| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4797177 = | 61 (1.150) | 4 (0.080) | 3/244 | NT | 6.2% | coding (806/1323 nt) | PP_4224 | sensor histidine kinase |
| ? | NC_002947 | 4797220 = | 62 (1.220) | coding (763/1323 nt) | PP_4224 | sensor histidine kinase | |||||
TACGCCGATTGTCGCCTCCGCCGGCATCCTGCACCGCCTGACGGGCCACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGG > NC_002947/4797031‑4797320 | tACGCCGATTGTCGCCTCCGCCGGCATCCTGCACCGCCTGACGGGCCACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTg < 4:100189/149‑1 (MQ=255)tACGCCGATTGTCGCCTCCGCCGGCATCCTGCACCGCCTGACGGGCCACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTg < 1:271683/149‑1 (MQ=255) ggtgctgtcgaccccgaaccagctgttcctgcgcattgcccagaccctcgagcgtgcgcggcgcctgcccgacgatgccgcgcatgaactgcgcagcccgctgaccgcgatcaagacccacctgcaggtggcgcgcatgaccgacgGTg > 5:284124‑M1/147‑149 (MQ=255) tgctggagacccagaaccagctgttcctgcgcattgcccagaccctcgagcgtgagcggcgcctgaccgacgatgccgcgcatgaactgcgcagcccgctgaccgcgatcaagacccacctgcaggtggcgcgcatgaccgacgGTGc > 8:279581‑M1/145‑148 (MQ=255) ccGATTGTCGCCTCCGCCGGCATCCTGCACCGCCTGACGGGCCACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCTGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCt < 1:245824/149‑1 (MQ=255) tCGCCTCCGCCGGCATCCTGCACCGCCTGACGGGCCACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCgg > 7:64006/1‑148 (MQ=255) ccTCCGCCGGCATCCTGCACCGCCTGACGGGCCACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCCTCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATg > 7:54092/1‑149 (MQ=255) ccTCCGCCGGCATCCTGCACCGCCTGACGGGCCACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATg > 4:311872/1‑149 (MQ=255) ccTCCGCCGGCATCCTGCACCGCCTGACGGGCCACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GAGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATg > 6:166937/1‑149 (MQ=255) gCATCCTGCACCGCCTGACGGGCCACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAgcgc > 4:40009/1‑149 (MQ=255) cACCGCCTGACGGGCCACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTcgc < 7:316606/149‑1 (MQ=255) gCCTGACGGGCCACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACCGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCAc < 6:72427/149‑1 (MQ=255) gCCTGACGGGCCACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCAc > 8:39835/1‑149 (MQ=255) gcccagaccctcgagcgtgagcggcgcctgaccgacgatgccgcgcatgaactgcgcagcccgctgaccgcgatcaagacccacctgcaggtggcgcgcatgaccgacgGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACg > 3:214814‑M1/110‑148 (MQ=255) gcccagaccctcgagcgtgagcggcgcctgaccgacgatgccgcgcatgaactgcgcagcccactgaccgcgatcaagacccacctgcaggtggcgcgcatgaccgacgGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACg > 1:326110‑M1/110‑148 (MQ=255) ccACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCg < 4:145553/113‑1 (MQ=255) ccACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCg > 3:145553/1‑113 (MQ=255) ccACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCg > 8:90364/1‑149 (MQ=255) aCCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCAc > 2:260203/1‑137 (MQ=255) aCCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCAc < 1:260203/137‑1 (MQ=255) tCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTcgc < 6:274982/127‑1 (MQ=255) gcTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCa < 8:64006/149‑1 (MQ=255) gcTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCa > 5:288653/1‑149 (MQ=255) cggcgcctgaccgacgatgccgcgcatgaactgcgcagcccgctgaccgcgatcaagacccacctgcaggtggcgcgcatgaccgacgGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCgg > 6:94250‑M1/89‑137 (MQ=255) cggcgcctgaccgacgatgccgcgcatgaactgcgcagcccgctgaccgcgatcaagacccacctgcaggtggcgcgcatgaccgacgGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCgg < 5:94250‑M1/49‑1 (MQ=255) tgcactgcacGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGACCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCt > 4:135890/1‑114 (MQ=255) tgcacGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAg > 2:211311/1‑149 (MQ=255) cacGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAg < 3:311872/147‑1 (MQ=255) cacGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGt > 5:322605/1‑149 (MQ=255) gCCATCCTCGAACGACCGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTggg < 7:10012/149‑1 (MQ=255) ccATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGt < 4:237676/149‑1 (MQ=255) cTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCCGGCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCtt > 1:179773/1‑148 (MQ=255) cTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCAc > 4:295192/1‑108 (MQ=255) cTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCAc < 3:295192/108‑1 (MQ=255) cTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGa > 7:79357/1‑149 (MQ=255) tCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTTCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATgcgcgc < 4:216095/128‑1 (MQ=255) tCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATgcgcgc > 3:216095/1‑128 (MQ=255) tCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGAt > 6:148279/1‑149 (MQ=255) aCGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATcgcg < 1:204266/149‑1 (MQ=255) aCGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATcgcg > 2:204266/1‑149 (MQ=255) gACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGt < 3:40009/149‑1 (MQ=255) ggCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGc < 2:179773/149‑1 (MQ=255) ggCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGc < 6:288653/149‑1 (MQ=255) gCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTc > 5:277159/1‑109 (MQ=255) gCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTc < 6:277159/109‑1 (MQ=255) tGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCGCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGGCATGCGCGCCACCAGCAGGGGGGTCTTGAAGGCGGGCAGCg > 7:53890/1‑147 (MQ=255) cTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTg < 5:148279/149‑1 (MQ=255) ccc‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCa < 6:322605/147‑1 (MQ=255) cc‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGt > 3:132209/1‑148 (MQ=255) gCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGcgcg < 7:90364/149‑1 (MQ=255) cATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCgg > 1:328719/1‑149 (MQ=255) aTCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCgg > 8:83167/1‑148 (MQ=255) tCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCa > 7:71129/1‑149 (MQ=255) aGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCAtc > 3:346806/1‑149 (MQ=255) gCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCTGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCAtcg > 4:287615/1‑149 (MQ=255) gCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCAtcg > 3:201748/1‑149 (MQ=255) aaCTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCAtcgtc > 5:313439/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAg > 1:106186/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAg > 5:192599/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAg > 4:118154/1‑149 (MQ=255) aaGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGgc < 1:211311/149‑1 (MQ=255) gCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTgc < 6:271824/117‑1 (MQ=255) gCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTgc > 5:271824/1‑117 (MQ=255) tGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGcgccgc < 8:79357/149‑1 (MQ=255) gTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCAc < 3:287615/149‑1 (MQ=255) aTGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCAtc < 6:222338/125‑1 (MQ=255) tGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTc > 8:24154/1‑148 (MQ=255) gCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATcgcg > 2:310546/1‑91 (MQ=255) cGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGa < 4:346806/148‑1 (MQ=255) ggTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAgg < 7:83167/149‑1 (MQ=255) ggTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAgg < 4:132209/149‑1 (MQ=255) | TACGCCGATTGTCGCCTCCGCCGGCATCCTGCACCGCCTGACGGGCCACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGG > NC_002947/4797031‑4797320 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |