| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2581891 | 56 (1.060) | 4 (0.080) | 4/242 | NT | 6.7% | coding (243/801 nt) | PP_2263 | sugar ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | = 2581936 | 58 (1.150) | coding (288/801 nt) | PP_2263 | sugar ABC transporter permease | |||||
GAGATCCTTGGCGGCCTGACCCTGTGGCCGCAGGCGTTCACGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGA > NC_002947/2581745‑2582034 | gagaTCCTTGGCGGCCTGACCCTGTGGCCGCAGGCGTTCACGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGtt < 2:180530/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCGGCCTGACCCTGTGGCCGCAGGCGTTCACGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCcg > 2:323958/1‑149 (MQ=255) ttGGCGGCCTGACCCTGTGGCCGCAGGCGTTCACGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGc > 5:55759/1‑144 (MQ=255) ttGGCGGCCTGACCCTGTGGCCGCAGGCGTTCACGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGc < 6:55759/144‑1 (MQ=255) gcggcCTGACCCTGTGGCCGCAGGCGTTCACGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGc < 3:233796/148‑1 (MQ=255) cggcCTGACCCTGTGGCCGCAGGCGTTCACGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCt < 5:44545/149‑1 (MQ=255) gCAGGCGTTCACGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCcg < 8:299327/125‑1 (MQ=255) gCAGGCGTTCACGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCcg > 7:299327/1‑125 (MQ=255) gCAGGCGTTCACGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTAcc > 7:174263/1‑149 (MQ=255) gCAGGCGTTCACGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTAcc > 3:172200/1‑149 (MQ=255) aGGCGTTCACGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGc < 1:182224/149‑1 (MQ=255) cACGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCg < 8:174263/149‑1 (MQ=255) cACGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGAACAGCGGCTACATCAACTCGCTCTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTAGAGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTATCTCg > 6:40838/1‑149 (MQ=255) aCGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCg < 1:323958/148‑1 (MQ=255) gCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGc < 2:190361/110‑1 (MQ=255) gCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGc > 1:190361/1‑110 (MQ=255) tCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGAc > 7:104608/1‑149 (MQ=255) aaCTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGgtcgccgagaaagcggtagcgcgagaacgcataggccgcgggcaacgcca < 1:53983‑M1/149‑51 (MQ=255) cTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCAcc > 6:23298/1‑149 (MQ=255) ccGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGgtcgccgagaaagcggtagcgcgagaacgcataggccgcgggcaacgccacgag > 4:152582‑M1/1‑94 (MQ=255) ccGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGgtcgccgagaaagcggtagcgcgagaacgcataggccgcgggcaacgccacgag < 3:152582‑M1/148‑55 (MQ=255) ccGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCg < 6:195193/134‑1 (MQ=255) ccGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCg > 5:195193/1‑134 (MQ=255) cGACTGATCATCACCGACGCCAGCAGGTACACCGGCTACATCAACTCGCTGGACTATGTGTGCCTCCACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGgtcgccgagaaagcggtagcgcgagaacgcataggccgcgggcaacgccacgagca < 8:254269‑M1/149‑57 (MQ=255) aTCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGa > 1:320728/1‑131 (MQ=255) aTCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGa < 2:320728/131‑1 (MQ=255) cACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTg < 5:23298/144‑1 (MQ=255) aCCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGgctgct < 1:164718/149‑1 (MQ=255) ccGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGgctgct > 1:349047/1‑148 (MQ=255) cGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGa < 3:104659/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGGTACAGCGGCTAGATCATCTCGCTGTACTATGTGTGCGTGAAGACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCGTATGCGTTCTCGCGCTACGGCTTTCTCGGCGAGCGCCACCTGTTGTTCTGGCTGCTGACCAAc < 5:40838/149‑1 (MQ=255) gCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCa > 6:293315/1‑149 (MQ=255) aCATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑Ccggcg > 2:31999/1‑149 (MQ=255) aTCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATg < 8:30612/135‑1 (MQ=255) aTCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATg > 7:30612/1‑135 (MQ=255) tCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTg > 6:63385/1‑115 (MQ=255) tCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTg < 5:63385/115‑1 (MQ=255) tCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCct > 1:41618/1‑149 (MQ=255) gCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGgc < 4:180981/129‑1 (MQ=255) gCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGgc > 3:180981/1‑129 (MQ=255) aCTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTAGTCGGTCTCGCGGTACCGCTTTCTCGGCGCCCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCACCCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTGCCTGCTGCCg > 8:268715/1‑149 (MQ=255) cTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTc > 4:74494/1‑139 (MQ=255) cTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTc < 3:74494/139‑1 (MQ=255) aTGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGttc > 8:250508/1‑149 (MQ=255) tgtgtgCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCaa < 6:79167/111‑1 (MQ=255) tgtgtgCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCaa > 5:79167/1‑111 (MQ=255) tgtgtgCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGttct > 8:74299/1‑149 (MQ=255) gtgtgCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGATGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTc > 1:269118/1‑135 (MQ=255) gtgtgCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGATGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTc < 2:269118/135‑1 (MQ=255) tgtgCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGttcttc < 7:74299/149‑1 (MQ=255) ccTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCACCCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAg < 1:31999/149‑1 (MQ=255) cTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCCTGCTGCTGTTCTTCCAGtt < 8:104608/149‑1 (MQ=255) acGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACtc < 5:293315/149‑1 (MQ=255) cGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGc > 3:21150/1‑101 (MQ=255) cGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGc < 4:21150/101‑1 (MQ=255) gCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAAGCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCctgc < 1:194609/125‑1 (MQ=255) gCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCctgc > 2:194609/1‑125 (MQ=255) gCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACtcgt > 5:59133/1‑149 (MQ=255) gATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCa > 2:85875/1‑135 (MQ=255) gATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCa < 1:85875/135‑1 (MQ=255) tCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCg < 4:153409/148‑1 (MQ=255) aCTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGc > 3:338661/1‑149 (MQ=255) tGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACcgccacgagcagtgaaatcagcgtgtggaggcacacatagtccagcgagttgatgtagccggtgtacctgctggcgtcggtgatgatcagtcg < 8:254269‑M2/149‑94 (MQ=255) cTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACcgccacgagcagtgaaatcagcgtgttcaggcacacatagtacagcgagttgatgtagccgctgtaccagctggcgtcggtgaagatcactcgg < 3:152582‑M2/148‑95 (MQ=255) cTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACcgccacgagcagtgaaatcagcgtgttcaggcacacatagtacagcgagttgatgtagccgctgtaccagctggcgtcggtgaagatcactcgg > 4:152582‑M2/1‑54 (MQ=255) cTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGtt < 7:250508/149‑1 (MQ=255) tCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGAcc < 7:67193/80‑1 (MQ=255) tCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGAcc > 8:67193/1‑80 (MQ=255) tGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACcgccacgagcagtgaaatcagcgtgttcaggcacacatagtacagcgagttgatgtagccgctgtaccagctggcgtcggtgaagatcactcggtagtt < 1:53983‑M2/149‑100 (MQ=255) | GAGATCCTTGGCGGCCTGACCCTGTGGCCGCAGGCGTTCACGCTCGACAACTACCGAGTGATCTTCACCGACGCCAGCTGGTACAGCGGCTACATCAACTCGCTGTACTATGTGTGCCTGAACACGCTGATTTCACTGCTCGTGGCGTTGCCCGCGGCCTATGCGTTCTCGCGCTACCGCTTTCTCGGCGACCGCCACCTGTTCTTCTGGCTGCTGACCAACCGCATGGCGCCA‑CCGGCGGTGTTCCTGCTGCCGTTCTTCCAGTTGTACTCGTCGATCGGGCTGTTCGA > NC_002947/2581745‑2582034 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |