| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5443506 = | 69 (1.310) | 4 (0.080) | 4/234 | NT | 6.0% | coding (1274/1989 nt) | PP_4781 | sensor histidine kinase |
| ? | NC_002947 | 5443547 = | 61 (1.250) | coding (1233/1989 nt) | PP_4781 | sensor histidine kinase | |||||
TGGCATCGACCATATCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGC > NC_002947/5443360‑5443651 | tcaccatgtatgccagccagctgggttcggccttggaagtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTg > 6:337564‑M1/147‑149 (MQ=255) ccatgtatgccagccagctgggttcggccttggaagtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGc < 1:272138‑M1/5‑1 (MQ=255) atgtatgccagccagctgggttcggccttggaagtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAg < 6:241348‑M1/8‑1 (MQ=255) atgtatgccagccagctgggttcggccttggaagtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAg < 2:143313‑M1/8‑1 (MQ=255) atatCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTc < 5:54188/149‑1 (MQ=255) tCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTc < 7:69831/149‑1 (MQ=255) ccATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTcc > 3:203439/1‑149 (MQ=255) agatcttGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTc < 1:130271/146‑1 (MQ=255) catcatGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTcc < 4:2882/148‑1 (MQ=255) catcatGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTcc < 7:261049/148‑1 (MQ=255) tcatGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTc < 7:205763/149‑1 (MQ=255) tGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAgg < 2:112272/149‑1 (MQ=255) cTTGGGCAGACCCCACAGCCGTGTTATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGa > 7:217025/1‑149 (MQ=255) ttGGGCAGACCCCACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGAt > 6:126755/1‑149 (MQ=255) ttGGGCAGACCCCACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGAt > 2:150632/1‑149 (MQ=255) aGACCCCACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGACAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTg > 8:327785/1‑145 (MQ=255) aGACCCCACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGACAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTg < 7:327785/145‑1 (MQ=255) ccccACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTg < 4:164831/115‑1 (MQ=255) ccccACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTg > 3:164831/1‑115 (MQ=255) gaagtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGc > 3:55715‑M1/112‑149 (MQ=255) agtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCa > 7:20148‑M1/110‑149 (MQ=255) aGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGtt > 4:97161/1‑149 (MQ=255) ccGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTg > 4:260756/1‑148 (MQ=255) cGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCTACGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCGTTCAGGCGATTGCTCCTGGGCAGTTg > 1:109833/1‑147 (MQ=255) gtgtGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTc > 4:181313/1‑123 (MQ=255) aTGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTc < 5:216097/148‑1 (MQ=255) cttaGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGAGAGACAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGc < 8:217025/145‑1 (MQ=255) cTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAgg > 1:34663/1‑115 (MQ=255) cTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAgg < 2:34663/115‑1 (MQ=255) aGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTc > 7:250901/1‑147 (MQ=255) aGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGcc > 6:222410/1‑149 (MQ=255) cccccATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGc > 5:62423/1‑122 (MQ=255) cccccATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGc < 6:62423/122‑1 (MQ=255) ccccATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAg < 6:114337/149‑1 (MQ=255) ccATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAgtg > 7:254878/1‑149 (MQ=255) cATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGtt < 5:80427/128‑1 (MQ=255) cATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGtt > 6:80427/1‑128 (MQ=255) aacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttacgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTc < 3:194197‑M1/51‑1 (MQ=255) aacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttacgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTc > 4:194197‑M1/73‑123 (MQ=255) tCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTcg < 8:250901/149‑1 (MQ=255) aGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCaa < 3:260756/149‑1 (MQ=255) tgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAGGa < 7:124205‑M1/10‑1 (MQ=255) tgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAGGa > 8:124205‑M1/66‑75 (MQ=255) gggTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAg < 3:97161/149‑1 (MQ=255) tgCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCtg < 1:150632/149‑1 (MQ=255) gCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGt > 3:185489/1‑145 (MQ=255) gCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGt < 4:185489/145‑1 (MQ=255) cATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCtgtg > 5:125342/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGc > 8:23620/1‑149 (MQ=255) tCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGcc < 6:125342/149‑1 (MQ=255) gCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCctgc < 5:222410/149‑1 (MQ=255) cgagcgagCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCtgctgc > 7:14913/1‑149 (MQ=255) gagcgagcCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTgctgct > 8:106803/1‑149 (MQ=255) ccAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGt > 3:141629/1‑128 (MQ=255) ccAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGt < 4:141629/128‑1 (MQ=255) cAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAgg < 5:126755/149‑1 (MQ=255) aaTCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAg < 3:111963/124‑1 (MQ=255) aaTCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAg > 4:111963/1‑124 (MQ=255) aaTCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGc < 2:196509/149‑1 (MQ=255) aaTCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGc > 1:196509/1‑149 (MQ=255) aTCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCACGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCt < 4:203439/149‑1 (MQ=255) aCTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTcgc < 2:175263/115‑1 (MQ=255) aCTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTcgc > 1:175263/1‑115 (MQ=255) cTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGtt > 7:130276/1‑148 (MQ=255) cTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTg < 8:14913/149‑1 (MQ=255) tCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAGACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCa > 1:73375/1‑141 (MQ=255) tCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCctgctg > 8:138843/1‑132 (MQ=255) tCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCctgctg < 7:138843/132‑1 (MQ=255) tCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCa < 2:73375/140‑1 (MQ=255) tCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGa > 1:143313/1‑149 (MQ=255) aTCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCATCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCa > 2:187887/1‑88 (MQ=255) cgatctcGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAATGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATtcggtcgg < 3:316130/142‑1 (MQ=255) gggTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGtt < 3:213451/136‑1 (MQ=255) gggTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGtt > 4:213451/1‑136 (MQ=255) tACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGt > 1:54780/1‑149 (MQ=255) gCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTAAGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCTCGCAGGCTGTTGATGCGGTCgg > 4:316130/1‑141 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGa > 1:107148/1‑147 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGa > 5:241348/1‑147 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACa < 7:106803/149‑1 (MQ=255) gTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACa > 3:275386/1‑145 (MQ=255) gTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACa < 4:275386/145‑1 (MQ=255) tCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAg < 8:130276/149‑1 (MQ=255) tCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAg < 7:23620/149‑1 (MQ=255) aCGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAgg < 2:233210/148‑1 (MQ=255) aCGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAgg > 1:233210/1‑148 (MQ=255) aCGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGc < 2:107148/149‑1 (MQ=255) | TGGCATCGACCATATCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGC > NC_002947/5443360‑5443651 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |