New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3444269 = | 41 (0.700) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 9.1% | coding (3028/3270 nt) | PP_3062 | tail length determination protein |
? | NC_002947 | 3444330 = | 41 (0.740) | coding (3089/3270 nt) | PP_3062 | tail length determination protein |
GCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATGCGCGGGCTGTTTGACGCCTGGCAGCGCGAGGTGGCTGCGCGCACGT > NC_002947/3444183‑3444476 | gcgcCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAg > 7:271503/1‑149 (MQ=255) gcCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGt > 7:161009/1‑149 (MQ=255) gcCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGt < 8:271503/149‑1 (MQ=255) gttcagcaattggtttgggtctttaacatcgccatggacagtgagcggcataaccggggcgaatgtgaatgtgttgtccacctTCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTg > 7:315477‑M1/84‑149 (MQ=255) aCCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGac < 8:290137/149‑1 (MQ=255) cTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGacaa < 7:218264/149‑1 (MQ=255) cTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGacaa > 3:102380/1‑149 (MQ=255) tgCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAacac < 1:19600/148‑1 (MQ=255) ccACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAAcacattca > 5:366725/1‑148 (MQ=255) ccACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAAcacattca > 4:152721/1‑148 (MQ=255) acaGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAAcacattcacat > 3:150064/1‑149 (MQ=255) ggtctttaacatcgccatggacagtgagcggcataaccggggcgaatgtgaatgtgttgtccacctTCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAg > 7:49390‑M1/67‑129 (MQ=255) ggtctttaacatcgccatggacagtgagcggcataaccggggcgaatgtgaatgtgttgtccacctTCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAg < 8:49390‑M1/63‑1 (MQ=255) aaCCCGAGCCCCCGGCCGTACTGGGGGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCg < 2:188773/149‑1 (MQ=255) aaCCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGAGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGACGCCGAAGGTGGACACCACATTCACATTCGCCCCg > 2:329752/1‑149 (MQ=255) cccGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGt < 4:150064/149‑1 (MQ=255) ccGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGt > 2:65534/1‑148 (MQ=255) gAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTAt < 4:102380/149‑1 (MQ=255) tGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGtt > 6:370509/1‑131 (MQ=255) tGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGtt < 5:370509/131‑1 (MQ=255) tgtgGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCGGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATCGCGATg > 5:333551/1‑149 (MQ=255) tgCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTaaa < 6:366725/149‑1 (MQ=255) aTGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCaaa < 3:152721/149‑1 (MQ=255) ccAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGc > 8:116016/1‑128 (MQ=255) ccAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGc < 7:116016/128‑1 (MQ=255) cAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAAt > 7:241095/1‑149 (MQ=255) cAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAAt > 5:111263/1‑149 (MQ=255) cAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAAt > 2:33301/1‑149 (MQ=255) cgcgCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGa < 3:365815/149‑1 (MQ=255) gcgcCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGaa < 6:111263/149‑1 (MQ=255) caccttcggcgccggtggcggtgaggccttagcaggtggcggcacctccggcagcttgggcgccgaAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAAc > 7:315477‑M2/67‑149 (MQ=255) cttcggcgccggtggcggtgaggccttagcaggtggcggcacctccggcagcttgggcgccgaAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGAcc < 8:49390‑M2/66‑1 (MQ=255) cttcggcgccggtggcggtgaggccttagcaggtggcggcacctccggcagcttgggcgccgaAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGAcc > 7:49390‑M2/64‑129 (MQ=255) GGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATg > 8:161009‑M1/1‑148 (MQ=255) GCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATgg < 1:64527‑M1/148‑1 (MQ=255) cAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACg > 3:166628/1‑149 (MQ=255) gCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTa > 7:297212/1‑149 (MQ=255) cTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAATCCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTAt < 1:33301/149‑1 (MQ=255) ccGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATgcg > 5:79907/1‑149 (MQ=255) cGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATgcgc < 2:64527/149‑1 (MQ=255) gAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATGCGCgg < 8:241095/149‑1 (MQ=255) gTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATGCGCGGGCt > 6:275102/1‑149 (MQ=255) gccgccACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATGCGCGGGCTGt > 4:29841/1‑149 (MQ=255) ccgcgACCTGCTAAGGCCTCACGGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAAATCATTCACATTCGCCCCTGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGGTGATCGAAATGGCAAACGGTATGCGCGGGCTGtt < 6:333551/149‑1 (MQ=255) ccgccACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGc > 1:282089/1‑128 (MQ=255) ccgccACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGc < 2:282089/128‑1 (MQ=255) cgccACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATGCGCGGGCTGttt < 6:79907/149‑1 (MQ=255) gccACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATGCGCGGGCTGTTTg < 1:65534/149‑1 (MQ=255) ggCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATGCGCGGGCTGTTTGACGCCTGGCAgc < 3:363070/149‑1 (MQ=255) ccTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATGCGCGGGCTGTTTGACGCCTGGCAacgc < 8:297212/149‑1 (MQ=255) cTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATGCGCGGGCTGTTTGACGCCTGGCAgcgc > 7:220315/1‑148 (MQ=255) tCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCTTGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATGCGCGGGCTGTTTGACGCCTGGCAgcgc > 4:257363/1‑147 (MQ=255) cggcagcttgggcgccgaAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATGCGCGGGCTGTTTGACGCCTGGCAGCGCGAg < 8:315477‑M2/131‑1 (MQ=255) cgccgaAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATGCGCGGGCTGTTTGACGCCTGGCAGCGCGAGGTGGCTgcgcgc < 3:29841‑M2/143‑1 (MQ=255) gaAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATGCGCGGGCTGTTTGACGCCTGGCAGCGCGAGGTGGCTGCGCGCACGt > 1:81043‑M2/3‑149 (MQ=255) | GCGCCGACCTTGTGCGGCCACAGCCTCAACCCGAGCCACCGGCCGTACTGGGTGATGTGGTGCGCGAGATGGCCAAGGCCGCGCCATCGGCGCCCAAGCTGCCGGAGGTGCCGCCACCTGCTAAGGCCTCACCGCCACCGGCGCCGAAGGTGGACAACACATTCACATTCGCCCCGGTTATGCCGCTCACTGTCCATGGCGATGTTAAAGACCCAAACCAATTGCTGAACGAAATGGCAAACGGTATGCGCGGGCTGTTTGACGCCTGGCAGCGCGAGGTGGCTGCGCGCACGT > NC_002947/3444183‑3444476 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |