| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3115542 = | 36 (0.680) | 4 (0.080) | 4/238 | NT | 9.8% | coding (280/1527 nt) | PP_2732 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 3115585 = | 40 (0.810) | coding (323/1527 nt) | PP_2732 | hypothetical protein | |||||
CAGGCCCTGCGTGAACGGGGTTGGCAGGTGCACTATGTCGAACTGGACGCCGAGGGTAACAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGCCAGCTGCGTATGGAGCACTTCTACCGTGGCATGCGCAAGC > NC_002947/3115437‑3115728 | ctggCCCTGCGTGAACGGGGTTGGCAGGTGCACTATGTCGAACTGGACGCCGAGGGTAACAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGAGGGCAACAAGCCTTGTGCGCCACCCACATTCTCTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCt < 1:244021/147‑1 (MQ=255)cAGGCCCTGCGTGAAGGGGGTTGGCAGGTGCACTATGTCGAACTGGACGCCGAGGGTAACAGCGGCAGGATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCt < 2:115105/149‑1 (MQ=255) ccTGCGTGAACGGGGTTGGCAGGTGCACTATGTCGAACTGGACGCCGAGGGTAACAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTg < 3:261177/145‑1 (MQ=255) ccTGCGTGAACGGGGTTGGCAGGTGCACTATGTCGAACTGGACGCCGAGGGTAACAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTg > 4:261177/1‑145 (MQ=255) ggggTTGGCAGGTGCACTATGTCGAACTGGACGCCGAGGGTAACAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGt > 8:162921/1‑149 (MQ=255) gTGCACTATGTCGAACTGGACGCCGAGGGTAACAGCGGCGGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACt < 3:251473/149‑1 (MQ=255) gTGCACTATGTCGAACTGGACGCCGAGGGTAACAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACt < 7:162921/149‑1 (MQ=255) cACTATGTCGAACTGGACGCCGAGGGTACCAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGcc < 6:238291/149‑1 (MQ=255) tATGTCGAACTGGACGCCGAGGGTAACAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCt > 1:103450/1‑149 (MQ=255) tGTCGAACTGGACGCCGAGGGTAACAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGcc > 5:257680/1‑124 (MQ=255) tGTCGAACTGGACGCCGAGGGTAACAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGcc < 6:257680/124‑1 (MQ=255) gAACTGGACGCCGAGGGTAACAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTtgtgtg > 6:240535/1‑149 (MQ=255) aaCTGGACGCCGAGGGTAACAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTgg < 2:98965/149‑1 (MQ=255) gACGCCGAGGGTAACAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTcg > 8:298731/1‑149 (MQ=255) gAGGGTAACAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGacac > 7:234937/1‑149 (MQ=255) tAACAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGtt < 8:234937/149‑1 (MQ=255) aTCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCtt < 1:51036/114‑1 (MQ=255) aTCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCtt > 2:51036/1‑114 (MQ=255) aTCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCg < 5:240535/149‑1 (MQ=255) gCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGgc > 4:342529/1‑149 (MQ=255) cATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGgcg > 7:312859/1‑149 (MQ=255) gATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTgg < 8:312859/149‑1 (MQ=255) aTGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTtgtgt > 4:319394/1‑98 (MQ=255) aTGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTtgtgt < 3:319394/98‑1 (MQ=255) aTGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCggg > 8:210278/1‑142 (MQ=255) aTGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTGTCGCGACCCGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCggg < 7:210278/142‑1 (MQ=255) tGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGc < 7:298731/149‑1 (MQ=255) aacaaGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCg < 3:49944/70‑1 (MQ=255) aacaaGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCg > 4:49944/1‑70 (MQ=255) aacaaGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCca > 8:144287/1‑147 (MQ=255) gcgccactcaccgcactcggtcaagtgaatgtgggtggcgccTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGCCAg > 1:124267‑M2/43‑149 (MQ=255) gccactcaccgcactcggtcaagtgaatgtgggtggcgccTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCTCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTgg > 2:233663‑M2/41‑129 (MQ=255) gccactcaccgcactcggtcaagtgaatgtgggtggcgccTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTgg < 1:233663‑M2/89‑1 (MQ=255) GCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGCCAGCt > 7:144287‑M1/1‑149 (MQ=255) ccacATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTggg < 2:242135/125‑1 (MQ=255) ccacATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTggg > 1:242135/1‑125 (MQ=255) ccacATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTc < 2:249620/137‑1 (MQ=255) ccacATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTc > 1:249620/1‑137 (MQ=255) ccgcactcggtcaagtgaatgtgggtggcgccTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGCCAGCTGCGTATgg < 2:124267‑M2/117‑1 (MQ=255) ttCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGCCAGCTGCGTATGGAg < 2:103450/149‑1 (MQ=255) aCTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATTCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTc < 1:258094/129‑1 (MQ=255) aCTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTc > 2:258094/1‑129 (MQ=255) aCTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGCCAGCt > 2:174690/1‑136 (MQ=255) aCTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGCCAGCt < 1:174690/136‑1 (MQ=255) cTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTgg > 6:191541/1‑115 (MQ=255) cTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTgg < 5:191541/115‑1 (MQ=255) ttGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCAATGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGCCAGCTGCGTATGGAGCACtt > 6:279174/1‑149 (MQ=255) aGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGCCAGCTGCGTATGGAGCa > 3:192037/1‑139 (MQ=255) aGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGCCAGCTGCGTATGGAGCa < 4:192037/139‑1 (MQ=255) gTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGCCAGCTGCGTATGGAGCACTTCTACCGTg > 2:148878/1‑144 (MQ=255) gTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGCCAGCTGCGTATGGAGCACTTCTACCGTg < 1:148878/144‑1 (MQ=255) gagcCTGCAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGAACTGAAGCTTGTGTGCTTTCGCGACACGCGTTTACAGTGCTCACGTGAAGACTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGACAGCTGCGTATGGAGCACTACTACCGTGGCATGCGCAAGc > 2:301183/3‑149 (MQ=255) tGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGCCAGCTGCGTATGGAGCACTTCTACCGTGGc > 2:232444/1‑134 (MQ=255) tGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGCCAGCTGCGTATGGAGCACTTCTACCGTGGc < 1:232444/134‑1 (MQ=255) | CAGGCCCTGCGTGAACGGGGTTGGCAGGTGCACTATGTCGAACTGGACGCCGAGGGTAACAGCGGCAGCATCGTGGGTGAGTTGCATCGATGGCAACAAGCCTTGGGCGCCACCCACATTCACTTGACCGAGTGCGGTGAGTGGCGCCTGGAGCAGGCCTTGCGTGATGCCGCACTGCCGCTTGTGTGGTTTCGCGACACGCGTTTTCTGTGCTCCCGTGAAGCCTTCGGGCGCTGGGCCACAGAACGTCGCCAGCTGCGTATGGAGCACTTCTACCGTGGCATGCGCAAGC > NC_002947/3115437‑3115728 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |