New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 834263 | 49 (0.830) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 6.2% | coding (939/1023 nt) | PP_0717 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 834286 | 45 (0.820) | coding (962/1023 nt) | PP_0717 | membrane protein |
TACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAGGCATCC > NC_002947/834123‑834408 | tACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTg < 1:295767/147‑1 (MQ=255) tACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGc > 4:38865/1‑149 (MQ=255) aCCAGGCGGTGCCGAGCAGGCAGAGCCCGGCGTACTGGTTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGTTGCATGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTTTACAACGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTATCTgg > 8:16089/1‑147 (MQ=255) ccAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGcg < 3:38865/148‑1 (MQ=255) cAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGCCAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGcggt > 1:347724/1‑149 (MQ=255) gTGCCGAGCGGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGAGCATGTTTATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGGAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGGACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGcggtgtcggt < 5:315766/149‑1 (MQ=255) cGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTAt > 7:351914/1‑149 (MQ=255) cGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTAt > 5:78057/1‑149 (MQ=255) agagCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCcagcgc < 4:317421‑M2/148‑7 (MQ=255) gCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATg < 5:196919/149‑1 (MQ=255) cccGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGt > 8:123454/1‑149 (MQ=255) cGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGgcatacaccgacaccgccagaaacagcgccatacgc < 6:242307‑M1/149‑37 (MQ=255) tACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCTCCATGTTGATCTg < 2:299178/149‑1 (MQ=255) tACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTg < 7:202279/149‑1 (MQ=255) gggTCAGTTGCCTGACGTCCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGAtt < 2:347724/149‑1 (MQ=255) tCAGTTTCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGGCGTTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGAc < 4:48611/149‑1 (MQ=255) cAGTTGCCTGACGACCATGATGATCTTGCCGGGGCAGGCGGTGCACGACAGGGCAGGTGGGCAGGATGTGTACCAGGCAATTGCGCTGCGTATGGCGCTGGTGCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGAcc < 6:78057/149‑1 (MQ=255) acgacCATGTTGATCTTGCTGGGGCATTCGGTTCAGGACAGTGGAGGTGGGCAGGATGTGTACAATGCATTTGCGTTGCGTATTGGGCTGTTTCTGGCGGTTTCGGTGTATGCCAGCGCGATGTTGATCTGGATTTACCGGCTTCGGa < 7:16089/148‑1 (MQ=255) gacCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGcg > 3:158213/1‑97 (MQ=255) gacCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGcg < 4:158213/97‑1 (MQ=255) gacCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGATTc > 3:303338/1‑149 (MQ=255) ccATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGgcatacaccgacaccgccagaaacagcgccata < 6:364400‑M1/119‑34 (MQ=255) ccATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGgcatacaccgacaccgccagaaacagcgccata > 5:364400‑M1/1‑86 (MQ=255) cATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATg > 7:69773/1‑118 (MQ=255) cATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATg < 8:69773/118‑1 (MQ=255) cATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGgc > 5:356610/1‑149 (MQ=255) cATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGACAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGgc > 2:268544/1‑149 (MQ=255) aTGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCg > 8:30277/1‑140 (MQ=255) aTGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCg < 7:30277/140‑1 (MQ=255) gATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCgggg > 2:13198/1‑148 (MQ=255) gCTGGGGCAGTCGGTGGAGGCCAGTGCTGGTGGGTAGTATGTTTACAAGCCATTGGCGGGGCGTATGCCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGCGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGcttctt < 1:290368/148‑1 (MQ=255) gCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGcttctt < 8:351914/148‑1 (MQ=255) gCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGcttc < 7:123454/146‑1 (MQ=255) ggCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCt < 3:164061/108‑1 (MQ=255) ggCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCt > 4:164061/1‑108 (MQ=255) gCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCcagc > 3:299474‑M2/1‑90 (MQ=255) gCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCcagc < 4:299474‑M2/94‑5 (MQ=255) cAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTa < 5:334146/149‑1 (MQ=255) tCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGc > 1:117179/1‑149 (MQ=255) aGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAgcgcgcgag > 8:253275/1‑146 (MQ=255) gACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTcc < 3:317421/149‑1 (MQ=255) gTGGGCCGGCTGTGTACATCGCCTTCGCGGGGGGCCGGGCTCGGTTGCTGGCGCGGTCTGTGTAGGCCAGCGCCATGTTGCTCTGGATTGACCGGCTGCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCa < 4:303338/149‑1 (MQ=255) ggCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAggg < 2:117179/149‑1 (MQ=255) tgtgTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAAtt < 8:41814/137‑1 (MQ=255) tgtgTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAAtt > 7:41814/1‑137 (MQ=255) gtACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGAGGTTAAGCCCGCTCAACACGCAATTCAGGGCAGCCCATc > 8:314140/1‑148 (MQ=255) aaGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAAccc > 3:65292/1‑149 (MQ=255) tgTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTcc < 7:314140/148‑1 (MQ=255) gTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCa < 6:268810/149‑1 (MQ=255) tGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTc > 5:166395/1‑146 (MQ=255) gCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCcagcgccatacgcaccgcaaatgccttgtacacatcctgcccacctgcactgtcctgcaccgactgccccagcaagatcaacatggtcgtcaggcaactgacccagtacgccg < 6:242307‑M2/149‑114 (MQ=255) tATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCcagcgccatacgcaccgcaaatgccttgtacacatcctgcccacctgcactgtcctgcaccgactgccccagcaagatcaacatgg < 6:364400‑M2/119‑87 (MQ=255) tATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCcagcgccatacgcaccgcaaatgccttgtacacatcctgcccacctgcactgtcctgcaccgactgccccagcaagatcaacatgg > 5:364400‑M2/1‑33 (MQ=255) tATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTc > 2:125645/1‑142 (MQ=255) tATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTc < 1:125645/142‑1 (MQ=255) tGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAgg < 6:356610/148‑1 (MQ=255) tGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAGGc < 6:166395/149‑1 (MQ=255) gcgcTGgcatacaccgacaccgccagaaacagcgccatacgcaccgcaaatgccttgtacacatcctgcccacctgcactgtcctgcaccgactgccccagcaagatcaacatggtcgtcaggcaactgacccagtacgccgggctct < 4:317421‑M1/148‑143 (MQ=255) gcgcTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAGGCa > 3:87046/1‑148 (MQ=255) gcTGgcatacaccgacaccgccagaaacagcgccatacgcaccgcaaatgccttgtacacatcctgcccacctgcactgtcctgcaccgactgc < 4:299474‑M1/94‑91 (MQ=255) gcTGgcatacaccgacaccgccagaaacagcgccatacgcaccgcaaatgccttgtacacatcctgcccacctgcactgtcctgcaccgactgc > 3:299474‑M1/1‑4 (MQ=255) gcTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAGGCATcc > 6:321782/1‑149 (MQ=255) | TACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAGGCATCC > NC_002947/834123‑834408 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |