| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2359112 = | 91 (1.720) | 5 (0.100) | 4/238 | NT | 5.6% | coding (70/924 nt) | PP_2074 | LysR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 2359186 = | 84 (1.700) | coding (144/924 nt) | PP_2074 | LysR family transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CACCCATGAACCGCAACGAACTGCGCAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGCCCTCAGCATGACCCATGATTTCGACCCGCTGAC > NC_002947/2359038‑2359332 | tcacctcttcggccctggccgagggctccatgcggttgcccactcgaaccagcagcgggtcgttgaacatcgcaCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGTAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTtgcgt > 1:103520‑M1/75‑149 (MQ=255)tcacctcttcggccctggccgagggctccatgcggttgcccactcgaaccaccagcgggtcgttgaacatcgcaCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTtgcgt > 7:154386‑M1/75‑149 (MQ=255) cccATGAACCGCAACGAACTGCGCAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTtgcgtgc < 3:67483/149‑1 (MQ=255) acctcttcggccctggccgagggctccatgcggttgcccactcgaaccagcagcgggtcgttgaacatcgcaCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTtgcgtg > 4:117217‑M1/73‑148 (MQ=255) tGAACCGCAACGAACTGCGCAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATg > 6:235346/1‑149 (MQ=255) aCCGCAACGAACTGCGCAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTc < 5:360907/149‑1 (MQ=255) aCCGCAACGAACTGCGCAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTc < 5:149468/149‑1 (MQ=255) ccGCAACGAACTGCGCAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTc > 7:12625/1‑148 (MQ=255) cGCAACGAACTGCGCAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCaa < 1:205538/149‑1 (MQ=255) cAACGAACTGCGCAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAAc > 8:257911/1‑148 (MQ=255) aaCGAACTGCGCAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAActa > 7:310504/1‑147 (MQ=255) aaCGAACTGCGCAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAAc > 3:326553/1‑147 (MQ=255) aaCGAACTGCGCAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAAc < 4:326553/147‑1 (MQ=255) aaCGAACTGCGCAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGa < 7:213450/149‑1 (MQ=255) aaCGAACTGCGCAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGa > 6:186671/1‑149 (MQ=255) cgcAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCgctgct > 4:200067/1‑149 (MQ=255) gcAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCgctgct < 3:52033/148‑1 (MQ=255) gcAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCgctgct > 4:52033/1‑148 (MQ=255) 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gATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGt > 6:101528/1‑149 (MQ=255) atCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTgg < 4:69948/148‑1 (MQ=255) tCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTggg < 5:186671/148‑1 (MQ=255) ccTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAAcc < 2:88744/149‑1 (MQ=255) tGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTgg > 7:172561/1‑141 (MQ=255) tGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTgg < 8:172561/141‑1 (MQ=255) gATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCa > 8:23268/1‑149 (MQ=255) aTGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTGGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGGTCGAGTGGGCAACCGc < 6:85125/147‑1 (MQ=255) gtggtgTTCGAAGCGCTGATGCAGGATCGGAACCTCACCCGTGCAGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGGGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGa < 8:310504/149‑1 (MQ=255) tgtTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGAc < 8:272556/113‑1 (MQ=255) tgtTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGAc > 7:272556/1‑113 (MQ=255) tgtTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGa > 2:349201/1‑145 (MQ=255) cGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCgg > 8:111147/1‑149 (MQ=255) gcgcTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAg < 4:228424/149‑1 (MQ=255) cTGATGCAGGAGCGCAACGTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAg < 2:44936/118‑1 (MQ=255) cTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGc > 1:24308/1‑123 (MQ=255) cTGATGCAGGAGCGCAACCTCACACGTGCCGCGCAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCAGCTGGTACGAg > 1:44936/1‑118 (MQ=255) 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cAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAag < 7:111147/148‑1 (MQ=255) aGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGt < 2:324750/112‑1 (MQ=255) aGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGc < 2:4685/129‑1 (MQ=255) aGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGc > 1:4685/1‑129 (MQ=255) gcgcAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGTGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGa < 6:224201/149‑1 (MQ=255) cacgcaacctggccagcgcggcgctgaccgtgggctgggcgacgaacagcttctccgcggcacgggtgaggttgcgTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGt > 4:117217‑M2/77‑148 (MQ=255) 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7:259965/148‑1 (MQ=255) gcccagc‑ccaCGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGAtgtctgt > 4:123224/1‑149 (MQ=255) gcccagc‑ccaCGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGAtgtctgt > 5:108047/1‑149 (MQ=255) cccagc‑ccaCGGTCAGTGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAg > 6:64493/1‑69 (MQ=255) cccagc‑ccaCGGTCAGTGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAg < 5:64493/69‑1 (MQ=255) cccagc‑ccaCGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGAtgtctgtc < 6:313303/149‑1 (MQ=255) cagc‑ccaCGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGCAGAGGTGATCAAGTACCTCCCGCCAGCCTTGGATGCCATGTCTGTCGc > 5:66723/1‑149 (MQ=255) cagc‑ccaCGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGc > 5:71764/1‑149 (MQ=255) ccaCGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGCCCt > 8:318384/1‑148 (MQ=255) caCGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGCCCTCa < 2:206964/149‑1 (MQ=255) tCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATc < 2:344989/101‑1 (MQ=255) aGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGCCCTCAGCATGAc > 8:142386/1‑149 (MQ=255) ccgcGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGCCCTCAGCATGACCCAt > 3:60921/1‑149 (MQ=255) cgcgCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGATCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCTCCCTCAGCATGACCCAt > 6:207318/1‑148 (MQ=255) gcgcTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGTAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATg > 2:215905/1‑118 (MQ=255) gcgcTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGTAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATg < 1:215905/118‑1 (MQ=255) tGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGCCCTCAGCATGACCCATGATTTc < 5:8598/149‑1 (MQ=255) gCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGCCCTCAGCATGACCCATGATTTCGa > 5:156959/1‑149 (MQ=255) gCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGCGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGCCCTCAGCATGACCCATGATTTCGa > 2:147133/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGCCCTCAGCATGa < 3:248724/135‑1 (MQ=255) ccAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGCCCTCAGCATGa > 4:248724/1‑135 (MQ=255) ccAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGCCCTCAGCATGACCCATGATTTCGAc < 2:212336/149‑1 (MQ=255) gttgcgTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGCCCTCAGCATGACCCATGATTTCGACCCGc > 1:164060‑M2/7‑149 (MQ=255) gcgTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGCCCTCAGCATGACCCATGATTTCGACCCGCTGa > 8:14138‑M2/4‑149 (MQ=255) cgTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGCCCTCAGCATGACCCATGATTTCGACCCGCTGAc < 3:123224‑M2/147‑1 (MQ=255) | CACCCATGAACCGCAACGAACTGCGCAAAGCCGATATCAACCTGATGGTGGTGTTCGAAGCGCTGATGCAGGAGCGCAACCTCACCCGTGCCGCGGAGAAGCTGTTCGTCGCCCAGC‑CCACGGTCAGCGCCGCGCTGGCCAGGTTGCGTGCGATGTTCAACGACCCGCTGCTGGTTCGAGTGGGCAACCGCATGGAGCCCTCGGCCAGGGCCGAAGAGGTGATCAAGTACCTCACGCCAGCCTTGGATGCGATGTCTGTCGCCCTCAGCATGACCCATGATTTCGACCCGCTGAC > NC_002947/2359038‑2359332 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |