New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3444269 = | 41 (0.700) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 9.1% | coding (3028/3270 nt) | PP_3062 | tail length determination protein |
? | NC_002947 | 3444330 = | 41 (0.740) | coding (3089/3270 nt) | PP_3062 | tail length determination protein |
CCGGCGTCGAAAGATCCGTTCCTGTTGCCCGCCATGACGGCCAACAAGGTGCGGTTCCCAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAA > NC_002947/3444122‑3444411 | ccGGCGTCGAAAGATCCGTTCCTGTTGCCCGCCATGACGGCCAACAAGGTGCGGTTCCCAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATc < 7:203626/149‑1 (MQ=255) acgtgcgcgcagccacctcgcgctgccaggcgtcaaacagcccgcgcataccgtttgccatttcgttcagcaattggtttgggtctttaacatcgccatggacagtgagcggcataaccggggcgaatgtgaatgtgttgtccacctTc > 1:81043‑M1/148‑149 (MQ=255) gcgcgcagccacctcgcgctgccaggcgtcaaacagcccgcgcataccgtttgccatttcgttcagcaattggtttgggtctttaacatcgccatggacagtgagcggcataaccggggcgaatgtgaatgtgttgtccacctTCGgcg < 3:29841‑M1/6‑1 (MQ=255) ctcgcgctgccaggcgtcaaacagcccgcgcataccgtttgccatttcgttcagcaattggtttgggtctttaacatcgccatggacagtgagcggcataaccggggcgaatgtgaatgtgttgtccacctTCGGCGCCCAAGCTGCCg < 8:315477‑M1/18‑1 (MQ=255) cttGTTGGCCGTCATGGCGGGCAACAAGGTGCGGTTCCCAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGgc > 6:269165/3‑132 (MQ=255) cttGTTGGCCGTCATGGCGGGCAACAAGGTGCGGTTCCCAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGgc < 5:269165/130‑1 (MQ=255) gTTGCCCGCCATGACGGCCAACAAGGTGCGGTTCCCAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTgc > 2:19600/1‑149 (MQ=255) ttGCCCGCCATGACGGCCAACAAGGTGCGGTTCCCAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTgcc < 3:304204/149‑1 (MQ=255) ttGCCCGCCATGACGGCCAACAAGGTGCGGTTCCCAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGACCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTgcc > 8:301885/1‑149 (MQ=255) gCCCGCCATGACGGCCAACAAGGTGCGGTTCCCAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTgccgc > 3:57879/1‑149 (MQ=255) aCGGCCAACAAGGTGCGGTTCCCAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTaa < 2:266374/149‑1 (MQ=255) aCGGCCAACAAGGTGCGGTTCCCAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTaa < 4:57879/149‑1 (MQ=255) aCGGCCAACAAGGTGCGGTGCCCAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGGGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTaa < 4:307880/149‑1 (MQ=255) caacaaGGTGCGGTTCCCAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCt > 4:365815/1‑149 (MQ=255) aaGGTGCGGTTCCCAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCAcc < 5:41228/149‑1 (MQ=255) aaGGTGCGGTTCCCAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCAcc < 3:43054/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGc > 6:122872/1‑125 (MQ=255) ccAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGc < 5:122872/125‑1 (MQ=255) ccAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGgcgc < 3:64423/148‑1 (MQ=255) gcgcCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAg > 7:271503/1‑149 (MQ=255) gcCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGt > 7:161009/1‑149 (MQ=255) gcCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGt < 8:271503/149‑1 (MQ=255) gttcagcaattggtttgggtctttaacatcgccatggacagtgagcggcataaccggggcgaatgtgaatgtgttgtccacctTCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTg > 7:315477‑M1/84‑149 (MQ=255) aCCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGac < 8:290137/149‑1 (MQ=255) cTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGacaa < 7:218264/149‑1 (MQ=255) cTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGacaa > 3:102380/1‑149 (MQ=255) tgCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAacac < 1:19600/148‑1 (MQ=255) ccACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAAcacattca > 4:152721/1‑148 (MQ=255) ccACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAAcacattca > 5:366725/1‑148 (MQ=255) acaGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAAcacattcacat > 3:150064/1‑149 (MQ=255) ggtctttaacatcgccatggacagtgagcggcataaccggggcgaatgtgaatgtgttgtccacctTCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAg > 7:49390‑M1/67‑129 (MQ=255) ggtctttaacatcgccatggacagtgagcggcataaccggggcgaatgtgaatgtgttgtccacctTCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAg < 8:49390‑M1/63‑1 (MQ=255) aaCCCGAGCCCCCGGCCGTACTGGGGGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCg < 2:188773/149‑1 (MQ=255) aaCCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGAGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGACGCCGAAGGTGGACACCACATTCACATTCGCCCCg > 2:329752/1‑149 (MQ=255) cccGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGt < 4:150064/149‑1 (MQ=255) ccGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGt > 2:65534/1‑148 (MQ=255) gAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTAt < 4:102380/149‑1 (MQ=255) ccGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCAc > 2:122832/1‑100 (MQ=255) tGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGtt > 6:370509/1‑131 (MQ=255) tGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGtt < 5:370509/131‑1 (MQ=255) tgtgGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCGGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATCGCGATg > 5:333551/1‑149 (MQ=255) tgCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTaaa < 6:366725/149‑1 (MQ=255) aTGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCaaa < 3:152721/149‑1 (MQ=255) ccAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGc < 7:116016/128‑1 (MQ=255) ccAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGc > 8:116016/1‑128 (MQ=255) cAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAAt > 2:33301/1‑149 (MQ=255) cAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAAt > 7:241095/1‑149 (MQ=255) cAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAAt > 5:111263/1‑149 (MQ=255) cgcgCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGa < 3:365815/149‑1 (MQ=255) gcgcCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGaa < 6:111263/149‑1 (MQ=255) | CCGGCGTCGAAAGATCCGTTCCTGTTGCCCGCCATGACGGCCAACAAGGTGCGGTTCCCAGGCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAA > NC_002947/3444122‑3444411 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |