New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4734978 = | 32 (0.610) | 5 (0.100) | 5/240 | NT | 12.5% | coding (657/2832 nt) | sucA | 2‑oxoglutarate dehydrogenase subunit E1 |
? | NC_002947 | 4735020 = | 40 (0.800) | coding (615/2832 nt) | sucA | 2‑oxoglutarate dehydrogenase subunit E1 |
CCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAACCAGCTGCGCTGCTCGGAATCGACGATGTGGGTGAATTCG > NC_002947/4734832‑4735113 | tacgcgacatcttcgatgcactccagaacacatattgtcgcaccattggcgccgaattcacccacatcgtcgattccgagcagcgcagctggttccagcagcgcctggaaagcgtgcgcggccgtccggagtattccgctgacgtgCAg < 3:59904‑M1/3‑1 (MQ=255) cGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGcc < 4:344270/149‑1 (MQ=255) ccGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGt < 4:346508/149‑1 (MQ=255) cGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACgc‑gc > 1:154880/1‑149 (MQ=255) gACCTCCTTGGCGCCGTAATAGCCGGAAAGCTGGATCATTTCATCCATCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGTATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACcggcg < 2:121206/139‑1 (MQ=255) gACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCt > 2:108314/1‑149 (MQ=255) ggCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAgg < 8:181046/148‑1 (MQ=255) gcgcCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGt < 5:325251/148‑1 (MQ=255) attgtcgcaccattggcgccgaattcacccacatcgtcgattccgagcagcgcagctggttccagcagcgcctggaaagcgtgcgcggccgtccggagtattccgctgacgtgCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTg < 2:194831‑M1/36‑1 (MQ=255) gcaccattggcgccgaattcacccacatcgtcgattccgagcagcgcagctggttccagcagcgcctggaaagcgtgcgcggccgtccggagtattccgctgacgtgCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTg > 1:194831‑M1/108‑149 (MQ=255) agagCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGc < 3:185607/148‑1 (MQ=255) ggcgccgaattcacccacatcgtcgattccgagcagcgcagctggttccagcagcgcctggaaagcgtgcgcggccgtccggagtattccgctgacgtgCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGGGGGCCTGCACGTCa > 5:62036‑M1/100‑148 (MQ=255) cgccgaattcacccacatcgtcgattccgagcagcgcagctggttccagcagcgcctggaaagcgtgcgcggccgtccggagtattccgctgacgtgCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGc > 2:320899‑M1/98‑140 (MQ=255) cgccgaattcacccacatcgtcgattccgagcagcgcagctggttccagcagcgcctggaaagcgtgcgcggccgtccggagtattccgctgacgtgCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGc < 1:320899‑M1/43‑1 (MQ=255) gATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGc < 2:221228/121‑1 (MQ=255) gATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGc > 1:221228/1‑121 (MQ=255) tCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGcc < 2:154880/149‑1 (MQ=255) tCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGcc > 7:288068/1‑149 (MQ=255) ccAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCcg > 1:326358/1‑149 (MQ=255) gAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATa < 2:209105/127‑1 (MQ=255) gAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATa > 1:209105/1‑127 (MQ=255) ggCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAgg < 2:326358/149‑1 (MQ=255) gccgccTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGa > 8:127564/1‑86 (MQ=255) gccgccTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGa < 7:127564/86‑1 (MQ=255) gccgccTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCgctgc < 1:44895/148‑1 (MQ=255) gccTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGa < 6:296788/149‑1 (MQ=255) cTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAAc < 3:78073/149‑1 (MQ=255) cGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAACCAgctgcgc < 8:288068/149‑1 (MQ=255) gAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGCTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAACCAgctgcgct > 8:135604/1‑149 (MQ=255) aTCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAACCAgctgcgctgc > 7:193334/1‑149 (MQ=255) cTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAACCAGCTGCGCTGCTCg > 2:340545/1‑148 (MQ=255) ggTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAACCAGCTGCGCTGCTCGGAATCGACGAtg < 8:193334/149‑1 (MQ=255) tGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCTCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAACCAGCTGCGCTGCTCGGAATCGACGATGTgg < 5:234404/146‑1 (MQ=255) tGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAACCAGCTGCGCTGCTCGGAATCGACGATGTgg > 6:234404/1‑146 (MQ=255) ccAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAACCAGCTGCGCTGCTCGGAATCGACGATGTGGGTGAATTCg > 6:337532/1‑149 (MQ=255) cAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCAGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAACCAGCTGCGCTGCTCGGAATCGACGATGTGGGTGAATTCg > 1:53357/1‑149 (MQ=255) cAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAACCAGCTGCGCTGCTCGGAATCGACGAtgt < 4:93750/137‑1 (MQ=255) cAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAACCAGCTGCGCTGCTCGGAATCGACGAtgt > 3:93750/1‑137 (MQ=255) ttttCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAACCAGCTGCGCTGCTCGGAATCGACGATGTgg > 7:265121/1‑132 (MQ=255) ttttCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAACCAGCTGCGCTGCTCGGAATCGACGATGTgg < 8:265121/132‑1 (MQ=255) | CCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGC‑GCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCTGGAACCAGCTGCGCTGCTCGGAATCGACGATGTGGGTGAATTCG > NC_002947/4734832‑4735113 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |