| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4797177 = | 61 (1.150) | 4 (0.080) | 3/244 | NT | 6.2% | coding (806/1323 nt) | PP_4224 | sensor histidine kinase |
| ? | NC_002947 | 4797220 = | 62 (1.220) | coding (763/1323 nt) | PP_4224 | sensor histidine kinase | |||||
CCACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAGGAACAGCTGGTTCTGGGTCTCCAGCAAC > NC_002947/4797076‑4797365 | ccACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCg > 8:90364/1‑149 (MQ=255) gcTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCa < 8:64006/149‑1 (MQ=255) gcTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCa > 5:288653/1‑149 (MQ=255) cggcgcctgaccgacgatgccgcgcatgaactgcgcagcccgctgaccgcgatcaagacccacctgcaggtggcgcgcatgaccgacgGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCgg < 5:94250‑M1/49‑1 (MQ=255) cggcgcctgaccgacgatgccgcgcatgaactgcgcagcccgctgaccgcgatcaagacccacctgcaggtggcgcgcatgaccgacgGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCgg > 6:94250‑M1/89‑137 (MQ=255) tgcacGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAg > 2:211311/1‑149 (MQ=255) cacGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAg < 3:311872/147‑1 (MQ=255) cacGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGt > 5:322605/1‑149 (MQ=255) gCCATCCTCGAACGACCGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTggg < 7:10012/149‑1 (MQ=255) ccATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGt < 4:237676/149‑1 (MQ=255) cTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCCGGCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCtt > 1:179773/1‑148 (MQ=255) cTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGa > 7:79357/1‑149 (MQ=255) tCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTTCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATgcgcgc < 4:216095/128‑1 (MQ=255) tCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATgcgcgc > 3:216095/1‑128 (MQ=255) tCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGAt > 6:148279/1‑149 (MQ=255) aCGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATcgcg > 2:204266/1‑149 (MQ=255) aCGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATcgcg < 1:204266/149‑1 (MQ=255) gACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGt < 3:40009/149‑1 (MQ=255) ggCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGc < 6:288653/149‑1 (MQ=255) ggCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGc < 2:179773/149‑1 (MQ=255) gCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTc < 6:277159/109‑1 (MQ=255) gCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTc > 5:277159/1‑109 (MQ=255) tGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCGCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGGCATGCGCGCCACCAGCAGGGGGGTCTTGAAGGCGGGCAGCg > 7:53890/1‑147 (MQ=255) cTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTg < 5:148279/149‑1 (MQ=255) ccc‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCa < 6:322605/147‑1 (MQ=255) cc‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGt > 3:132209/1‑148 (MQ=255) gCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGcgcg < 7:90364/149‑1 (MQ=255) cATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCgg > 1:328719/1‑149 (MQ=255) aTCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCgg > 8:83167/1‑148 (MQ=255) tCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCa > 7:71129/1‑149 (MQ=255) aGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCAtc > 3:346806/1‑149 (MQ=255) gCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCTGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCAtcg > 4:287615/1‑149 (MQ=255) gCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCAtcg > 3:201748/1‑149 (MQ=255) aaCTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCAtcgtc > 5:313439/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAg > 4:118154/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAg > 1:106186/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAg > 5:192599/1‑149 (MQ=255) aaGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGgc < 1:211311/149‑1 (MQ=255) gCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTgc > 5:271824/1‑117 (MQ=255) gCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTgc < 6:271824/117‑1 (MQ=255) tGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGcgccgc < 8:79357/149‑1 (MQ=255) gTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCAc < 3:287615/149‑1 (MQ=255) aTGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCAtc < 6:222338/125‑1 (MQ=255) tGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTc > 8:24154/1‑148 (MQ=255) gCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATcgcg > 2:310546/1‑91 (MQ=255) ccgacggtgccgtgcgcgagcaggcgctggagcatgccgagcagggcacCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGcgccg < 5:94250‑M2/88‑1 (MQ=255) ccgacggtgccgtgcgcgagcaggcgctggagcatgccgagcagggcacCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGcgccg > 6:94250‑M2/50‑137 (MQ=255) cGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGa < 4:346806/148‑1 (MQ=255) ggTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAgg < 7:83167/149‑1 (MQ=255) ggTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAgg < 4:132209/149‑1 (MQ=255) TGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTgg > 2:328719‑M1/1‑149 (MQ=255) TGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGCCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTgg < 1:263101‑M1/149‑1 (MQ=255) CCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTggg > 4:201748‑M1/1‑148 (MQ=255) cgtgcgcgagcaggcgctggagcatgccgagcagggcacCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGTGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGc > 1:326110‑M2/40‑148 (MQ=255) cgtgcgcgagcaggcgctggagcatgccgagcagggcacCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGc > 3:214814‑M2/40‑148 (MQ=255) CCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGc < 7:71279‑M1/148‑1 (MQ=255) ggCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAg < 2:348430/114‑1 (MQ=255) ggCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAg > 1:348430/1‑114 (MQ=255) gCATGCTCCAGCTCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAg < 1:137667/149‑1 (MQ=255) cATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAgg < 2:106186/149‑1 (MQ=255) aTGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAGGa < 6:313439/149‑1 (MQ=255) tCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAGGAACAg > 2:307651/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAGGAACAg > 2:126691/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAGGAACAGc > 6:213236/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAGGAACAGc > 4:311536/1‑149 (MQ=255) gcgcCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAGGAACAGCTgg < 1:126691/149‑1 (MQ=255) cTGCTCCCGCACGGCACCGGCGGTCATGCGCGCCACCTGCTGGTGGGTCTTTATCGGGGTCTGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCAGCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAGTAACAGCTGGTTCt < 8:71279/149‑1 (MQ=255) cTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAg < 2:142081/132‑1 (MQ=255) cTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAg > 1:142081/1‑132 (MQ=255) cTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAGGAACAGCTGGTTCTgg < 5:213236/148‑1 (MQ=255) cTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAGGAACAGCTGGTTCTgg < 3:311536/148‑1 (MQ=255) cTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAGGAACAGCTGGTTCTg < 1:307651/147‑1 (MQ=255) cTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGAGCGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGTTCAGGCGCCGCTCCAGCAAGAGGGTCTGGGCAATGCGCAGGAACAGCAGCTTCTggg > 4:147074/1‑149 (MQ=255) gcacCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAGGAACAGCTGGTTCTGGGTCTCCAGCa > 8:279581‑M2/5‑148 (MQ=255) cacCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGGCAGGCGCCGCGCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAGGAACAGCTGGTTCGGGGTCGACAgcacc > 5:284124‑M2/4‑147 (MQ=255) | CCACCTGCTCGGCGCTGCACTGCACGCCATCCTCGAACGACAGGCTGCCTTCTACCC‑GCGCCAGCATCAGCAACTGCTCAAGCGTGCGGTGCATGCGGTCAGTGCCCTGCTCGGCATGCTCCAGCGCCTGCTCGCGCACGGCACCGTCGGTCATGCGCGCCACCTGCAGGTGGGTCTTGATCGCGGTCAGCGGGCTGCGCAGTTCATGCGCGGCATCGTCGGTCAGGCGCCGCTCACGCTCGAGGGTCTGGGCAATGCGCAGGAACAGCTGGTTCTGGGTCTCCAGCAAC > NC_002947/4797076‑4797365 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |