MQ=255) cACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCggg > 6:154873/1‑106 (MQ=255) cACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCggg < 5:154873/106‑1 (MQ=255) ttGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCAAGGTGGCGaa > 8:121831/1‑149 (MQ=255) gCCGTCGGCCTTAACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAggg < 7:110412/103‑1 (MQ=255) gCCGTCGGCCTTAACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAggg > 8:110412/1‑103 (MQ=255) tCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCAAGGTGGCGAACGGCACCTc > 8:77671/1‑149 (MQ=255) cTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCAAGGTGGCGAACGGCACCTCGAAgg > 8:151548/1‑149 (MQ=255) ccaccCAGCCCTTATCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCAAGGTGGCGAACGGCACCTCGAAGGCcag > 2:44896/1‑148 (MQ=255) accCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCAAGGTGGCGAACGGCACCTCGaa < 1:113426/140‑1 (MQ=255) accCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCAAGGTGGCGAACGGCACCTCGaa > 2:113426/1‑140 (MQ=255) accCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCAAGGTGGCGAACGGCACCTCGAAGGCcagcag < 7:77671/149‑1 (MQ=255) ccagcccTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCaa > 6:21520‑M2/8‑117 (MQ=255) ccagcccTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCaa < 5:21520‑M2/110‑1 (MQ=255) ccagcccTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCAAGGTGGCGAACGGCACCTCGAAGGCCAGCAGGt > 5:362939‑M2/8‑149 (MQ=255) ccagcccTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCAAGGTGGCGAACGGCACCTCGAAGGCCAGCAGGt > 3:81852‑M2/8‑149 (MQ=255) cccTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCAAGGTGGCGAACGGCACCTCGAAGGCCAGCAGGTTGcc < 7:121831‑M2/146‑1 (MQ=255) ccTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCAAGGTGGCGAACGGCACCTCGAAGGCCAGCAGGTTGcc > 7:180473‑M2/3‑148 (MQ=255) ttttCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCAAGGTGGCGAACGGCACCTCGAAGGCCAGCAGGTTGCCCAg > 3:142094/1‑149 (MQ=255) | GGATGCCGCCACCGCCTGCGCAAATCACGATGCTGCTTTTTTCCAGCAGCCACTTGATCGGGCGAATTTCGAAGATGCGCTTGGGTTTCGGGCTGGCTACCACGCGGCGGTACTTGTCGCCGTCGGCCTTGACCACCCAGCCCTTTTCCTTGGCCAGGCGCTCGGCCTCTTCCTTGCTGTAGACCGGGCCGATGAACTTGGTCGGGTCCTTGAAGGCAGGGTCGTTGGCGTCCACTTCCACTTGGGTGAGCAAGGTGGCGAACGGCACCTCGAAGGCCAGCAGGTTGCCCAG > NC_002947/1137908‑1138199 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |