New junction evidence | |||||||||||
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TTCGTGGTTGCCACGCCGCGAACCGTAGGAGTTGAAGTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCA > NC_002947/2409249‑2409543 | ttCGTGGTTGCCACGCCGCGAACCGTAGGAGTTGAAGTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAgcgc > 1:270876/1‑147 (MQ=255) caggaaattgccgaggccgtggccaaggtcgatacggcgatgttccacaaggagtacgccgaagtgtttgccggtgatgcgcaatggcaggccatcgaggtgccacaggccgccacttacgtgtggcaggctgactccacctacatc < 2:236978‑M1/1‑1 (MQ=255) gTGGTTGCCACGCCGCGAACCGTAGGAGTTGAAGTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCa > 8:258628/1‑149 (MQ=255) 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cccAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑Tg < 2:175465/96‑1 (MQ=255) cccAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑Tg > 1:175465/1‑96 (MQ=255) cccAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATg > 2:217566/1‑141 (MQ=255) cccAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATg < 1:217566/141‑1 (MQ=255) cccAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTAcc > 4:303125/1‑148 (MQ=255) agcagcGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTggcggcag < 6:292128/124‑3 (MQ=255) agcagcGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTggcggcag > 5:292128/1‑122 (MQ=255) agcagcGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTg > 8:213105/1‑149 (MQ=255) gcagcGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTgc < 7:213105/149‑1 (MQ=255) gcagcGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCAATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTgc > 3:236157/1‑149 (MQ=255) CCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCa < 3:143845‑M1/149‑1 (MQ=255) CCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCa > 8:111785‑M1/1‑149 (MQ=255) | TTCGTGGTTGCCACGCCGCGAACCGTAGGAGTTGAAGTCGCGTGGCTCCACACCTTGTTCCCGCAGGTAGCGCCCGGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCA > NC_002947/2409249‑2409543 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |