New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6008533 = | 46 (0.870) | 4 (0.080) | 4/242 | NT | 8.4% | coding (819/1389 nt) | norM | multidrug resistance protein NorM |
? | NC_002947 | 6008577 = | 43 (0.850) | coding (863/1389 nt) | norM | multidrug resistance protein NorM |
CAAGGGCCTGTCACGCCCATCACTGGCGGCCCTGCGCGAGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGG > NC_002947/6008386‑6008680 | tcatcagcaggaacagcgttgcgaaggcaaacttgatcattgccccatacccgatgcccacccgcccggcgctgcgcgccgccagcaggttgccagcgccgtagtacaggccgacgcgcatggtcaccgcataggagaagccagtcgGc > 8:232167‑M1/148‑149 (MQ=255) cagcaggaacagcgtggcgaaggcaaacatgatcatggccccaaacccgatgcccacccgcccggcgctgcgcgccgccagcaggttgccagcgccgtagtacaggccgacgcgcatggtcaccgcataggacaagccagtcgGCACCa < 4:161927‑M1/6‑1 (MQ=255) aacagcgtggcgaaggcaaacatgatcatggccccaaacccgatgcccacccgcccggcgctgcgcgccgccagcaggttgccagcgccgtagtacaggccgacgcgcatggtcaccgcataggacaagccagtcgGCAc < 7:42546‑M1/4‑1 (MQ=255) aacagcgtggcgaaggcaaacatgatcatggccccaaacccgatgcccacccgcccggcgctgcgcgccgccagcaggttgccagcgccgtagtacaggccgacgcgcatggtcaccgcataggacaagccagtcgGCAc > 8:42546‑M1/137‑140 (MQ=255) aCGCCCATCACTGGCGGCCCTGCGCGAGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGccc < 2:113996/149‑1 (MQ=255) aCGCCCATCACTGGCGGCCCTGCGCGAGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGcc < 5:8727/148‑1 (MQ=255) gggccATCCCTGGCGGGCCTGCGCGTTGTGGGGGGGGTGGGGCTGGCGTTTGGCGGGTCCTTCATTGGGGTACGGGGCCTGTTCGCCGTCGGCGGGCTGTGGAAGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCt < 6:15200/146‑1 (MQ=255) gCCCATCACTGGCGGCCCTGCGCGAGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGCCGTGAGGGGCGGCCCCGAACTGGCGGCGCCCCAGATTGcccgg > 5:15200/1‑147 (MQ=255) ccATCACTGGCGGCCCTGCGCGAGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTg > 2:150029/1‑147 (MQ=255) aCTGGCGGCCCTGCGCGAGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCg > 2:61483/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGCCCTGCGCGAGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCgt > 4:190471/1‑149 (MQ=255) ggcCCTGCGCGAGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCa > 7:199937/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCGAGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACgg > 5:100031/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCGAGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACgg > 7:255995/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCGAGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACgg > 4:14566/1‑149 (MQ=255) tGCGCGAGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCa > 8:57027/1‑149 (MQ=255) gcgcGAGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCAt > 3:36581/1‑149 (MQ=255) gatcatggccccaaacccgatgcccacccgcccggcgctgcgcgccgccagcaggttgccagcgccgtagtacaggccgacgcgcatggtcaccgcataggacaagccagtcgGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCAtt < 2:3907‑M1/36‑1 (MQ=255) gAGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCAt < 8:199937/149‑1 (MQ=255) aGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATg < 3:190471/149‑1 (MQ=255) ccccaaacccgatgcccacccgcccggcgctgcgcgccgccagcaggttgccagcgccgtagtacaggccgacgcgcatggtcaccgcataggacaagccagtcgGCACCAGATTGCCCTGCCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTg > 1:3907‑M1/106‑149 (MQ=255) ggcTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTc > 1:186698/1‑127 (MQ=255) ggcTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTc < 2:186698/127‑1 (MQ=255) ggCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGc < 1:61483/147‑1 (MQ=255) ggCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCtt < 4:36581/149‑1 (MQ=255) cGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTAt < 7:57027/149‑1 (MQ=255) ttGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCgt > 2:31142/1‑109 (MQ=255) gCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGt < 6:89493/148‑1 (MQ=255) gTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGAcc < 8:255995/149‑1 (MQ=255) gTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGAcc < 6:100031/149‑1 (MQ=255) cATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATgcgc < 1:150029/148‑1 (MQ=255) cATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATgc < 6:155965/146‑1 (MQ=255) cATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATgc > 5:155965/1‑146 (MQ=255) tggAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGc > 5:326453/1‑149 (MQ=255) gTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGta < 3:14566/149‑1 (MQ=255) tGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGtac > 6:53732/1‑149 (MQ=255) cTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGt < 6:259514/122‑1 (MQ=255) cTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACgg > 6:133161/1‑149 (MQ=255) cagcgccgtagtacaggccgacgcgcatggtcaccgcataggacaagccagtcgGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGcc > 1:49424‑M1/55‑99 (MQ=255) cagcgccgtagtacaggccgacgcgcatggtcaccgcataggacaagccagtcgGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGcc < 2:49424‑M1/45‑1 (MQ=255) ttcgccttcgccGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCg > 8:110446/1‑133 (MQ=255) cttcgccGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGAATGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGc > 1:97353/1‑148 (MQ=255) cgcgCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCAt < 5:348220/114‑1 (MQ=255) cgcgCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCAt > 6:348220/1‑114 (MQ=255) cgcgCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACctgc > 7:207440/1‑149 (MQ=255) tGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGc > 1:169525/1‑74 (MQ=255) tGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGc < 2:169525/74‑1 (MQ=255) gggagcagcGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTTGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCcgggcg < 5:34407/146‑1 (MQ=255) aCCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTggg > 6:199714/1‑149 (MQ=255) cGAACTGTCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGc > 6:360980/1‑148 (MQ=255) cGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCa > 3:161927/1‑149 (MQ=255) aaCTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATc > 7:6001/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCgg < 8:6001/149‑1 (MQ=255) tGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCggg > 6:17892/1‑149 (MQ=255) cgcACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTggg < 5:133161/149‑1 (MQ=255) | CAAGGGCCTGTCACGCCCATCACTGGCGGCCCTGCGCGAGCTGTGGCGGCTGGGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGC‑AGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGG > NC_002947/6008386‑6008680 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |