New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5792613 = | 50 (0.950) | 4 (0.080) | 3/236 | NT | 7.5% | coding (718/1419 nt) | gltD | glutamate synthase subunit beta |
? | NC_002947 | 5792679 = | 52 (1.060) | coding (652/1419 nt) | gltD | glutamate synthase subunit beta |
GGAAGTCCAGTGCGTCATGCACGCCCGGCAGGTCTTCACCCGGGAAGCCGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCG > NC_002947/5792532‑5792823 | ggAAGTCCAGTGCGTCATGCACGCCCGGCAGGTCTTCACCCGGGAAGCCGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAgg > 4:146196/1‑149 (MQ=255) cAGTGCGTCATGCACGCCCGGCAGGTCTTCACCCGGGAAGCCGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACt > 7:153049/1‑149 (MQ=255) cGTCATGCACGCCCGGCAGGTCTTCACCCGGGAAGCCGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑t < 2:88911/148‑1 (MQ=255) aTGCACGCCCGGCAGGTCTTCACCCGGGAAGCAGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCTCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTAC‑ATGGTCACATCCTTGCACACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCa > 5:1253/1‑149 (MQ=255) aCGCCCGGCAGGTCTTCACCCGGGAAGCCGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGcc > 3:132077/1‑149 (MQ=255) aCGCCCGGCAGGTCTTCACCCGGGAAGCCGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGcc > 2:232982/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCAGGTCTTCACCCGGGAAGCCGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑c < 1:305931/128‑1 (MQ=255) gCCCGGCAGGTCTTCACCCGGGAAGCCGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑c > 2:305931/1‑128 (MQ=255) gCCCGGCAGGTCTTCACCCGGGAAGCCGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCgg > 1:11113/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCAGGTCTTCACCCGGGAAGCCGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCgg < 8:153049/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGGTCTTCACCCGGGAAGCCGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGt > 8:294020/1‑148 (MQ=255) ggCAGGTCTTCACCCGGGAAGCCGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGaa > 2:78303/1‑149 (MQ=255) ttCACCCGGGAAGCCGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCA‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGTTGAACACTTCAc > 8:318198/1‑149 (MQ=255) aaGCCGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCt < 4:132077/149‑1 (MQ=255) ccgccCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGGCCGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGa < 1:78303/149‑1 (MQ=255) ccgccCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGACTGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGa < 1:232982/149‑1 (MQ=255) ttCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGt > 8:304532/1‑149 (MQ=255) ttCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGt > 2:61935/1‑149 (MQ=255) cATGTATGAGTAGGTACCCATGCACATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTGAGG‑CGTAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGt < 6:1253/147‑1 (MQ=255) aggtgtaggtACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTc < 7:318198/148‑1 (MQ=255) aggtctagctACCCATGACCATGAACACCGCGACGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTCTTCAGC‑CGGAACTAGA‑TGCCCAAGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTAGCTGAGCACGGACATTTc > 4:66364/1‑148 (MQ=255) ggtgtaggtACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTcc < 3:146196/148‑1 (MQ=255) ggtgtaggtACCCATGCCCATGAACACAGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTc > 8:320041/1‑147 (MQ=255) tgtaggtACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGc > 3:48955/1‑149 (MQ=255) tgtaggtACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGc < 2:11113/149‑1 (MQ=255) gtaggtACCCATGACCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCCTGAGGTCACATCATTCCCCACCTCGGTGTTAAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCATGGTATTTTCCAg > 1:92159/1‑148 (MQ=255) catgcccatgAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCgg < 7:294020/149‑1 (MQ=255) atgcccatgAACACCGCGTCGTACTCGGCGCGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTCTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCggg > 5:7713/1‑149 (MQ=255) cccatgAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACtt > 4:339129/1‑103 (MQ=255) ccatgAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATa > 3:344221/1‑149 (MQ=255) tgaacaccgaggtgggcaaggatgtgaccatggaacagctgctcgccgagtacgacgcggtgttcaGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATAcc > 5:326450‑M2/67‑148 (MQ=255) tgaacaccgaggtgggcaaggatgtgaccatggaacagctgctcgccgagtacgacgcggtgttcaGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATAcc > 8:7517‑M2/67‑148 (MQ=255) CACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAgg > 7:304532‑M1/1‑149 (MQ=255) CGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGa < 4:161232‑M1/128‑1 (MQ=255) CGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGa > 3:161232‑M1/1‑128 (MQ=255) tCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCAcc > 8:29922/1‑149 (MQ=255) gatgtgaccatggaacagctgctcgccgagtacgacgcggtgttcaGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGAt < 6:326450‑M2/103‑1 (MQ=255) cagcTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTTAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCa < 3:66364/148‑1 (MQ=255) cagcTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGaa > 1:293443/1‑126 (MQ=255) cagcTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGaa < 2:293443/126‑1 (MQ=255) agcTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAgg < 4:48955/149‑1 (MQ=255) gcTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATAc < 6:14693/120‑1 (MQ=255) gcTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATAc > 5:14693/1‑120 (MQ=255) accatggaacagctgctcgccgagtacgacgcggtgttcaGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAgg < 7:7517‑M2/109‑1 (MQ=255) cTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGt > 2:28497/1‑149 (MQ=255) cTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGt > 3:55919/1‑149 (MQ=255) ttCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGtttt > 3:143921/1‑149 (MQ=255) ttCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGttt < 4:344221/148‑1 (MQ=255) cc‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTg > 2:157732/1‑149 (MQ=255) c‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTg < 4:55919/148‑1 (MQ=255) aTGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAgg < 7:293156/140‑1 (MQ=255) aTGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAgg > 8:293156/1‑140 (MQ=255) tGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGttt > 1:106806/1‑143 (MQ=255) tGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGttt < 2:106806/143‑1 (MQ=255) tCACATCCTTGCCCACCTCGGTGGTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAg > 4:186734/1‑135 (MQ=255) tCACATCCTTGCCCACCTCGGTGCTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAATGTCAGCAGGCCACCGATCTCAg < 3:186734/135‑1 (MQ=255) acaTGCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAaca < 7:320041/148‑1 (MQ=255) aTCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCAcc < 2:32543/123‑1 (MQ=255) aTCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCAcc > 1:32543/1‑123 (MQ=255) cTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACaccacc < 1:61935/148‑1 (MQ=255) ttGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCgg > 4:166422/1‑149 (MQ=255) gCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCggg < 3:127586/148‑1 (MQ=255) aCCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTAc > 8:211289/1‑149 (MQ=255) aCCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTAGAACACCACCGGGGTTAc > 5:168975/1‑149 (MQ=255) tCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTAcccc > 4:259402/1‑149 (MQ=255) gtgttcaGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGgc < 3:166422‑M2/142‑1 (MQ=255) ttcaGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGgcgcg > 1:241270‑M2/5‑149 (MQ=255) | GGAAGTCCAGTGCGTCATGCACGCCCGGCAGGTCTTCACCCGGGAAGCCGCCCTTCATGTAGGTGTAGGTACCCATGCCCATGAACACCGCGTCGTACTCGGCGAGCAGCTGTTCC‑ATGGTCACATCCTTGCCCACCTCGGTGTTCAGG‑CGGAACTCGA‑TGCCCATGCCGGTGAACACTTCACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCG > NC_002947/5792532‑5792823 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |