New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 346558 = | 73 (1.240) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 6.3% | coding (1288/2247 nt) | PP_0287 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 346651 = | 49 (0.880) | coding (1195/2247 nt) | PP_0287 | hypothetical protein |
AGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAGCTTCACCGCCAGGTCTTCCAGGGCCAGGCTGCTGGGTGTG > NC_002947/346503‑346793 | agcagcTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAg < 4:176070/149‑1 (MQ=255) gcagcTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAgg < 2:323516/149‑1 (MQ=255) aacaagccctgcgcctgcaacttaagggcgacaccttcgacgccgaccgctaccTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAgg > 1:185078‑M1/55‑149 (MQ=255) agcTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAgg > 7:181785/1‑147 (MQ=255) tcgtcgCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTACGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTc > 1:344203/1‑149 (MQ=255) gtcgCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCgg > 2:188692/1‑149 (MQ=255) gCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAGTGGTGTTGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTTGCCTCTTGTTGCTTGACCTCTGCCTGTCACGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCTGTCGGCGt < 2:106917/149‑1 (MQ=255) cATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGaa < 2:272789/149‑1 (MQ=255) aTGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAg > 5:377004/1‑149 (MQ=255) aTGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAg < 7:262714/149‑1 (MQ=255) aTGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAg < 8:181785/149‑1 (MQ=255) aTGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAg < 3:117369/149‑1 (MQ=255) tGCCACTTGTGTTTGGGCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAgg < 3:140456/149‑1 (MQ=255) aCTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTc > 5:19870/1‑149 (MQ=255) aCTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTc > 1:148394/1‑149 (MQ=255) ggggCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTaa < 1:314662/148‑1 (MQ=255) ggggCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGAAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTaa < 1:30649/148‑1 (MQ=255) gggCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCtt > 4:218089/1‑145 (MQ=255) gCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTg > 7:22699/1‑149 (MQ=255) gTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCa < 2:324278/149‑1 (MQ=255) aGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAg < 2:344203/149‑1 (MQ=255) gtggtgtggtGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAg > 1:353812/1‑136 (MQ=255) gtggtgtggtGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAg < 2:353812/136‑1 (MQ=255) tggtgCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGccc < 7:323578/125‑1 (MQ=255) tggtgCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGccc > 8:323578/1‑125 (MQ=255) tggtgCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGt > 4:126002/1‑149 (MQ=255) cctgccggccaagagcgaagaagccaagggcgccaccgctgcgcgccaggccgaggtcaagcaacaagaggccagcgccgtagccggtgccggcaGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGtt > 1:185078‑M2/96‑149 (MQ=255) gtgCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGttt > 1:79120/1‑149 (MQ=255) gtgCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCG‑CCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTATGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTg > 7:166699/1‑149 (MQ=255) gccggccaagagcgaagaagccaagggcgccaccgctgcgcgccaggccgaggtcaagcaacaagaggccagcgccgtagccggtgccggcaGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTgg > 7:129209‑M2/93‑149 (MQ=255) CCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTgg > 3:126002‑M1/1‑148 (MQ=255) GGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTgg > 5:86197‑M1/1‑146 (MQ=255) GGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTgg < 6:86197‑M1/146‑1 (MQ=255) GCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGa < 8:143059‑M1/148‑1 (MQ=255) CACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGaaa > 1:14464‑M1/1‑149 (MQ=255) CACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGaaa > 1:188692‑M1/1‑149 (MQ=255) aCCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAg > 8:127201/1‑126 (MQ=255) aCCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAg < 7:127201/126‑1 (MQ=255) gCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTc < 3:218089/149‑1 (MQ=255) gCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTc < 5:309364/149‑1 (MQ=255) tACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGa > 2:2345/1‑149 (MQ=255) cgaagaagccaagggcgccaccgctgcgcgccaggccgaggtcaagcaacaagaggccagcgccgtagccggtgccggcaGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGa < 8:129209‑M2/69‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTACTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGAc > 1:291248/1‑149 (MQ=255) tGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCAcg > 2:200787/1‑149 (MQ=255) ctctTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGc < 8:22699/149‑1 (MQ=255) tctTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGcc > 5:180902/1‑149 (MQ=255) tgttgCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCt > 3:41794/1‑149 (MQ=255) gCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGaa < 4:41794/148‑1 (MQ=255) aCCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTaa < 1:288132/88‑1 (MQ=255) aCCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTaa > 2:288132/1‑88 (MQ=255) ccTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTg > 8:78812/1‑149 (MQ=255) tCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGTCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTgtc > 3:300669/1‑149 (MQ=255) tCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGTAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTgtc > 1:26497/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCa < 6:377004/149‑1 (MQ=255) gcgcgcAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAGCt > 4:255838/1‑149 (MQ=255) cgcgcAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGTCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAGCtt < 4:300669/149‑1 (MQ=255) ggCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACTCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAGCTTAACCGCCAgg > 3:1129/1‑148 (MQ=255) cgcCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAGCTTCACCGCCAGGTCt > 8:115508/1‑149 (MQ=255) cccTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAGCTTCACCGCCAGGTCTTc < 1:200787/149‑1 (MQ=255) gccagcgccgtagccggtgccggcaGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAGCTTCACCGCCAGGTCTTCCAg < 2:185078‑M2/124‑1 (MQ=255) ggCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAGCTTCACCGCCAGGTCTTCCAg < 5:4394/147‑1 (MQ=255) ggCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAGCTTCACCGCCAGGTCTTCCAg < 2:291248/147‑1 (MQ=255) cttcttCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAGCTTCACCGCCAGGTCTTCCAGGGc > 1:107358/1‑148 (MQ=255) tctTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAg > 3:205199/1‑115 (MQ=255) tctTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAg < 4:205199/115‑1 (MQ=255) ggCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAGCTTCACCGCCAGGTCTTCCAGGGCCAGGCTGCTGGgt < 7:143059/148‑1 (MQ=255) gccggcaGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAGCTTCACCGCCAGGTCTTCCAGGGCCAGCCTgctgggcac < 7:78812‑M2/142‑4 (MQ=255) ccggcaGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCACGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAGCTTCACCGCCAGGTCTTCCACGGCCAGGCTGCTGGGtgtg < 2:79120‑M2/143‑1 (MQ=255) | AGCAGCTTGTCGTCGCTCCATGCCACTTGTGTTGGGGCGTTGGGCAGTGGTGTGGTGCCGGCACCGGCTACGGCGCTGGCCTCTTGTTGCTTGACCTCGGCCTGGCGCGCAGCGGTGGCGCCCTTGGCTTCTTCGCTCTTGGCCGGCAGGTAGCGGTCGGCGTCGAAGGTGTCGCCCTTAAGTTGCAGGCGCAGGGCTTGTTTGGCGAAATCTTCGACGGCCACGCGGCCGCTGAAGGTGCTGTCGTCCAGCTTCACCGCCAGGTCTTCCAGGGCCAGGCTGCTGGGTGTG > NC_002947/346503‑346793 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |