| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4583512 | 24 (0.450) | 7 (0.140) | 7/242 | NT | 23.0% | intergenic (‑85/+86) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
| ? | NC_002947 | = 4583542 | 24 (0.480) | intergenic (‑115/+56) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase | |||||
GGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATC > NC_002947/4583368‑4583658 | ggCGTCCTTGTACCAGAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGGCATGTGCTACTCCTTTCAATTTCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGTGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGt < 4:23178/149‑1 (MQ=255) cacaGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATg > 6:89606/1‑149 (MQ=255) acaGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATgg > 6:80864/1‑149 (MQ=255) tGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCcgg < 5:80704‑M2/149‑4 (MQ=255) gAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGACACCGGCGAAGCCGgt > 4:29720/1‑149 (MQ=255) ggCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGAGTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGCTCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGgcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgt > 8:181574‑M1/1‑112 (MQ=255) cTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGACACCGGCGAAGCcggtgccat > 8:45154‑M2/1‑140 (MQ=255) cgctctcgggaacgctTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCCCAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTCCCCGCGAAGATGACACCGgcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatc < 7:97389‑M1/142‑41 (MQ=255) ccGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGgcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatct < 7:181574‑M1/148‑42 (MQ=255) ccGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTcgcg < 5:80864/148‑1 (MQ=255) ccGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGACACCGGCGAAGCcggtgccatgc > 3:29720‑M2/1‑137 (MQ=255) cgggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGAGTTTATCCGCGA‑‑‑‑‑ACACCGgcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaa < 6:314013‑M1/149‑53 (MQ=255) gggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGgcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatc > 8:97389‑M1/1‑101 (MQ=255) gAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAttgtttg > 5:124685/1‑143 (MQ=255) cTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTcc < 5:89606/149‑1 (MQ=255) ccATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGCTCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGACGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACgg > 1:257808/1‑149 (MQ=255) ccATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACgg > 1:262170/1‑149 (MQ=255) aTGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGATGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACgggg < 5:130078/149‑1 (MQ=255) aTGTGCGACTCCTCTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGGGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACgggg < 7:131087/149‑1 (MQ=255) cGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGA‑‑‑‑‑ACACCGgcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgc > 7:36339‑M1/1‑77 (MQ=255) cGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGA‑‑‑‑‑ACACCGgcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgc < 8:36339‑M1/134‑58 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCcggt > 8:204474‑M2/1‑105 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAAcc > 6:287294/1‑124 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAAcc < 5:287294/124‑1 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACgg < 1:240955/135‑1 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACgg > 2:240955/1‑135 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCCCAg > 5:54093/1‑149 (MQ=255) acaGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACggg > 8:265025/1‑122 (MQ=255) acaGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACggg < 7:265025/122‑1 (MQ=255) aCATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCt > 2:36645/1‑110 (MQ=255) gCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCcggtgttcgcggataaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcg < 8:36339‑M2/134‑78 (MQ=255) gCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCcggtgttcgcggataaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcg > 7:36339‑M2/1‑57 (MQ=255) gTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGt > 6:219041/1‑149 (MQ=255) tttACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCcggtgttcgcggataaactcgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccg < 6:314013‑M2/149‑98 (MQ=255) cgctctcgcgAAGATGCCACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCGTGGCCGTTGTTCGCGTATAAACCCGGTCGGTC‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGc < 8:123946/143‑1 (MQ=255) gcgAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCAAC‑GGGGGGGGGGCCCAGTCTCAACCTTGTTAACGGGCGTATTAGATGCGGCAGATGCCGAACGGCCGGTGCCatatag > 7:123946/1‑144 (MQ=37) gcatgGCACCGgcttcgccggtgtcatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcccgg > 3:29720‑M1/3‑11 (MQ=255) aGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcccgg < 7:181574‑M2/148‑108 (MQ=255) gATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttccc > 8:97389‑M2/1‑40 (MQ=255) gATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCcggtgtcatcttcgcggggaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgggcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgagagcg < 7:97389‑M2/148‑109 (MQ=255) aTGGCACCGgcttcgccggtgtcatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcccggcag > 8:45154‑M1/1‑9 (MQ=255) tGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGGGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTATATgc > 3:80705/1‑149 (MQ=255) tGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATgc < 5:219041/149‑1 (MQ=255) gACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCCAAGTCTGAACATTGTTAAAGGTGTTTTTCGATGCGCCACATGACAAACGGCAGTTCCCAGGGCTCAATgc > 2:301209/1‑148 (MQ=25) acacCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggagcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggactcgcacatggccaagcgttcccgcccggcagcc > 8:181574‑M2/1‑36 (MQ=255) acCGgcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaa > 8:204474‑M1/1‑4 (MQ=255) ccGgcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcccggcagccttca < 5:80704‑M1/149‑147 (MQ=255) | GGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATC > NC_002947/4583368‑4583658 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |