New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2409395 = | 84 (1.590) | 4 (0.080) | 4/236 | NT | 5.3% | coding (2053/2742 nt) | acnA‑I | aconitate hydratase |
? | NC_002947 | 2409472 = | 64 (1.300) | coding (1976/2742 nt) | acnA‑I | aconitate hydratase |
GGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTTGTGGAACATCGCCGTATCGACCTTGGCCACGGCCTCGGCAATTTCCTG > NC_002947/2409324‑2409617 | ggccggGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGa < 7:129528/149‑1 (MQ=255) ggCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAg < 2:224320/149‑1 (MQ=255) tGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑Tg < 8:21519/149‑1 (MQ=255) gTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑Tg > 5:353196/1‑148 (MQ=255) gTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑Tg < 6:353196/148‑1 (MQ=255) gTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑Tg > 7:268369/1‑148 (MQ=255) tcgggattgttgGTGCCGGCGGGGGAAAGGTGGTGGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGa < 1:147283/143‑1 (MQ=255) cGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAg < 4:167025/143‑1 (MQ=255) cGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAg > 3:167025/1‑143 (MQ=255) aTGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCTGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCt < 3:244528/148‑1 (MQ=255) gTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGc < 8:268369/148‑1 (MQ=255) cggcggGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGt < 6:229446/126‑1 (MQ=255) cggcggGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGt > 5:229446/1‑126 (MQ=255) ccacaggccgccacttacgtgtggcaggctgactccacctacatCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGAt < 5:65143‑M1/79‑1 (MQ=255) ccacaggccgccacttacgtgtggcaggctgactccacctacatCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGAt > 6:65143‑M1/45‑123 (MQ=255) gggggAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAg < 6:16109/149‑1 (MQ=255) gAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGa > 2:328499/1‑115 (MQ=255) gAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGa < 1:328499/115‑1 (MQ=255) gTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCtgtg < 5:85283/149‑1 (MQ=255) tCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGGCTGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCtgtg < 1:232445/149‑1 (MQ=255) 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cccAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑Tg < 2:175465/96‑1 (MQ=255) cccAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATg < 1:217566/141‑1 (MQ=255) cccAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATg > 2:217566/1‑141 (MQ=255) cccAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTAcc > 4:303125/1‑148 (MQ=255) agcagcGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTggcggcag < 6:292128/124‑3 (MQ=255) agcagcGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTggcggcag > 5:292128/1‑122 (MQ=255) 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ccaccgttcttcgacggcatcggcgggccgccgccacaaattgccaatattcacggcgcacgggtgctggATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCt < 2:56807‑M2/58‑1 (MQ=255) CCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACAGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCa < 2:204771‑M1/148‑1 (MQ=255) CCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGAGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTCGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGAGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATAGCTCATCaccgcca < 2:96773‑M1/148‑4 (MQ=255) ccGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTc > 6:219266/1‑149 (MQ=255) cGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACAGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCg < 1:204771/149‑1 (MQ=255) gTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTgg < 1:168651/105‑1 (MQ=255) 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2:97336‑M2/96‑1 (MQ=255) gATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTTGTGGAACATCGCCGTATCGACCTTGGCCACGGCCTCGGCAATTTCctg < 2:236978‑M2/146‑1 (MQ=255) | GGCCGGGCTGTCGGTCTTGATGTTGCCGGCGGGGGAAATGTGGTCGGTGGTCACTGAATCGCCCAGCAGCGCCAGCACCCGTGCGCCGTGAATATTGGCAATTTGTGGCGGCGGCCCGCCGATGCCGTCGAAGAACGGTGGGTGCTGGATGTAGG‑TGGAGTCAGCCTGCCACACGTAAGTGGCGGCCTGTGGCACCTCGATGGCCTGCCATTGCGCATCACCGGCAAACACTTCGGCGTACTCCTTGTGGAACATCGCCGTATCGACCTTGGCCACGGCCTCGGCAATTTCCTG > NC_002947/2409324‑2409617 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |