New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2879841 = | 59 (1.000) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 7.4% | coding (224/900 nt) | PP_2534 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 2879921 = | 44 (0.790) | coding (144/900 nt) | PP_2534 | LysR family transcriptional regulator |
CAGCACTTGCGGGTAGCGTGCGCTGAAGGCCGCCAGCAGCGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGAGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGC > NC_002947/2879693‑2879989 | cAGCACTTTCGGGTAGCGTGCGCTGAAGGCCGCCAGCAGCGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCa < 3:26820/149‑1 (MQ=255) aaatggacttcggtggcagatccggcgagatggagatttttgccaaggtggcgcaagcgggcagcctgtctgctgccgcccgagcgctaggcctgacgccctcggcggtcagccgcattctcgcccgcaccgaacagcgcctgggtAcc < 6:158595‑M1/3‑1 (MQ=255) aaatggacttcggtggcagatccggcgagatggagatttttgccaaggtggcgcaagcgggcagcctgtctgctgccgcccgagcgctaggcctgacgccctcggcggtcagccgcattctcgcccgcaccgaacagcgcctgggtAcc < 3:110408‑M1/3‑1 (MQ=255) aatggacttcggtggcagatccggcgagatggagatttttgccaaggtggcgcaagcgggcagcctgtctgctgccgcccgagcgctaggcctgacgccctcggcggtcagccgcattctcgcccgcaccgaacagcgcctgggtatcc > 3:132407‑M1/146‑146 (MQ=255) aCTTGCGGGTAGCGTGCGCTGAAGGCCGCCAGCAGCGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACccg > 3:202631/1‑149 (MQ=255) ttGCGGGTAGCGTGCGCTGAAGGCCGCCAGCAGCGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCATTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACccgcc > 8:230556/1‑149 (MQ=255) ggacttcggtggcagatccggcgagatggagatttttgccaaggtggcgcaagcgggcagcctgtctgctgccgcccgagcgctaggcctgacgccctcggcggtcagccgcattctcgcccgcaccgaacagcgcctgggtACccgcc < 8:199270‑M1/7‑1 (MQ=255) gTAGCGTGCGCTGAAGGCCGCCAGCAGCGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCAc > 8:11155/1‑149 (MQ=255) gTAGCGTGCGCTGAAGGCCGCCAGCAGCGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCAc < 7:11155/149‑1 (MQ=255) gCGTGCGCTGAAGGCCGCCAGCAGCGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACcgc < 5:144233/149‑1 (MQ=255) gcgcTGAAGGCCGCCAGCAGCGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAg < 7:223137/149‑1 (MQ=255) cTGAAGGCCGCCAGCAGCGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTa < 1:138666/149‑1 (MQ=255) tGAAGGCCGCCAGCAGCGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAACGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAg > 2:106439/1‑149 (MQ=255) aaGGCCGCCAGCAGCGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCGGGTAGGc > 7:349119/1‑149 (MQ=255) gccgccAGCAGCGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCctc > 3:323117/1‑149 (MQ=255) gatggagatttttgccaaggtggcgcaagcgggcagcctgtctgctgccgcccgagcgctaggcctgacgccctcggcggtcagccgcattctcgcccgcaccgaacagcgcctgggtACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCtctc < 2:143556‑M1/31‑1 (MQ=255) cagcagCGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCt > 6:235895/1‑149 (MQ=255) gcagcGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCCCGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCCCCCCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCg > 2:135242/1‑149 (MQ=255) gcagcGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCg > 7:168358/1‑149 (MQ=255) agcGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAACGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCTCACCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCgg < 1:106439/149‑1 (MQ=255) gcGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCGGGTAGGCCTCTCCCTCgggg < 8:349119/149‑1 (MQ=255) gcGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCgggg > 7:47581/1‑149 (MQ=255) gcGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCgggg < 3:204627/149‑1 (MQ=255) gcGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCgggg < 4:110714/149‑1 (MQ=255) cGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCggggg > 6:305452/1‑149 (MQ=255) ggCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCggggg > 3:120159/1‑148 (MQ=255) gCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGt > 3:91399/1‑148 (MQ=255) cTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAgg < 8:47581/149‑1 (MQ=255) cTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAgg < 5:305452/149‑1 (MQ=255) aCGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCATGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGt > 1:272382/1‑149 (MQ=255) ggTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTGCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGa < 6:95345/149‑1 (MQ=255) ggTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCGTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGTGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGa < 6:209145/149‑1 (MQ=255) gTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAg > 7:147367/1‑149 (MQ=255) gTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAg > 4:120745/1‑149 (MQ=255) ggCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCggg < 4:323117/149‑1 (MQ=255) ggCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGa < 4:315278/135‑1 (MQ=255) ggCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGa > 3:315278/1‑135 (MQ=255) cagcgcagcgCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCGACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGGGCgca < 4:202631/149‑1 (MQ=255) gcagcgcTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCgcagcag < 3:126465/149‑1 (MQ=255) gACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCggg > 5:247541/1‑149 (MQ=255) aCCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCgg < 6:78095/147‑1 (MQ=255) aCCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCgg < 8:168358/147‑1 (MQ=255) aCCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCgg < 4:120159/147‑1 (MQ=255) ccgagcgctaggcctgacgccctcggcggtcagccgcattctcgcccgcaccgaacagcgcctgggtACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTAc > 2:28413‑M1/68‑149 (MQ=255) cGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTAcc < 3:47099/149‑1 (MQ=255) gCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCgggg < 6:315448/104‑1 (MQ=255) gCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCgggg > 5:315448/1‑104 (MQ=255) cgagcgctaggcctgacgccctcggcggtcagccgcattctcgcccgcaccgaacagcgcctgggtACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTAcc > 1:143556‑M1/67‑149 (MQ=255) gagcgctaggcctgacgccctcggcggtcagccgcattctcgcccgcaccgaacagcgcctgggtACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTAccc > 5:193252‑M1/66‑149 (MQ=255) gcCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGgcgc > 4:119207/1‑149 (MQ=255) gCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGAGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCTGCAGGCGGGTTCCCACGAGCTGTTCGGTg > 7:345359/1‑149 (MQ=255) cACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGc > 7:322537/1‑149 (MQ=255) gCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCggg > 3:76803/1‑149 (MQ=255) ccTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGc > 1:343017/1‑149 (MQ=255) cTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAgg > 2:51994/1‑89 (MQ=255) tGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCgg < 2:272382/149‑1 (MQ=255) aTGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCt > 8:246976/1‑149 (MQ=255) ggCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGa > 5:187891/1‑149 (MQ=255) ccACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGa < 4:91399/148‑1 (MQ=255) cACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGAgg > 5:158595/1‑149 (MQ=255) gAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGTAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGAGGGCGTCa < 3:120745/149‑1 (MQ=255) gAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGAGGGCGTc < 7:230556/148‑1 (MQ=255) gAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGAGGGCGTCa < 5:235895/149‑1 (MQ=255) gCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGAGGGCGTCAgg > 5:134067/1‑149 (MQ=255) cATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGAGGGCGTCAGGc > 8:38631/1‑149 (MQ=255) tCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGAGGGCGTCAGGCCTa < 4:122737/148‑1 (MQ=255) cGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGAGGGCGTCAGGCCTAgcg > 8:135962/1‑149 (MQ=255) cGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGAGGGCGTCAGGCCTAgcg > 5:128918/1‑149 (MQ=255) gCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGAGGGCGTCAGGCCTAgcgc > 6:266175/1‑149 (MQ=255) gCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGAGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCgg > 7:81612/1‑149 (MQ=255) ACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGAGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGggc > 6:187891‑M1/1‑149 (MQ=255) | CAGCACTTGCGGGTAGCGTGCGCTGAAGGCCGCCAGCAGCGGCACTACGGTCAACCGGGCATGGCCCAGCGCAGCGCTGACCCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCT‑TCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGAGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGC > NC_002947/2879693‑2879989 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |