New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3077546 = | 34 (0.640) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 9.5% | coding (307/951 nt) | PP_2687 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3077581 = | 25 (0.500) | coding (272/951 nt) | PP_2687 | hypothetical protein |
GGTCGCACCGCGGAACAGGTGTGATCGTTCCTTGACCCAGTCGCAGAACTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTTGGTGGCGTCGAGGGCGAAGAAGTGCAGCATGCGCTCGGTGTCGAGTTCCTTGTGGCGACGCAGGTAGTCATCCAGCATGCCC > NC_002947/3077403‑3077691 | ccatgccgaactggcaatgtcgctgatggcctcgggcatgctggatgactacctgcgtcgccacaaggaactcgacaccgagcgcatgctgcacttcttcgccctcgacgccaccaaccccagcagcatctactgctgcctgcaGGCcg > 5:86576‑M1/145‑149 (MQ=255) ccatgccgaactggcaatgtcgctgatggcctcgggcatgctggatgactacctgcgtcgccacaaggaactcgacaccgagcgcatgctgcacttcttcgccctcgacgccaccaaccccagcagcatctactgctgcctgcaGGCcg < 3:168128‑M1/5‑1 (MQ=255) gCACCGCGGAACAGGTGTGATCGTTCCTTGACCCAGTCGCAGAACTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCAc > 2:159978/1‑149 (MQ=255) gtgtGATCGTTCCTTGACCCAGTCGCAGAACTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCAtt > 4:180464/1‑147 (MQ=255) gtgtGATCGTTCCTTGACCCAGTCGCAGAACTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCAtt < 3:180464/147‑1 (MQ=255) gtgtGATCGTTCCTTGACCCAGTCGCAGAACTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTgg > 3:44180/1‑149 (MQ=255) cGTTCCTTGACCCAGTCGCAGAACTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTggc > 8:253756/1‑149 (MQ=255) ttCCTTGACCCAGTCGCAGAACTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATg < 2:53844/132‑1 (MQ=255) ttCCTTGACCCAGTCGCAGAACTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATg > 1:53844/1‑132 (MQ=255) ccTTGACCCAGTCGCAGAACTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCt > 5:91650/1‑142 (MQ=255) ccTTGACCCAGTCGCAGAACTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCt < 6:91650/142‑1 (MQ=255) ggcatgctggatgactacctgcgtcgccacaaggaactcgacaccgagcgcatgctgcacttcttcgccctcgacgccaccaaccccagcagcatctactgctgcctgcaGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTgca > 7:273731‑M1/111‑149 (MQ=255) aGTCGCAGAACTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTg > 2:288915/1‑128 (MQ=255) gCAGAACTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTg < 2:211471/138‑1 (MQ=255) gCAGAACTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTg > 1:211471/1‑138 (MQ=255) cAGAACTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGcagcag > 4:252227/1‑147 (MQ=255) aCTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGAt < 4:44180/148‑1 (MQ=255) cATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTtg < 1:159978/149‑1 (MQ=255) aTAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTtgg > 7:197864/1‑149 (MQ=255) aTAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTtgg > 8:167938/1‑149 (MQ=255) tAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTtggt < 7:253756/149‑1 (MQ=255) cacaaggaactcgacaccgagcgcatgctgcacttcttcgccctcgacgccaccaaccccagcagcatctactgctgcctgcaGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTgcag > 7:301747‑M1/84‑123 (MQ=255) cacaaggaactcgacaccgagcgcatgctgcacttcttcgccctcgacgccaccaaccccagcagcatctactgctgcctgcaGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTgcag < 8:301747‑M1/40‑1 (MQ=255) ccAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTtggt > 3:37219/1‑142 (MQ=255) ccAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTtggt < 4:37219/142‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTTGGTGGCGTCGAGGGCg > 1:183380/1‑148 (MQ=255) ttGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTTGGTGGCGTCGAGGGCgaa < 7:167938/149‑1 (MQ=255) cTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTTGGTGGCGTCGAGGGCgaagaa < 8:197864/149‑1 (MQ=255) tttCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATgg < 7:14198/65‑1 (MQ=255) tttCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATgg > 8:14198/1‑65 (MQ=255) ttCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGTGCGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTTGGTGGCGTCGAGGGCGAAGAAGTGCAGCATGCGCTCg > 1:52474/1‑149 (MQ=255) ttCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTTGGTGGCGTCGAGGGCGAAGAAGTGCAGCATGCGCTCgg > 8:213254/1‑149 (MQ=255) gTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGgcagca < 4:184086/78‑1 (MQ=255) gTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGgcagca > 3:184086/1‑78 (MQ=255) ccACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTTGGTGGCGTCGAGGGCGAAGAAGTGCAGCATGCGCTCGGTGTc < 4:292711/126‑1 (MQ=255) ccACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTTGGTGGCGTCGAGGGCGAAGAAGTGCAGCATGCGCTCGGTGTc > 3:292711/1‑126 (MQ=255) ccACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTTGGTGGCGTCGAGGGCGAAGAAGTGCAGCATGCGCTCGGTGTCGAGTTCCTTGTgg > 4:228650/1‑139 (MQ=255) ccACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTTGGTGGCGTCGAGGGCGAAGAAGTGCAGCATGCGCTCGGTGTCGAGTTCCTTGTgg < 3:228650/139‑1 (MQ=255) cggcggTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTTGGTGGCGTCGAGGGCGAAGAAGTGCAGCATGCGCTCGGTGTCGAGTTCCTTGTGGCGACGCAGGTAGTCATcc < 3:252227/149‑1 (MQ=255) cGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTTGGTGGCGTCGAGGGCGAAGAAGTGCAGCATGCGCTCGGTGTCGAGTTCCTTGTGGCGACGCAGGTAGTCATCCAGCATGccc > 2:316962/1‑147 (MQ=255) | GGTCGCACCGCGGAACAGGTGTGATCGTTCCTTGACCCAGTCGCAGAACTGGCTGATGCCATAGCGACCCAGGCCATTGCTGGCGATGTTGCGCATTTCGATCCAGGTGGCGTTGATGTTCTCCCACATGT‑CGGCGGTGATACGGCCGCGCACTGCATGGGCATTGGTCCTGGCGGCCTGCAGGCAGCAGTAGATGCTGCTGGGGTTGGTGGCGTCGAGGGCGAAGAAGTGCAGCATGCGCTCGGTGTCGAGTTCCTTGTGGCGACGCAGGTAGTCATCCAGCATGCCC > NC_002947/3077403‑3077691 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |