New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5940728 = | 48 (0.910) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 7.2% | coding (567/1113 nt) | yhhJ | translation‑like protein |
? | NC_002947 | 5940769 = | 57 (1.110) | coding (608/1113 nt) | yhhJ | translation‑like protein |
AGCCCGGTGCTGATCAACCCCAAGGCGCTGTTCAACCCCAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTTGGTGGTAGTCGTCAAAGGTGCACTGGGCGTGCCGCTGTCT > NC_002947/5940624‑5940914 | cgaaatccaggtgcagatcaccaccaccagcgcgttgctgccgatcttggccagcatgatctccagcgcggtcagcggcagcaccagcaggtggtcgagggtgcCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCAc > 6:326962‑M1/105‑149 (MQ=255) aTCAACCCCAACGCGCTGTTCAACCCCAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACct > 8:246712/1‑149 (MQ=255) cccAAGGCGCTGTTCAACCCCAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACctgctg > 8:286165/1‑147 (MQ=255) cccAAGGCGCTGTTCAACCCCAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACctgctg < 7:286165/147‑1 (MQ=255) ccAAGGCGCTGTTCAACCCCAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGtg > 8:216223/1‑149 (MQ=255) cAAGGCGCTGTTCAACCCCAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGtgc > 8:91719/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGTTCAACCCCAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGtgctgc < 5:244671/149‑1 (MQ=255) tGTTCAACCCCAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCt > 4:208111/1‑148 (MQ=255) ttCAACCCCAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCt > 6:124594/1‑122 (MQ=255) ttCAACCCCAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCt < 5:124594/122‑1 (MQ=255) ttCAACCCCAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGa < 5:28910/148‑1 (MQ=255) ccccAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACctgctg > 8:153148/1‑130 (MQ=255) ccccAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACctgctg < 7:153148/130‑1 (MQ=255) cccAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCt > 1:176667/1‑149 (MQ=255) ccAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCTATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTg < 8:47191/149‑1 (MQ=255) ccAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTg < 5:264994/149‑1 (MQ=255) ccAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCAACGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTg > 8:124571/1‑149 (MQ=255) cAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTg > 3:93503/1‑148 (MQ=255) cAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTg > 5:191416/1‑148 (MQ=255) gAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCTCCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCAt < 7:246712/149‑1 (MQ=255) gAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCAt < 7:91719/149‑1 (MQ=255) ggggggCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGc < 7:216223/149‑1 (MQ=255) gggCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCTACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGGTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTgg < 3:208111/149‑1 (MQ=255) tCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATc < 6:191416/148‑1 (MQ=255) gCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCgg < 2:176667/146‑1 (MQ=255) gATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAAcg > 1:168095/1‑149 (MQ=255) aTCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGgca > 6:188867/1‑136 (MQ=255) aTCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGgca < 5:188867/136‑1 (MQ=255) tCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCtggtggtg < 2:168095/149‑1 (MQ=255) tCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCtggtggtg > 3:103587/1‑149 (MQ=255) acaacaTTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTggtggtggt > 6:104826/1‑148 (MQ=255) aacaTTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCa < 8:278733/109‑1 (MQ=255) aacaTTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCa > 7:278733/1‑109 (MQ=255) caTTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATc > 6:181053/1‑106 (MQ=255) caTTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATc < 5:181053/106‑1 (MQ=255) ccATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCtggtg < 8:63843/134‑1 (MQ=255) ccATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCtggtg > 7:63843/1‑134 (MQ=255) tCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTg > 1:35570/1‑92 (MQ=255) tCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTg < 2:35570/92‑1 (MQ=255) gCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTc < 1:80384/149‑1 (MQ=255) gtgccatgctcacgctcgcgcagcagcgcggtgccagtgaggatgGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCg > 6:326962‑M2/46‑149 (MQ=255) gATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGt > 1:326493/1‑149 (MQ=255) gATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGt > 8:2858/1‑149 (MQ=255) atcatcCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCa > 5:147763/1‑91 (MQ=255) atcatcCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCa < 6:147763/91‑1 (MQ=255) atcatcCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGtt < 5:104826/149‑1 (MQ=255) catgctcacgctcgcgcagcagcgcggtgccagtgaggatgGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCtggtggtg > 7:226246‑M2/42‑124 (MQ=255) catgctcacgctcgcgcagcagcgcggtgccagtgaggatgGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCtggtggtg < 8:226246‑M2/83‑1 (MQ=255) ccTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTtggtgg > 5:96786/1‑149 (MQ=255) tCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTtggtgg > 5:85564/1‑147 (MQ=255) tCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTtggt > 3:341615/1‑145 (MQ=255) tCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTtggt < 4:341615/145‑1 (MQ=255) tCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTtg > 7:157125/1‑143 (MQ=255) tCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTtg < 8:157125/143‑1 (MQ=255) aCTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTTGGTGGTa < 4:103587/147‑1 (MQ=255) aCTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTTGGTGGTAgt > 8:38394/1‑149 (MQ=255) tGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCtggtggtg > 8:74145/1‑115 (MQ=255) gcagcagcgcggtgccagtgaggatgGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTTGGTGGTAGTCGTCAAAg < 5:326962‑M2/123‑1 (MQ=255) cgcgCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTTGGTGGTAGTCGTCAAAg < 7:38394/149‑1 (MQ=255) cgcgCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTTGGTGGTAGTCGTCAAAg > 3:239401/1‑149 (MQ=255) cgcgAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTTGGTGGTAGTCGTCAAAGGTGCACTggg < 6:96786/149‑1 (MQ=255) gcgAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTTGGTGGTAGTCGTCAAAGGTGCACTGGGc < 4:93503/149‑1 (MQ=255) atgGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTTGGTGGTAGTCGTCAAAGGTGCACTGGGCGTGCCGCTGTCt < 2:326493‑M2/146‑1 (MQ=255) gGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTgg < 8:251253‑M2/98‑1 (MQ=255) | AGCCCGGTGCTGATCAACCCCAAGGCGCTGTTCAACCCCAACCTGGAGGGGGGCTGGTTTCTGGCCGTGATCCAGATCGTCAACAACATTACCATCCTGGCGATCATCCTCACTGGCACCGCGCTGCTGCGCGAGCGTGAGCATGGCACCCTCGACCACCTGCTGGTGCTGCCGCTGACCGCGCTGGAGATCATGCTGGCCAAGATCGGCAGCAACGCGCTGGTGGTGGTGATCTGCACCTGGATTTCGTTGGTGGTAGTCGTCAAAGGTGCACTGGGCGTGCCGCTGTCT > NC_002947/5940624‑5940914 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |