New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6008533 = | 46 (0.870) | 4 (0.080) | 4/242 | NT | 8.4% | coding (819/1389 nt) | norM | multidrug resistance protein NorM |
? | NC_002947 | 6008577 = | 43 (0.850) | coding (863/1389 nt) | norM | multidrug resistance protein NorM |
GGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGTTTGCCTTCGCCACGCTGTTCCTGCTGCTGC > NC_002947/6008438‑6008723 | ggCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGc < 1:61483/147‑1 (MQ=255) ggCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCtt < 4:36581/149‑1 (MQ=255) cGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTAt < 7:57027/149‑1 (MQ=255) gCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGt < 6:89493/148‑1 (MQ=255) gTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGAcc < 6:100031/149‑1 (MQ=255) gTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGAcc < 8:255995/149‑1 (MQ=255) cATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATgcgc < 1:150029/148‑1 (MQ=255) cATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATgc > 5:155965/1‑146 (MQ=255) cATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATgc < 6:155965/146‑1 (MQ=255) tggAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGc > 5:326453/1‑149 (MQ=255) gTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGta < 3:14566/149‑1 (MQ=255) tGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGtac > 6:53732/1‑149 (MQ=255) cTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGt < 6:259514/122‑1 (MQ=255) cTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACgg > 6:133161/1‑149 (MQ=255) cagcgccgtagtacaggccgacgcgcatggtcaccgcataggacaagccagtcgGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGcc < 2:49424‑M1/45‑1 (MQ=255) cagcgccgtagtacaggccgacgcgcatggtcaccgcataggacaagccagtcgGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGcc > 1:49424‑M1/55‑99 (MQ=255) ttcgccttcgccGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCg > 8:110446/1‑133 (MQ=255) cttcgccGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGAATGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGc > 1:97353/1‑148 (MQ=255) cgcgCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCAt < 5:348220/114‑1 (MQ=255) cgcgCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCAt > 6:348220/1‑114 (MQ=255) cgcgCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACctgc > 7:207440/1‑149 (MQ=255) tGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGc > 1:169525/1‑74 (MQ=255) tGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGc < 2:169525/74‑1 (MQ=255) gggagcagcGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTTGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCcgggcg < 5:34407/146‑1 (MQ=255) aCCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTggg > 6:199714/1‑149 (MQ=255) cGAACTGTCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGc > 6:360980/1‑148 (MQ=255) cGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCa > 3:161927/1‑149 (MQ=255) aaCTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATc > 7:6001/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCgg < 8:6001/149‑1 (MQ=255) tGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCggg > 6:17892/1‑149 (MQ=255) ggcaccatgaatgccgtggacacgatctgcagggcaatctggtgcCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTg > 1:49424‑M2/46‑99 (MQ=255) ggcaccatgaatgccgtggacacgatctgcagggcaatctggtgcCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTg < 2:49424‑M2/54‑1 (MQ=255) cgcACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTggg < 5:133161/149‑1 (MQ=255) caccatgaatgccgtggacacgatctggcagggcaatctggtgcCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTgggg > 1:3907‑M2/45‑149 (MQ=255) CACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCATGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGc < 5:289723‑M1/149‑1 (MQ=255) CAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCAt > 5:199714‑M1/1‑149 (MQ=255) CAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCAt > 6:326453‑M1/1‑149 (MQ=255) ttGCCCTGCAGATCGTGTCCATGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGAt < 6:289723/148‑1 (MQ=255) ttGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATc < 5:17892/149‑1 (MQ=255) aatgccgtggacacgatctgcagggcaatctggtgcCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATc < 2:3907‑M2/113‑1 (MQ=255) cccTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGAGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATg > 3:45073/1‑149 (MQ=255) cTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTg < 8:62481/54‑1 (MQ=255) tGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTgg < 7:170227/133‑1 (MQ=255) tGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTgg > 8:170227/1‑133 (MQ=255) cAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGttt < 5:53732/147‑1 (MQ=255) aTCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGTTTGCCtt > 7:335087/1‑149 (MQ=255) cGTGTCCACGTCATTCTTGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTTACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCa < 6:45290/131‑1 (MQ=255) cGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTAACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGTCCa > 5:45290/1‑131 (MQ=255) gtCCACGGCATTCATGGAGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCGGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGTTTGCCTTCGCCa < 4:45073/149‑1 (MQ=255) cACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTg > 4:242570/1‑119 (MQ=255) cACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTg < 3:242570/119‑1 (MQ=255) cACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGTTTGCCTTCGCCACGc > 6:465/1‑149 (MQ=255) cATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGTTTGCCTTCGCCAc > 1:99230/1‑138 (MQ=255) cATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGTTTGCCTTCGCCAc < 2:99230/138‑1 (MQ=255) cATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGTTTGCCTTCGCCACGCTGTTCctg < 8:335087/148‑1 (MQ=255) aTGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGTTTGCCTTCGCCACGCTGTTCctgct < 8:207440/149‑1 (MQ=255) aTGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGTTTGCCTTCGCCACGCTGTTCctgct > 8:291298/1‑149 (MQ=255) aTGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGTTTGCCTTCGCCACGCTGTTCctgc < 1:76178/148‑1 (MQ=255) aTGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGTTTGCCTTCGCCACGCCGTTCctgc < 5:465/148‑1 (MQ=255) tggtgcCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGTTTGCCTTCGCCACGCTGTTCctgctg < 4:161927‑M2/143‑1 (MQ=255) gtgcCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGTTTGCCTTCGCCACGCTGtt > 8:42546‑M2/5‑140 (MQ=255) gtgcCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGTTTGCCTTCGCCACGCTGtt < 7:42546‑M2/136‑1 (MQ=255) gcCGACTGGCTTCTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTATGGGGCAATGATCAAGTTTGCCTTCGCAACGCTGTTcctgctgatga > 8:232167‑M2/3‑148 (MQ=255) | GGCCTGCCGATTGGCGGTACCTACATGGTGGAAGTGGGCCTGTTCGCCTTCGCCGCGCTGTGCATGGGCGTGCTGGGCAGCACCGAACTGGCGGCGCACCAGATTGCCCTGCAGATCGTGTCCACGGCATTCATGGTGCCGACTGGCTTGTCCTATGCGGTGACCATGCGCGTCGGCCTGTACTACGGCGCTGGCAACCTGCTGGCGGCGCGCAGCGCCGGGCGGGTGGGCATCGGGTTTGGGGCCATGATCATGTTTGCCTTCGCCACGCTGTTCCTGCTGCTGC > NC_002947/6008438‑6008723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |