New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2879841 = | 59 (1.000) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 7.4% | coding (224/900 nt) | PP_2534 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 2879921 = | 44 (0.790) | coding (144/900 nt) | PP_2534 | LysR family transcriptional regulator |
CCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCTTCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCTTGGCAAAAATCTCCATCTCGCCGGATCTGCCACCGAAGTCCATTT > NC_002947/2879774‑2880066 | ccgagcgctaggcctgacgccctcggcggtcagccgcattctcgcccgcaccgaacagcgcctgggtACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTAc > 2:28413‑M1/68‑149 (MQ=255) cgagcgctaggcctgacgccctcggcggtcagccgcattctcgcccgcaccgaacagcgcctgggtACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTAcc > 1:143556‑M1/67‑149 (MQ=255) cGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCTTCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTAcc < 3:47099/149‑1 (MQ=255) gagcgctaggcctgacgccctcggcggtcagccgcattctcgcccgcaccgaacagcgcctgggtACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTAccc > 5:193252‑M1/66‑149 (MQ=255) gcCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCTTCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGgcgc > 4:119207/1‑149 (MQ=255) gCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCTTCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGAGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCTGCAGGCGGGTTCCCACGAGCTGTTCGGTg > 7:345359/1‑149 (MQ=255) cACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCTTCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGc > 7:322537/1‑149 (MQ=255) gCCTTGGTCAGTGATGGCTTCTTCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCggg > 3:76803/1‑149 (MQ=255) ccTTGGTCAGTGATGGCTTCTTCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGc > 1:343017/1‑149 (MQ=255) tGATGGCTTCTTCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCgg < 2:272382/149‑1 (MQ=255) aTGGCTTCTTCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCt > 8:246976/1‑149 (MQ=255) ggCTTCTTCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGa > 5:187891/1‑149 (MQ=255) ccACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑a < 4:91399/148‑1 (MQ=255) cACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑Agg > 5:158595/1‑149 (MQ=255) gAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGTAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCa < 3:120745/149‑1 (MQ=255) gAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTc < 7:230556/148‑1 (MQ=255) gAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCa < 5:235895/149‑1 (MQ=255) gCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAgg > 5:134067/1‑149 (MQ=255) cATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGc > 8:38631/1‑149 (MQ=255) tCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTa < 4:122737/148‑1 (MQ=255) cGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAgcg > 8:135962/1‑149 (MQ=255) cGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAgcg > 5:128918/1‑149 (MQ=255) gCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAgcgc > 6:266175/1‑149 (MQ=255) gggtacccgcctgctgctgcgcacgacccgggcgctcacccttacccccgagggagaggcctacctgcgcggtgcacggcgggtACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTc > 5:193252‑M2/85‑149 (MQ=255) ggtacccgcctgctgctgcgcacgacccgggcgctcacccttacccccgagggagaggcctacctgcgcggtgcacggcgggtACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCg > 1:143556‑M2/84‑149 (MQ=255) gtacccgcctgctgctgcgcacgacccgggcgctcacccttacccccgagggagaggcctacctgcgcggtgcacggcgggtACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCgg > 2:28413‑M2/83‑149 (MQ=255) gCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCgg > 7:81612/1‑149 (MQ=255) ACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGggc > 6:187891‑M1/1‑149 (MQ=255) CGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGGCTAGCGCTCGggcggc > 7:38631‑M1/1‑149 (MQ=255) CGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAg < 5:146487‑M1/137‑1 (MQ=255) CGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAg > 6:146487‑M1/1‑137 (MQ=255) CGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGgcag < 4:110408‑M1/148‑1 (MQ=255) gTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGgcagca < 8:198305/149‑1 (MQ=255) cgcgCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGATGTACGGTCCGGGCGAGAATGCGGCAGACCGCCG‑AGGGAGTCAGGCATAGCGCTCGGGCGGCACCAGACAgg > 6:365467/1‑149 (MQ=255) cgcAGGTAGGCCTCTGCCTGGGTGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGGGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTGCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCt < 5:365467/149‑1 (MQ=255) cAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGc < 2:343017/149‑1 (MQ=255) gTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCg > 4:43291/1‑149 (MQ=255) aGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCggg < 3:309952/81‑1 (MQ=255) aGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCggg > 4:309952/1‑81 (MQ=255) ccTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTgc < 3:43291/149‑1 (MQ=255) ctctCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCGCAGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAg < 1:66804/136‑1 (MQ=255) ctctCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAg > 2:66804/1‑135 (MQ=255) tctcCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAgg < 7:64685/135‑1 (MQ=255) tctcCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAgg > 8:64685/1‑135 (MQ=255) ctcCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTa > 5:299478/1‑111 (MQ=255) ctcCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTa < 6:299478/111‑1 (MQ=255) tcCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCa > 4:141192/1‑149 (MQ=255) ccTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCa < 8:322537/147‑1 (MQ=255) cTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCt > 7:52862/1‑149 (MQ=255) tCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCtt > 6:274207/1‑149 (MQ=255) gggggTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCtt < 8:147367/147‑1 (MQ=255) ggggTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCTTGGc < 3:119207/149‑1 (MQ=255) ggTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCTTGGCAAAAAtc > 8:255963/1‑148 (MQ=255) aGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCTTGGCAAAAATCTCCAt < 4:76803/149‑1 (MQ=255) gagaggcctacctgcgcggtgcacggcgggtACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCTTGGCAAAAATCTCCAtc < 2:143556‑M2/118‑1 (MQ=255) tCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCTTGGCAAAAATCTCCATCTCGCCGGAt > 1:175409/1‑149 (MQ=255) agcagcagGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCGTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGTCTGCCCGCTTGCGCCACCTTGGCAAATATCTCAATCTCGCCGGATCTGCCAcc < 6:134067/149‑1 (MQ=255) cagcagGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCTTGGCAAAAATCTCCATCTCGCCGGATCTGCCACCg > 4:104777/1‑148 (MQ=255) cagGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCTTGGCAAAAATCTCCATCTCGCCGGATCTGCCACCGAAGt < 6:128918/149‑1 (MQ=255) ggcgggtACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCTTGGCAAAAATCTCCATCTCGCCGGATCTGCCACCGAAGTcc < 8:199270‑M2/142‑1 (MQ=255) ggatACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCTTGGCAAAAATCTCCATCTCGCCGGATCTGCCACCGAAGTCCAtt > 3:132407‑M2/5‑149 (MQ=255) ggtACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCTTGGCAAAAATCTCCATCTCGCCGGATCTGCCACCGAAGTCCAttt < 3:110408‑M2/146‑1 (MQ=255) ggtACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCTTGGCAAAAATCTCCATCTCGCCGGATCTGCCACCGAAGTCCAttt < 6:158595‑M2/146‑1 (MQ=255) | CCGCAAGCGCCCGCGTGGCACGCCTTGGTCAGTGATGGCTTCTTCCACTTCGAGCATGTCCGCCAGCACCCGCCGTGCACCGCGCAGGTAGGCCTCTCCCTCGGGGGTAAGGGTGAGCGCCCGGGTCGTGCGCAGCAGCAGGCGGGTACCCAGGCGCTGTTCGGTGCGGGCGAGAATGCGGCTGACCGCCG‑AGGGCGTCAGGCCTAGCGCTCGGGCGGCAGCAGACAGGCTGCCCGCTTGCGCCACCTTGGCAAAAATCTCCATCTCGCCGGATCTGCCACCGAAGTCCATTT > NC_002947/2879774‑2880066 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |