New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2726248 | 39 (0.660) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 7.4% | coding (408/1083 nt) | PP_2387 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2726273 | 38 (0.680) | coding (383/1083 nt) | PP_2387 | hypothetical protein |
CCGACGAGGTGGTGCGCAGGGCTGCATGCCTTCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGA > NC_002947/2726104‑2726394 | ccGACGAGGTGGTGCGCAGGGCTGCATGCCTTCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGcaccacca > 3:300501/1‑149 (MQ=255) acgaGGTGGTGCGCAGGGCTGCATGCCTTCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACAt < 3:71350/149‑1 (MQ=255) gaGGTGGTGCGCAGGGCTGCATGCCTTCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATgg < 4:300501/149‑1 (MQ=255) gtgCGCAGGGCTGCATGCCTTCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGt > 5:283661/1‑149 (MQ=255) gtgCGCAGGGCTGCATGCCTTCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGt > 2:241288/1‑149 (MQ=255) cATGCCTTCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCgg > 6:41541‑M2/1‑146 (MQ=255) cGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCgccttggccaactcggccatgtggtggtgctcagt < 5:40065‑M1/148‑36 (MQ=255) gCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCtggtgg < 1:241288/148‑1 (MQ=255) aCTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCtggtg > 6:289098/1‑141 (MQ=255) aCTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCtggtg < 5:289098/141‑1 (MQ=255) gagaAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCggtgc > 7:174940‑M2/1‑125 (MQ=255) gagaAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCggtgc < 8:174940‑M2/130‑6 (MQ=255) aaaGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTCTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTCGGTCAGCAACatcatc > 8:131904/1‑148 (MQ=255) tGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTg < 5:118664/149‑1 (MQ=255) gCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGc > 8:26177/1‑149 (MQ=255) gTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGcc < 6:283661/149‑1 (MQ=255) gTGCTGCGGGGCGTTGGGACGTGGGAGGACTTCACACAGGGCGTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGGCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGcc < 7:131904/149‑1 (MQ=255) gTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCgg > 5:367563/1‑149 (MQ=255) gTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGc < 7:26177/148‑1 (MQ=255) cTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAAca > 7:175164/1‑102 (MQ=255) cTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAAca < 8:175164/102‑1 (MQ=255) cTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGc > 3:328380/1‑149 (MQ=255) cTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGc > 7:318014/1‑149 (MQ=255) gCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGc > 1:156304/1‑147 (MQ=255) gAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGa > 5:26170/1‑149 (MQ=255) ggACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACt > 2:331519/1‑149 (MQ=255) ttCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCgccttggccaactcggccatgtggtggtgctcagtggcc < 1:358298‑M1/85‑40 (MQ=255) ttCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCgccttggccaactcggccatgtggtggtgctcagtggcc > 2:358298‑M1/1‑46 (MQ=255) ttCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGc > 3:269291/1‑149 (MQ=255) tCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGcc > 6:45985/1‑149 (MQ=255) acacaGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTTGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGccc < 4:328380/148‑1 (MQ=255) cacaGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGt > 5:26242/1‑149 (MQ=255) caGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGGTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGGTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGa < 6:83034/149‑1 (MQ=255) ttCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGACGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATc > 7:192118/1‑148 (MQ=255) gTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGAc < 1:331519/148‑1 (MQ=255) gTGGGCCAGGCTGTGGAGGCCACGGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACa < 6:167586/149‑1 (MQ=255) tGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGcc > 2:143307/1‑149 (MQ=255) gTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCa > 2:46516/1‑149 (MQ=255) ttGAGGCCACTGAGCACCACCACATTGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCATGGGTGGCGTTAATCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTAGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCAc > 5:26061/1‑149 (MQ=255) gAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGTTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTACAGACCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACtg > 2:317156/1‑149 (MQ=255) aGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACtgt < 2:351955/149‑1 (MQ=255) aGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACtgt < 6:367563/149‑1 (MQ=255) aGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACtgt < 5:45985/149‑1 (MQ=255) ggCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCggtgctcagtggcctcaacagcctggcccacgaagccctgtgtgaa < 1:358298‑M2/85‑47 (MQ=255) ggCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCggtgctcagtggcctcaacagcctggcccacgaagccctgtgtgaa > 2:358298‑M2/1‑39 (MQ=255) cACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTgtgtgt > 8:45001/1‑149 (MQ=255) aCTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCggtgctcagtggcctcaacagcctggcccacgaagccctgtgtgaagtcctcgcaggtaccaacgacccgcagcacgccaaggcctaccaggcctttctcaacagttttagcg < 5:40065‑M2/148‑114 (MQ=255) tGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTtcg > 7:105593/1‑149 (MQ=255) aGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGTGGCCACTGTGTGTtcgt < 8:318014/148‑1 (MQ=255) gCACCgccttggccaactcggccatgtggtggtgctcagtggcctcaacagcctggcccacgaagccctgtgtgaagtcctcgcaggtaccaacgacccgcagcacgccaaggcctaccaggcctttctc > 7:174940‑M1/1‑5 (MQ=255) gCACCgccttggccaactcggccatgtggtggtgctcagtggcctcaacagcctggcccacgaagccctgtgtgaagtcctcgcaggtaccaacgacccgcagcacgccaaggcctaccaggcctttctc < 8:174940‑M1/130‑126 (MQ=255) ccgccttggccaactcggccatgtggtggtgctcagtggcctcaacagcctggcccacgaagccctgtgtgaagtcctcgcaggtaccaacgacccgcagcacgccaaggcctaccaggcctttctcaacagttttagcgaaggcatg > 6:41541‑M1/1‑2 (MQ=255) | CCGACGAGGTGGTGCGCAGGGCTGCATGCCTTCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAGGAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGA > NC_002947/2726104‑2726394 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |