New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 346558 = | 73 (1.240) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 6.3% | coding (1288/2247 nt) | PP_0287 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 346651 = | 49 (0.880) | coding (1195/2247 nt) | PP_0287 | hypothetical protein |
AGCTGGGCGCTCTCGATCGGCAGCTTATCCAGGGTCAACGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGGTCGACCGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTG > NC_002947/346410‑346706 | aGCTGGGCGCTCTCGATCGGCAGCTTATCCAGGGTCAACGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGGTCGACCGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAg‑tggtgtggt < 7:292277/149‑1 (MQ=255) gggCGCTCTCGATCGGCAGCTTATCCAGGGTCAACGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGGTCGACCGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCg > 2:255716/1‑149 (MQ=255) gggCGCTCTCGATCGGCAGCTTATCCAGGGTCAACGAGCCGAAGGCAAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGGTCGCCAGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCACTGCCAGTTGTGTTGGGGAGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCg > 4:140456/1‑149 (MQ=255) cacacccagcagcctggccgtggaagacctggcggtgaagctggacgacagcaccttcagcggccgcgtggccgtcgaagatttcgccaaacaagccgtgcgcctgcaacttaagggcgacaccttcgacgccgaccgctaccTGCCgg < 2:79120‑M1/6‑1 (MQ=255) gtgcccagcaggctggccctggaagacctggcggtgaagctggacgacagcaccttcagcggccgcgtggccgtcgaagatttcgccaaacaagccctgcgcctgcaacttaagggcgacaccttcgacgccgaccgctaccTGCCGGc < 7:78812‑M1/7‑1 (MQ=255) cgcTCTCGATCGGCAGCTTATCCAGGGTCAACGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGGCGAGGGCGCGCAGACGGTCGACCGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑a < 3:271021/149‑1 (MQ=255) tcGATCGGCAGCTTATCCAGGGTCAACGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGGTCGACCGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGc > 6:8442/1‑149 (MQ=255) tcGATCGGCAGCTTATACAGGGTCAACGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGCTCGACCGGCATCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGc > 1:106917/1‑149 (MQ=255) tCGGCAGCTTATCCAGGGTCAACGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGGTCGACCGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACg > 5:355387/1‑149 (MQ=255) gCTTATCCAGGGTCAACGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGGTCGACCGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTg < 6:224798/149‑1 (MQ=255) cTTATCCAGGGTCAATGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGGTCGACCGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTgg > 1:219908/1‑149 (MQ=255) ttATCCAGGGTCAACGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGGTCGACCGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGc > 8:38627/1‑149 (MQ=255) ttATCCAGGGTCAACGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGGTCGACCGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGc > 4:142321/1‑149 (MQ=255) ctggaagacctggcggtgaagctggacgacagcaccttcagcggccgcgtggccgtcgaagatttcgccaaacaagccctgcgcctgcaacttaagggcgacaccttcgacgccgaccgctaccTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGc < 2:185078‑M1/25‑1 (MQ=255) aTCCAGGGTCAATGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGGTCGACCGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGcc < 2:219908/148‑1 (MQ=255) aTCCAGGGTCAACGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGGTCGACCGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGc < 2:347689/147‑1 (MQ=255) tCCAGGGTCAACGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGGTCGACCGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGCctc < 2:360170/149‑1 (MQ=255) cAGGGTCAACGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGGTCGACCGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGCCTCtt < 1:255716/149‑1 (MQ=255) 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gCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTg > 7:22699/1‑149 (MQ=255) gCGTTCGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTAGACCTCGGCCTGGCTCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCATCGctcat > 8:149099/1‑102 (MQ=255) gTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCa < 2:324278/149‑1 (MQ=255) aG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAg < 2:344203/149‑1 (MQ=255) g‑tggtgtggtGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAg < 2:353812/136‑1 (MQ=255) g‑tggtgtggtGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAg > 1:353812/1‑136 (MQ=255) tggtgCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGccc < 7:323578/125‑1 (MQ=255) tggtgCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGccc > 8:323578/1‑125 (MQ=255) tggtgCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGt > 4:126002/1‑149 (MQ=255) gtgCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGttt > 1:79120/1‑149 (MQ=255) gtgCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCG‑CCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTATGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTg > 7:166699/1‑149 (MQ=255) | AGCTGGGCGCTCTCGATCGGCAGCTTATCCAGGGTCAACGAGCCGAAGGCCAGGTCGGCCTGCAGGTCGAGGGCGCGCAGACGGTCGACCGGCAGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAG‑TGGTGTGGTGCCGGC‑‑‑ACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTG > NC_002947/346410‑346706 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |