New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3550919 = | 42 (0.710) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 7.0% | coding (71/957 nt) | PP_3135 | glycosyl transferase |
? | NC_002947 | 3551004 = | 41 (0.750) | coding (156/957 nt) | PP_3135 | glycosyl transferase |
CAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGC > NC_002947/3550772‑3551066 | cAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGAt < 4:106250/149‑1 (MQ=255) cagcgagtcggcggcaacgaaggcatcggtattgagcagcaaggcatacttgcccttgaggtgcgccaacaactggttgttggcccggccgaaacccacgttctgcttgttgctcagcagcagtgcctcggggcacacctgggccAtg > 2:233954‑M1/146‑148 (MQ=255) ccTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGAtgcgctgcg < 7:141249/149‑1 (MQ=255) cTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGAtgcgctgcgc > 1:147058/1‑149 (MQ=255) cTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGAtgcgctgcgc > 7:312649/1‑149 (MQ=255) ccGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAAGTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCg > 8:323577/1‑149 (MQ=255) ccGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGcc > 7:10311/1‑148 (MQ=255) cGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGa < 6:36872/149‑1 (MQ=255) ttACGGATGGCGCAAAGTCGTCAGTATTTCTTCGGTGACTGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTgg < 4:287646/149‑1 (MQ=255) aCTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGc < 7:183733/148‑1 (MQ=255) aTGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGtt < 6:56639/149‑1 (MQ=255) aTGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGt > 5:3377/1‑148 (MQ=255) gcgcAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTAcc < 1:224086/149‑1 (MQ=255) gcAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCtg < 5:121664/149‑1 (MQ=255) gTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAAt < 8:312649/149‑1 (MQ=255) tttCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGc < 4:121098/148‑1 (MQ=255) gggACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGa > 4:216960/1‑149 (MQ=255) gggACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGa < 4:285215/149‑1 (MQ=255) gCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTc > 5:349133/1‑149 (MQ=255) cTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCg > 2:118606/1‑149 (MQ=255) cTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCg > 8:124009/1‑149 (MQ=255) cTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCg < 8:212744/149‑1 (MQ=255) cTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCg < 3:216960/149‑1 (MQ=255) cTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGATCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCg < 1:118606/149‑1 (MQ=255) aactggttgttggcccggccgaaacccacgttctgcttgttgctcagcagcagtgcctcggggcacacctgggccATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCg < 3:235234‑M1/74‑1 (MQ=255) tGAAATGGCTAGCAAACCTGTTGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGAAGCAGCCGATGTTCGATGCGCTCAGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCATGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTctg > 6:80472/1‑147 (MQ=255) tGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCgg > 4:361489/1‑149 (MQ=255) aTGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCg > 4:186107/1‑83 (MQ=255) aTGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCg < 3:186107/83‑1 (MQ=255) gttggcccggccgaaacccacgttctgcttgttgctcagcagcagtgcctcggggcacacctgggccATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAgc > 4:235234‑M1/68‑148 (MQ=255) gcccggccgaaacccacggtctgcttgttgctcagcagcagtgcctcggggcacacctgggccATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCAt > 2:14963‑M1/64‑148 (MQ=255) gCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGCTGCAGCGCATg > 7:40576/1‑149 (MQ=255) tCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGAt < 3:208022/116‑1 (MQ=255) tCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGAt > 4:208022/1‑116 (MQ=255) aTGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGAGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTACCTCGATGACTCGTTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGcacc > 2:67641/1‑147 (MQ=255) aCTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCTCGGGGCAcacctg < 7:124009/149‑6 (MQ=255) aCTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCActgctg < 6:3377/149‑1 (MQ=255) aCCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGcaa > 4:140167/1‑149 (MQ=255) tGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAg > 4:303123/1‑148 (MQ=255) gACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCa < 3:303123/148‑1 (MQ=255) ttGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAAc < 7:323577/147‑1 (MQ=255) cAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTgg < 4:294620/148‑1 (MQ=255) ccGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGttt > 2:183746/1‑149 (MQ=255) ccGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGttt > 6:369703/1‑149 (MQ=255) gATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCg < 7:23400/149‑1 (MQ=255) gATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCg < 8:10311/149‑1 (MQ=255) gATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCg > 5:19430/1‑149 (MQ=255) gATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCggg < 6:19430/148‑1 (MQ=255) gATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGc > 2:21069/1‑149 (MQ=255) | CAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGC > NC_002947/3550772‑3551066 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |