New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5443506 = | 69 (1.310) | 4 (0.080) | 4/234 | NT | 6.0% | coding (1274/1989 nt) | PP_4781 | sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | 5443547 = | 61 (1.250) | coding (1233/1989 nt) | PP_4781 | sensor histidine kinase |
AGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGTGA > NC_002947/5443400‑5443692 | aGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGtt > 4:97161/1‑149 (MQ=255) ccGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTg > 4:260756/1‑148 (MQ=255) cGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCTACGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCGTTCAGGCGATTGCTCCTGGGCAGTTg > 1:109833/1‑147 (MQ=255) aTGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTc < 5:216097/148‑1 (MQ=255) cttaGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGAGAGACAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGc < 8:217025/145‑1 (MQ=255) aGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTc > 7:250901/1‑147 (MQ=255) aGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGcc > 6:222410/1‑149 (MQ=255) cccccATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGc > 5:62423/1‑122 (MQ=255) cccccATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGc < 6:62423/122‑1 (MQ=255) ccccATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAg < 6:114337/149‑1 (MQ=255) ccATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAgtg > 7:254878/1‑149 (MQ=255) cATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGtt < 5:80427/128‑1 (MQ=255) cATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGtt > 6:80427/1‑128 (MQ=255) aacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttacgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTc > 4:194197‑M1/73‑123 (MQ=255) aacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttacgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTc < 3:194197‑M1/51‑1 (MQ=255) tCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTcg < 8:250901/149‑1 (MQ=255) aGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCaa < 3:260756/149‑1 (MQ=255) gggTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAg < 3:97161/149‑1 (MQ=255) tgCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCtg < 1:150632/149‑1 (MQ=255) gCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGt > 3:185489/1‑145 (MQ=255) gCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGt < 4:185489/145‑1 (MQ=255) cATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCtgtg > 5:125342/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGc > 8:23620/1‑149 (MQ=255) tCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGcc < 6:125342/149‑1 (MQ=255) gCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCctgc < 5:222410/149‑1 (MQ=255) cgagcgagCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCtgctgc > 7:14913/1‑149 (MQ=255) gagcgagcCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTgctgct > 8:106803/1‑149 (MQ=255) ccAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGt < 4:141629/128‑1 (MQ=255) ccAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGt > 3:141629/1‑128 (MQ=255) cAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAgg < 5:126755/149‑1 (MQ=255) aaTCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAg > 4:111963/1‑124 (MQ=255) aaTCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAg < 3:111963/124‑1 (MQ=255) aaTCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGc > 1:196509/1‑149 (MQ=255) aaTCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGc < 2:196509/149‑1 (MQ=255) aTCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCACGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCt < 4:203439/149‑1 (MQ=255) aCTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTcgc < 2:175263/115‑1 (MQ=255) aCTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTcgc > 1:175263/1‑115 (MQ=255) cTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGtt > 7:130276/1‑148 (MQ=255) cTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTg < 8:14913/149‑1 (MQ=255) tCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAGACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCa > 1:73375/1‑141 (MQ=255) tCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCctgctg > 8:138843/1‑132 (MQ=255) tCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCctgctg < 7:138843/132‑1 (MQ=255) tCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCa < 2:73375/140‑1 (MQ=255) tCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGa > 1:143313/1‑149 (MQ=255) aTCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCATCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCa > 2:187887/1‑88 (MQ=255) cgatctcGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAATGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATtcggtcgg < 3:316130/142‑1 (MQ=255) gggTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGtt > 4:213451/1‑136 (MQ=255) gggTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGtt < 3:213451/136‑1 (MQ=255) tACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGt > 1:54780/1‑149 (MQ=255) gCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTAAGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCTCGCAGGCTGTTGATGCGGTCgg > 4:316130/1‑141 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGa > 1:107148/1‑147 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGa > 5:241348/1‑147 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACa < 7:106803/149‑1 (MQ=255) gaacctgcaactggccaggagcaatcgcctgaaggacgagttcctggccagTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGTAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGtt < 3:194197‑M2/72‑1 (MQ=255) gaacctgcaactggccaggagcaatcgcctgaaggacgagttcctggccagTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGTAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGtt > 4:194197‑M2/52‑123 (MQ=255) gTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACa > 3:275386/1‑145 (MQ=255) gTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACa < 4:275386/145‑1 (MQ=255) tCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAg < 8:130276/149‑1 (MQ=255) tCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAg < 7:23620/149‑1 (MQ=255) aCGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAgg < 2:233210/148‑1 (MQ=255) aCGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAgg > 1:233210/1‑148 (MQ=255) aCGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGc < 2:107148/149‑1 (MQ=255) TGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAg > 6:346071‑M1/1‑143 (MQ=255) TGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAg < 5:346071‑M1/143‑1 (MQ=255) tggccaggagcaatcgcctgaaggacgagttcctggccagTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACt > 7:20148‑M2/41‑149 (MQ=255) gccaggagcaatcgcctgaaggacgagttcctggccagTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTc > 3:55715‑M2/39‑149 (MQ=255) CCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAg > 1:190763‑M1/1‑136 (MQ=255) CCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAg < 2:190763‑M1/136‑1 (MQ=255) A‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCtgt > 6:124036‑M1/1‑81 (MQ=255) A‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCtgt < 5:124036‑M1/81‑1 (MQ=255) cTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGcc > 2:272138/1‑148 (MQ=255) gTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAAc > 4:242301/1‑149 (MQ=255) tCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCGAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGc > 1:233465/1‑132 (MQ=255) tCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGc < 2:233465/131‑1 (MQ=255) tCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGcc < 4:8375/144‑1 (MQ=255) tCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGcc > 3:8375/1‑144 (MQ=255) ttCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCaa < 2:235845/125‑1 (MQ=255) ttCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCaa > 1:235845/1‑125 (MQ=255) aTTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGctggctgg > 5:144192/1‑149 (MQ=255) cTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAgctggct > 7:2560/1‑143 (MQ=255) cTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAgctggct < 8:2560/143‑1 (MQ=255) tcctggccagTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCa < 7:124205‑M2/65‑1 (MQ=255) tcctggccagTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCa > 8:124205‑M2/11‑75 (MQ=255) ctggccagTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACAt < 6:241348‑M2/141‑1 (MQ=255) ctggccagTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACAt < 2:143313‑M2/141‑1 (MQ=255) cgggCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCNTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCGGTGACTGCTGCTAGCGCAGGCTGTTGCTTCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGTCCACTTCCAAGGCCGCACCCAGCTGGCTGGCATACag > 1:27847/3‑148 (MQ=255) gccagTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATgg < 1:272138‑M2/143‑1 (MQ=255) cagTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGtga > 6:337564‑M2/4‑149 (MQ=255) | AGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGTACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGA‑ACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTC‑AGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGTGA > NC_002947/5443400‑5443692 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |