New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2976750 = | 62 (1.170) | 5 (0.100) | 5/236 | NT | 9.3% | coding (686/816 nt) | PP_2603 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2976817 = | 40 (0.820) | coding (753/816 nt) | PP_2603 | hypothetical protein |
CGCAACTGAAGCCGAAGCGCATGCGCTATGCCCAACTGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAGGCGGTATTGGCCGCGGTCTGATCGAGCGAACGTGGCGC > NC_002947/2976603‑2976897 | cgcAACTGAAGCCGAAGCGCATGCGCTATGCCCAACTGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTacac < 2:290184/149‑1 (MQ=255) cgcAACTGAAGCCGAAGCGCATGCGCTATGCCCAAATGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTacac < 4:41681/149‑1 (MQ=255) aCTGAAGCCGAAGCGCATGCGCTATGCCCAACTGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCt < 3:263356/149‑1 (MQ=255) ggacaacgacaatgcagcgttcggtgtgggttcactcgcgaacgtggcgtaaccggtgccatgcgccacgttcgctcgatcagaccgcggccaataccgcctgggctttctccagcgccatgcgcgcgcgctgttcgccactgACGCCt > 2:144113‑M1/144‑149 (MQ=255) gAAGCCGAAGCGCATGCGCTATGCCCAACTGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTgc > 2:9772/1‑149 (MQ=255) caacgacaatgcagcgttcggtgtgggttcactcgcgaacgtggcgtaaccggtgccatgcgccacgttcgctcgatcagaccgcggccaataccgcctgggctttctccagcgccatgcgcgcgcgctgttcgccactgACGCCTTgc > 4:89034‑M1/141‑149 (MQ=255) caacgacaatgcagcgttcggtgtgggttcactcgcgaacgtggcgtaaccggtgccatgcgccacgttcgctcgatcagaccgcggccaataccgcctgggctttctccagcgccatgcgcgcgcgctgttcgccactgACGCCTTgc > 4:96644‑M1/141‑149 (MQ=255) aaGCCGAAGCGCATGCGCTATGCCCAACTGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTgcc > 3:12651/1‑149 (MQ=255) aaGCCGAAGCGCATGCGCTATGCCCAACTGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTgc < 7:29466/148‑1 (MQ=255) aaGCCGAAGCGCATGCGCTATGCCCAACTGTGTGACGTTACTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTg < 8:9752/147‑1 (MQ=255) aacgacaatgcagcgttcggtgtgggttcactcgcgaacgtggcgtaaccggtgccatgcgccacgttcgctcgatcagaccgcggccaataccgcctgggctttctccagcgccatgcgcgcgcgctgttcgccactgACGCCt > 5:122633‑M1/140‑145 (MQ=255) aacgacaatgcagcgttcggtgtgggttcactcgcgaacgtggcgtaaccggtgccatgcgccacgttcgctcgatcagaccgcggccaataccgcctgggctttctccagcgccatgcgcgcgcgctgttcgccactgACGCCt < 6:122633‑M1/6‑1 (MQ=255) aGCCGAAGCGCATGCGCTATGCCCAACTGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTgccg > 4:157607/1‑149 (MQ=255) cccAACTGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTg < 7:163521/149‑1 (MQ=255) cccAACTGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTg > 8:163521/1‑149 (MQ=255) ccAACTGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTgg < 5:185409/149‑1 (MQ=255) ccAACTGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTgg < 6:240002/149‑1 (MQ=255) ccAACTGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTg > 4:62329/1‑148 (MQ=255) ccAACTGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGACATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCGTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCATg > 7:73325/1‑148 (MQ=255) aaCTGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGa > 4:105915/1‑148 (MQ=255) tgACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCa < 6:68884/149‑1 (MQ=255) aCGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCAcg > 8:271552/1‑149 (MQ=255) gTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCAcgcg > 2:35762/1‑149 (MQ=255) tGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCg < 7:226057/124‑1 (MQ=255) tGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCg > 8:226057/1‑124 (MQ=255) atgtcggccGGTACCGGGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGATGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCgg > 4:109406/8‑149 (MQ=255) gCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCGAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTg > 2:274797/1‑149 (MQ=255) gCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTg > 3:136964/1‑149 (MQ=255) gtaaccggtgccatgcgccacgttcgctcgatcagaccgcggccaataccgcctgggctttctccagcgccatgcgcgcgcgctgttcgccactgACGCCTTGCTCCAGCAATTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGc > 4:333848‑M1/96‑149 (MQ=255) ccGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCt > 6:286958/1‑149 (MQ=255) ggTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTgg < 1:35762/149‑1 (MQ=255) ggTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTgg < 4:12651/149‑1 (MQ=255) gTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGa < 3:62329/149‑1 (MQ=255) c‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGATATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCaa < 1:9772/149‑1 (MQ=255) ggCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAg < 6:36996/149‑1 (MQ=255) gCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGTTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAggggt > 3:199820/1‑144 (MQ=255) gACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGt < 4:136964/149‑1 (MQ=255) gagaTCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGc > 8:271251/1‑138 (MQ=255) gagaTCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGc < 7:271251/138‑1 (MQ=255) gaTCCTGCGCCAGGCGCGTATCGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGaa > 4:24873/1‑148 (MQ=255) tCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAg < 4:287040/139‑1 (MQ=255) tCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAg > 3:287040/1‑139 (MQ=255) tGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCAcgcg < 4:73100/112‑1 (MQ=255) tGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCAcgcg > 3:73100/1‑112 (MQ=255) atcagaccgcggccaataccgcctgggctttctccagcgccatgcgcgcgcgctgttcgccactgACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGc > 8:196971‑M1/66‑130 (MQ=255) atcagaccgcggccaataccgcctgggctttctccagcgccatgcgcgcgcgctgttcgccactgACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGc < 7:196971‑M1/65‑1 (MQ=255) ccAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCaa > 2:291981/1‑112 (MQ=255) ccAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCaa < 1:291981/112‑1 (MQ=255) cAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAgcgcgcgcg > 3:93433/1‑149 (MQ=255) taccgcctgggctttctccagcgccatgcgcgcgcgctgttcgccactgACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAg > 8:203638‑M1/50‑119 (MQ=255) taccgcctgggctttctccagcgccatgcgcgcgcgctgttcgccactgACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAg < 7:203638‑M1/70‑1 (MQ=255) cGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCt > 2:334647/1‑101 (MQ=255) cGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGgaga > 1:303108/1‑148 (MQ=255) gACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGGGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGaaa < 3:24873/149‑1 (MQ=255) aCGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACAGGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAg > 1:249047/1‑149 (MQ=255) gCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTg > 1:318447/1‑95 (MQ=255) gCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTg < 2:318447/95‑1 (MQ=255) gCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGcc < 5:286958/149‑1 (MQ=255) gCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGcc < 2:249047/149‑1 (MQ=255) gCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGcc > 2:140790/1‑149 (MQ=255) ttCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAgcgcgcgcttg < 5:303662/130‑4 (MQ=255) ttCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAgcgcgcgcttg > 6:303662/1‑127 (MQ=255) cccGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCa < 3:105915/147‑1 (MQ=255) ccGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAgg < 3:157607/148‑1 (MQ=255) ccGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAgg < 7:271552/148‑1 (MQ=255) aTGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAGGCGGTAtt < 4:93433/148‑1 (MQ=255) ggCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAgc > 6:259151/1‑109 (MQ=255) ggCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAgc < 5:259151/109‑1 (MQ=255) gCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAGGCGGTATTGGc < 1:140790/148‑1 (MQ=255) gTTGGCCTGTTACACGCCTTTCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAACTCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAGGCGGTATTGTCCGCGGTCTGa < 8:73325/144‑1 (MQ=255) gTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAGGCGGTATTGGCCGCGGTCTGa < 2:303108/144‑1 (MQ=255) tGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGaa > 1:175990/1‑83 (MQ=255) tGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGaa < 2:175990/83‑1 (MQ=255) tGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAGGCGGTATTGGCCGCGGTCTGATCGAGCGAACGt > 6:107868/1‑149 (MQ=255) acacGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAGGCGGTATTGGCCGCGGTCTGATCGAGCGAACGTGgcg > 5:53935/1‑149 (MQ=255) acacGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAGGCGGTATTGGCCGCGGTCTGATCGAGCGAACGTGgc > 7:233781/1‑148 (MQ=255) acacGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAGGCGGTATTGGCCGCGGTCTGATCGAGCGAACGTGgc < 8:233781/148‑1 (MQ=255) cacGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAGGCGGTATTGGCCGCGGTCTGATCGAGCGAACGTGgcgc < 5:107868/149‑1 (MQ=255) cacGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAGGCGGTATTGGCCGCGGTCTGATCGAGCGAACGTGgcg > 1:33531/1‑148 (MQ=255) cacGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAGGCGGTATTGGCCGCGGTCTGATCGAGCGAACGTGgc < 3:143302/147‑1 (MQ=255) cacGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAGGCGGTATTGGCCGCGGTCTGATCGAGCGAACGTGgc > 4:143302/1‑147 (MQ=255) | CGCAACTGAAGCCGAAGCGCATGCGCTATGCCCAACTGTGTGACGTTGCTGGCCCGGTACC‑GGCCGACATGGACGAGATCCTGCGCCAGGCGCGTAACGAGCGACGCTTCCCGGGTGATGGCGATGCCGATCTGGTTGGCCTGTTACACGCCTTGCCGCCGAGCGTGCCGCTGAGCCTGGAAATCCCCACGCGGCAATTGCTGGAGCAAGGCGTCAGTGGCGAACAGCGCGCGCGCATGGCGCTGGAGAAAGCCCAGGCGGTATTGGCCGCGGTCTGATCGAGCGAACGTGGCGC > NC_002947/2976603‑2976897 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |