New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 834263 | 49 (0.830) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 6.2% | coding (939/1023 nt) | PP_0717 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 834286 | 45 (0.820) | coding (962/1023 nt) | PP_0717 | membrane protein |
AGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAGGCATCCACCGCGGCGCCCACCGTCGGA > NC_002947/834145‑834429 | agagCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCcagcgc < 4:317421‑M2/148‑7 (MQ=255) gCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATg < 5:196919/149‑1 (MQ=255) cccGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGt > 8:123454/1‑149 (MQ=255) tACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCTCCATGTTGATCTg < 2:299178/149‑1 (MQ=255) tACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTg < 7:202279/149‑1 (MQ=255) gggTCAGTTGCCTGACGTCCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGAtt < 2:347724/149‑1 (MQ=255) tCAGTTTCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGGCGTTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGAc < 4:48611/149‑1 (MQ=255) cAGTTGCCTGACGACCATGATGATCTTGCCGGGGCAGGCGGTGCACGACAGGGCAGGTGGGCAGGATGTGTACCAGGCAATTGCGCTGCGTATGGCGCTGGTGCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGAcc < 6:78057/149‑1 (MQ=255) acgacCATGTTGATCTTGCTGGGGCATTCGGTTCAGGACAGTGGAGGTGGGCAGGATGTGTACAATGCATTTGCGTTGCGTATTGGGCTGTTTCTGGCGGTTTCGGTGTATGCCAGCGCGATGTTGATCTGGATTTACCGGC‑TTCGGa < 7:16089/148‑1 (MQ=255) gacCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGATTc > 3:303338/1‑149 (MQ=255) cATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATg > 7:69773/1‑118 (MQ=255) cATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATg < 8:69773/118‑1 (MQ=255) cATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGgc > 5:356610/1‑149 (MQ=255) cATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGACAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGgc > 2:268544/1‑149 (MQ=255) aTGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCg < 7:30277/140‑1 (MQ=255) aTGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCg > 8:30277/1‑140 (MQ=255) gATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCgggg > 2:13198/1‑148 (MQ=255) gCTGGGGCAGTCGGTGGAGGCCAGTGCTGGTGGGTAGTATGTTTACAAGCCATTGGCGGGGCGTATGCCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGCGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGcttctt < 1:290368/148‑1 (MQ=255) gCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGcttctt < 8:351914/148‑1 (MQ=255) gCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGcttc < 7:123454/146‑1 (MQ=255) ggCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCt > 4:164061/1‑108 (MQ=255) ggCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCt < 3:164061/108‑1 (MQ=255) gCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCcagc < 4:299474‑M2/94‑5 (MQ=255) gCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCcagc > 3:299474‑M2/1‑90 (MQ=255) cAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTa < 5:334146/149‑1 (MQ=255) tCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGc > 1:117179/1‑149 (MQ=255) aGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAgcgcgcgag > 8:253275/1‑146 (MQ=255) gACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTcc < 3:317421/149‑1 (MQ=255) gTGGGCCGGCTGTGTACATCGCCTTCGCGGGGGGCCGGGCTCGGTTGCTGGCGCGGTCTGTGTAGGCCAGCGCCATGTTGCTCTGGATTGACCGGC‑TGCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCa < 4:303338/149‑1 (MQ=255) ggCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAggg < 2:117179/149‑1 (MQ=255) tgtgTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAAtt < 8:41814/137‑1 (MQ=255) tgtgTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAAtt > 7:41814/1‑137 (MQ=255) gtACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGAGGTTAAGCCCGCTCAACACGCAATTCAGGGCAGCCCATc > 8:314140/1‑148 (MQ=255) aaGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAAccc > 3:65292/1‑149 (MQ=255) tgTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTcc < 7:314140/148‑1 (MQ=255) gTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCa < 6:268810/149‑1 (MQ=255) tGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTc > 5:166395/1‑146 (MQ=255) gCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCcagcgccatacgcaccgcaaatgccttgtacacatcctgcccacctgcactgtcctgcaccgactgccccagcaagatcaacatggtcgtcaggcaactgacccagtacgccg < 6:242307‑M2/149‑114 (MQ=255) tATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCcagcgccatacgcaccgcaaatgccttgtacacatcctgcccacctgcactgtcctgcaccgactgccccagcaagatcaacatgg > 5:364400‑M2/1‑33 (MQ=255) tATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCcagcgccatacgcaccgcaaatgccttgtacacatcctgcccacctgcactgtcctgcaccgactgccccagcaagatcaacatgg < 6:364400‑M2/119‑87 (MQ=255) tATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTc < 1:125645/142‑1 (MQ=255) tATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTc > 2:125645/1‑142 (MQ=255) tGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAgg < 6:356610/148‑1 (MQ=255) tGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAGGc < 6:166395/149‑1 (MQ=255) gcgcTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAGGCa > 3:87046/1‑148 (MQ=255) gcTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAGGCATcc > 6:321782/1‑149 (MQ=255) tCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCTGGCTTCTTCGCGTTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAGGCATCCACcgc < 1:268544/148‑1 (MQ=255) gCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAGGCATCCACCGCGgcgc > 4:315728/1‑149 (MQ=255) tgtcggtgtATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTATTAGCGGTTAAGCCCGGTGTACAGGCAATTAAGGGCTGCCAATCAAACCCACTCTCTTCCAGATAGGCATCCACCGCGGCGCCCAc > 1:356164/1‑149 (MQ=255) tcggtgtATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGCTTTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAAccc > 1:72095/1‑111 (MQ=255) tcggtgtATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAAccc < 2:72095/110‑1 (MQ=255) tcggtgtATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAGGCATCCACCGCGGCGCCCACCg > 7:236792/1‑149 (MQ=255) ggtgtATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAGGCATCCACCGCGGCGCCCACCGTc > 2:322029/1‑149 (MQ=255) gtgtATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTcgc < 4:66956/63‑1 (MQ=255) gtgtATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTcgc > 3:66956/1‑63 (MQ=255) tATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGCCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCATCCAGATAGGCATCCACCGCGGCGCCCACCGTCGGa < 4:65292/148‑1 (MQ=255) | AGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCCTGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGATTGACCGGC‑TTCGGAGTCGGCGCGGGCTTCTTCGCGGTTAAGCCCGCTCTCCAGGCAATTCAGGGCTGCCAATCAACCCCACTCTCTTCCAGATAGGCATCCACCGCGGCGCCCACCGTCGGA > NC_002947/834145‑834429 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |