New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4518349 | 61 (1.150) | 5 (0.100) | 5/246 | NT | 7.9% | coding (1171/2271 nt) | clpA | ATP‑dependent serine protease |
? | NC_002947 | = 4518384 | 57 (1.110) | coding (1136/2271 nt) | clpA | ATP‑dependent serine protease |
ACATCAATGCGCTTGACGCGACTGGCCTCTGGCTGCAGGCGCTGGTAGGCGCCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTGGAAGCGACGCGCCAGGGCACGATCCTTCTCGAAGATGCCGCGAAA > NC_002947/4518240‑4518529 | acaTCAATGCGCTTGACGCGACTGGCCTCTGGCTGCAGGCGCTGGTAGGCGCCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGTGCGCAGGGCTTCGTcgct < 2:129700‑M2/149‑5 (MQ=255) cgcTTGACGCGACTGGCCTCTGGCTGCAGGCGCTGGTAGGCGCCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGa < 2:16860/148‑1 (MQ=255) gcTTGACGCGACTGGCCTCTGGCTGCAGGCGCTGGTAGGCGCCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTc < 4:268016/145‑1 (MQ=255) gcTTGACGCGACTGGCCTCTGGCTGCAGGCGCTGGTAGGCGCCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGa > 3:268016/1‑147 (MQ=255) gACGCGACTGGCCTCTGGCTGCAGGCGCTGGTAGGCGCCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGTGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGAtgtt < 1:129700/147‑1 (MQ=255) gACGCGACTGGCCTCTGGCTGCAGGCGCTGGTAGGCGCCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGAtgtt < 4:239343/147‑1 (MQ=255) aCGCGACTGGCCTCTGGCTGCAGGCGCTGGTAGGCGCCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCATTTTATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGAtgttg < 1:100816/148‑1 (MQ=255) gcgACTGGCCTCTGGCTGCAGGCGCTGGTAGGCGCCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTTGTCGCTGTACTCGATGTTgtggt < 5:38599/149‑1 (MQ=255) ctctGGCTGCAGGCGCTGGTAGGCGCCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCg > 6:159954/1‑148 (MQ=255) tctGGCTGCAGGCGCTGGTAGGCGCCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGa > 6:339033/1‑148 (MQ=255) aGGCGCTGGTAGGCGCCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCttt < 4:117239/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGTAGGCGCCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCa < 4:212366/149‑1 (MQ=255) gTAGGCGCCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCcgc < 5:339033/149‑1 (MQ=255) gcCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGaa > 6:346085/1‑149 (MQ=255) gcCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGaa > 4:244829/1‑149 (MQ=255) cAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTtcgt < 1:185329/93‑1 (MQ=255) cAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTtcgt > 2:185329/1‑93 (MQ=255) tcgtcgATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGACGGACA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCCGAAGCGGCGCGCAGCGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTCGTGCCTTTCCAAACGCCCTTTCAGGCAGCGCAGAATGCCCAc > 3:145283/1‑149 (MQ=255) tCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCt > 1:214704/1‑149 (MQ=255) acaTCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTc > 3:112914/1‑149 (MQ=255) aTCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAATCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGa > 8:133239/1‑149 (MQ=255) aTCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACg < 7:298329/139‑1 (MQ=255) aTCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACg > 8:298329/1‑139 (MQ=255) tCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGAc < 2:214704/149‑1 (MQ=255) aTGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGaa < 1:107009/127‑1 (MQ=255) aTGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGaa > 2:107009/1‑127 (MQ=255) tccTTGTCAGTCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCTCGAAGCCATTTCGGCAGCGGCGCTCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGTCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATgg < 6:175896/148‑1 (MQ=255) gCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATgg > 6:204142/1‑149 (MQ=255) ccTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCttt < 5:363351/96‑1 (MQ=255) ccTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCttt > 6:363351/1‑96 (MQ=255) ccTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTc > 4:65789/1‑139 (MQ=255) ccTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTc < 3:65789/139‑1 (MQ=255) cTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCt > 8:213720/1‑149 (MQ=255) tCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCt > 3:346448/1‑149 (MQ=255) gCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGAt > 4:180068/1‑137 (MQ=255) gCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACa > 1:134516/1‑149 (MQ=255) gCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACa > 6:169716/1‑149 (MQ=255) tgtgTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATcc < 3:244829/149‑1 (MQ=255) gtCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCt > 3:51298/1‑139 (MQ=255) gtCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCt < 4:51298/139‑1 (MQ=255) tCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCt > 7:254282/1‑149 (MQ=255) tCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCt > 6:54384/1‑149 (MQ=255) ggTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTc < 4:346448/149‑1 (MQ=255) a‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCtt < 1:125529/116‑1 (MQ=255) a‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCtt > 2:125529/1‑116 (MQ=255) a‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTgg > 6:19735/1‑148 (MQ=255) ttGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTGGaa < 4:112914/149‑1 (MQ=255) tGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGAt > 5:352846/1‑122 (MQ=255) tGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGAt < 6:352846/122‑1 (MQ=255) tGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTGGAAg > 5:78589/1‑149 (MQ=255) aTGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTcgctacatcaatgaccgacacatgcctgacaaggccatcgatgtgatcgacgaggctggcgcctaccagcgcctgcagccaga > 1:40596‑M2/1‑43 (MQ=255) aTGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTcgctacatcaatgaccgacacatgcctgacaaggccatcgatgtgatcgacgaggctggcgcctaccagcgcctgcagccaga < 2:40596‑M2/126‑84 (MQ=255) gTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTCTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTGGAAGCGAc > 1:245581/1‑149 (MQ=255) aGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTGGAAGCGAcgc > 1:310790/1‑149 (MQ=255) gcgcGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTcgctacatcaatgaccgacacatgcctgacaaggccatcgatgtgatcgacgaggctggcgcctaccagcgcctgcagccagaggccagtcgcgtcaagcgcattgatgtg < 3:45057‑M2/149‑112 (MQ=255) gcgcGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTGGAAGCGAcgcg > 8:106084/1‑149 (MQ=255) gcgAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTGGAAGCGACGCGcc < 2:310790/149‑1 (MQ=255) gCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTGGAAGCGACGCGCCAGGGc < 5:346085/149‑1 (MQ=255) cAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTcgctacatcaatgaccgacacatgcctgacaaggccatcgatgtgatcgacgaggctggcgcctaccagcgcctgcagccagag < 1:48672‑M2/113‑85 (MQ=255) cAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTcgctacatcaatgaccgacacatgcctgacaaggccatcgatgtgatcgacgaggctggcgcctaccagcgcctgcagccagag > 2:48672‑M2/1‑29 (MQ=255) cAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTGGAAGCGACGCGCCAGGGCAc > 3:173597/1‑149 (MQ=255) gTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTGGAAGCGACGCGCCAGGGCACGa < 7:213720/149‑1 (MQ=255) cGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTGGAAGCGACGCGCCAGGGCACGATc < 5:159954/148‑1 (MQ=255) aGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTGGAAGCGACGCGCCAGGGCACGATCCTtct < 5:169716/149‑1 (MQ=255) aGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCTCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTGGAAGCGACGCGCCAGGGCACGATCCTTCTCGAAGATGcc < 8:254282/149‑1 (MQ=255) ttCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTGGAAGCGACGCGCCAGGGCACGATCCTTCTCGAAGATGCCGCGa > 7:155791/1‑148 (MQ=255) cgtcgCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCTCGGTGTCTTCGACCGATGGCTGGGTGACATCCACCTTGTGGAAGCGACGCGCCAGGGCACGATCCTTCTCGATGATGCCGCGaaa < 4:145283/148‑1 (MQ=255) | ACATCAATGCGCTTGACGCGACTGGCCTCTGGCTGCAGGCGCTGGTAGGCGCCAGCCTCGTCGATCACATCGATGGCCTTGTCAGGCATGTGTCGGTCA‑TTGATGTAGCGCGAAGCCAGTTCGGCAGCGGCGCGCAGGGCTTCGTCGCTGTACTCGATGTTGTGGTGGCTTTCGAAACGCCCTTTCAGGCCGCGCAGAATGCCCACGGTGTCTTCGACCGATGGCTCGCTGACATCCACCTTCTGGAAGCGACGCGCCAGGGCACGATCCTTCTCGAAGATGCCGCGAAA > NC_002947/4518240‑4518529 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |