| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4364240 = | 60 (1.140) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 7.3% | intergenic (+17/‑260) | PP_3840/PP_5635 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 4364278 = | 44 (0.860) | intergenic (+55/‑222) | PP_3840/PP_5635 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
TTCGTCAGTTTCTGCTCAGCGAGTGCGGCGCGGCATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTGGCTTGAGCCCAACCCTAGACTGCGAACATTTCAATATTTGAT > NC_002947/4364093‑4364384 | tcttcagcatgaaggatgagtgatatttccaggtttgctcatcaaatattgaaatgttcgcagtctagggttgggctcaagccaattccaccatcgagggcgtcaggaaatggattattccagcatggttgaatcgttggacaagatGc < 7:152384‑M1/2‑1 (MQ=255) tCAGTTTCTGCTCAGCGAGTGCGGCGCGGCATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTg > 5:39679/1‑147 (MQ=255) aGTTTCTGCTCAGCGAGTGCGGCGCGGCATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGag < 8:333139/148‑1 (MQ=255) atgaaggatgagtgatatttccaggtttgctcatcaaatattgaaatgttcgcagtctagggttgggctcaagccaattccaccatcgagggcgtcaggaaatggattattccagcatggttgaatcgttggacaagatg < 5:105714‑M1/1‑1 (MQ=255) atgaaggatgagtgatatttccaggtttgctcatcaaatattgaaatgttcgcagtctagggttgggctcaagccaattccaccatcgagggcgtcaggaaatggattattccagcatggttgaatcgttggacaagatg > 6:105714‑M1/140‑140 (MQ=255) tCAGCGAGTGCGGCGCGGCATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTa > 1:103326/1‑149 (MQ=255) tCAGCGAGTGCGGCGCGGCATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTa > 7:230137/1‑149 (MQ=255) tCAGCGAGTGCGGCGCGGCATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTa > 6:145988/1‑149 (MQ=255) cAGCGAGTGCGGCGCGGCATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTAc > 5:118297/1‑149 (MQ=255) aGCGAGTGCGGCGCGGCATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTAc < 8:230137/148‑1 (MQ=255) gCGAGTGCGGCGCGGCATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCAGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGAGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCt > 6:289959/1‑149 (MQ=255) gAGTGCGGCGCGGCATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTg > 1:320112/1‑148 (MQ=255) ggcgcggcATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGt < 5:145988/149‑1 (MQ=255) gcgcggcATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGtt > 1:39940/1‑149 (MQ=255) gcgcggcATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGtt < 1:139144/149‑1 (MQ=255) cggcATTCATGTTCGAGCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGcc < 7:289552/149‑1 (MQ=255) cggcATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGa < 5:43786/123‑1 (MQ=255) cggcATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGa > 6:43786/1‑123 (MQ=255) cggcATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGcc > 5:337923/1‑149 (MQ=255) cATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTc < 6:338761/149‑1 (MQ=255) aaGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCAt < 2:320112/149‑1 (MQ=255) tCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCtt < 5:289959/148‑1 (MQ=255) gACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGt < 2:39940/148‑1 (MQ=255) tgaaatgttcgcagtctagggttgggctcaagccaattccaccatcgagggcgtcaggaaatggattattccagcatggttgaatcgttggacaagatGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGt < 1:14550‑M1/45‑1 (MQ=255) tgaaatgttcgcagtctagggttgggctcaagccaattccaccatcgagggcgtcaggaaatggattattccagcatggttgaatcgttggacaagatGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGt > 2:14550‑M1/99‑143 (MQ=255) tCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTc > 3:156385/1‑148 (MQ=255) tCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTc > 6:273447/1‑148 (MQ=255) aTGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAAc > 7:11433/1‑149 (MQ=255) tGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAAc > 6:248968/1‑148 (MQ=255) gCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGcc < 3:191445/121‑1 (MQ=255) gCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGcc > 4:191445/1‑121 (MQ=255) tttGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTAc > 7:185862/1‑105 (MQ=255) tttGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTAc < 8:185862/105‑1 (MQ=255) cagtctagggttgggctcaagccaattccaccatcgagggcgtcaggaaatggattattccagcatggttgaatcgttggacaagatGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCtt > 4:228408‑M1/88‑130 (MQ=255) cagtctagggttgggctcaagccaattccaccatcgagggcgtcaggaaatggattattccagcatggttgaatcgttggacaagatGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCtt < 3:228408‑M1/43‑1 (MQ=255) ggATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTg > 4:41227/1‑149 (MQ=255) ggATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTg > 6:170007/1‑149 (MQ=255) gATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTg < 5:273447/148‑1 (MQ=255) aaGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGaat < 6:39679/148‑1 (MQ=255) gagTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGaataat > 6:343595/1‑149 (MQ=255) gagTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGaataat < 6:118297/149‑1 (MQ=255) gTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCAtt < 2:103326/149‑1 (MQ=255) gTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCAt < 3:41227/148‑1 (MQ=255) tACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCAttt < 5:248968/149‑1 (MQ=255) ccccGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGATTGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCtt < 7:193729/103‑1 (MQ=255) ccccGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCtt > 8:193729/1‑103 (MQ=255) ccccGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTcc < 4:156385/149‑1 (MQ=255) ccccGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTc < 1:120387/148‑1 (MQ=255) ccccGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTc > 2:120387/1‑148 (MQ=255) ccccGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCATACCTGCAGCAATAACCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTcc > 1:285623/1‑149 (MQ=255) aaCCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGc < 3:302336/125‑1 (MQ=255) aaCCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGc > 4:302336/1‑125 (MQ=255) ccATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCt < 5:343595/149‑1 (MQ=255) ggTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGAtg < 7:94084/149‑1 (MQ=255) gTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGAtgg > 5:54133/1‑149 (MQ=255) aCGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGAtggtg < 6:54133/148‑1 (MQ=255) gACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTGGCt < 5:170007/149‑1 (MQ=255) gAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTGGCTTGa < 8:11433/149‑1 (MQ=255) tACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTGGCTTGAGCCCaa > 3:13369/1‑148 (MQ=255) ggAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTc < 1:217125/109‑1 (MQ=255) ggAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTc > 2:217125/1‑109 (MQ=255) ggAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTGGCTTGAGCCCAACCCt < 6:337923/149‑1 (MQ=255) gAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTGGCTTGAGCCCAACCCTa < 4:13369/149‑1 (MQ=255) aTGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTgg < 3:63356/128‑1 (MQ=255) aTGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTgg > 4:63356/1‑128 (MQ=255) tCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTGGCTTGAGCCCAACCCTAGACTGCGAACATTTCAATAtt < 2:285623/148‑1 (MQ=255) tCTGACGACTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCGATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTGGCTTGa < 1:156705/116‑1 (MQ=255) tCTGACGACTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTGGCTTGa > 2:156705/1‑116 (MQ=255) tGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTGGCTTGAGCCCAACCCTAGACTGCGAACATTTCAATATTtga > 2:177317/1‑149 (MQ=255) aCGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTGGCtt < 6:256285/110‑1 (MQ=255) aCGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTGGCTTGAGCCCAACCCTAGACTGCGAACATTTCAATATTtgat > 5:109132/1‑148 (MQ=255) aCGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTGGCTTGAGCCCAACCCTAGACTGCGAACATTTCAATATTtgat < 6:109132/148‑1 (MQ=255) | TTCGTCAGTTTCTGCTCAGCGAGTGCGGCGCGGCATTCAAGTTCGACCGTGGACTCATGCTTTGGATCAAGAGTGGTACCCCGTCAACCATGGGTGACGTCGCGGACGAATGGCTACGGAGGTATGGGTGAAGCTCTGTATCTGACGGCTGGAGGCAGGCCTTACCTGCAGCCGTTGCCTTCAGCATCTTGTCCAACGATTCAACCATGCTGGAATAATCCATTTCCTGACGCCCTCGATGGTGGAATTGGCTTGAGCCCAACCCTAGACTGCGAACATTTCAATATTTGAT > NC_002947/4364093‑4364384 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |