New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4350267 = | 39 (0.660) | 5 (0.090) | 4/248 | NT | 10.9% | coding (833/915 nt) | PP_3822 | cytochrome c family protein |
? | NC_002947 | 4350307 = | 45 (0.810) | coding (793/915 nt) | PP_3822 | cytochrome c family protein |
AAATCAGCGTGCCGGTGGCGGCCTCTTCGACGGGCTCACGCGCCAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGC > NC_002947/4350119‑4350412 | aaaTCAGCGTGCCGGTGGCGGCCTCTTCGACGGGCTCACGCGCCAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCACCGACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCATACCATACAGGTTAACCCCATCATAGGCATGAAACTTCa > 7:63943/1‑149 (MQ=255) ctacaactggggggctggcatgcaccgcatcaataccgcggcgtcgttcatcaagtacaacatgccgctgggcaagccgggcagcctcagcgatcagcaggcctgggacgtggcggcgtggatcaaccgccacgagcggccacaggAcc < 2:30082‑M1/3‑1 (MQ=255) gTGCCGGTGGCGGCCTCTTCGACGGGCTCACGCGCCAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGtc < 4:172030/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCGGCCTCTTCGACGGGCTCACGCGCCAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCTGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGtcttct > 2:271745/1‑149 (MQ=255) ggcCTCTTCGACGGGCTCACGCGCCAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGCTCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGACCCTTCCCCCGCGTCTTCTCGATGGa > 3:352224/1‑149 (MQ=255) tctTCGACGGGCTCACGCGCCAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATccc > 2:34630/1‑149 (MQ=255) accgcatcaataccgcggcgtcgttcatcaagtacaacatgccgctgggcaagccgggcagcctcagcgatcagcaggcctgggacgtggcggcgtggatcaaccgccacgagcggccacaggACCAGCGTCTTCTCGATGGATCCctc < 5:194888‑M1/26‑1 (MQ=255) cGACGGGCTCACGCGCCAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCctc < 2:70130/147‑1 (MQ=255) cgcggcgtcgttcatcaagtacaacatgccgctgggcaagccgggcagcctcagcgatcagcaggcctgggacgtggcggcgtggatcaaccgccacgagcggccacaggACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCggg < 6:61379‑M1/39‑1 (MQ=255) gcgtcgttcatcaagtacaacatgccgctgggcaagccgggcagcctcagcgatcagcaggcctgggacgtggcggcgtggatcaaccgccacgagcggccacaggACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCt > 5:61379‑M1/107‑149 (MQ=255) gcgtcgttcatcaagtacaacatgccgctgggcaagccgggcagcctcagcgatcagcaggcctgggacgtggcggcgtggatcaaccgccacgagcggccacaggACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCt > 6:194888‑M1/107‑149 (MQ=255) cgtcgttcatcaagtacaacatgccgctgggcaagccgggcagcctcagcgatcagcaggcctgggacgtggcggcgtggatcaaccgccacgagcggccacaggACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCtg > 4:240460‑M1/106‑149 (MQ=255) agagGACGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACATGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGTATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCtgtg < 7:243861/149‑1 (MQ=255) gccgccACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCctct < 3:229158/126‑1 (MQ=255) gccgccACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCctct > 4:229158/1‑126 (MQ=255) ccgccACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGc < 8:132067/149‑1 (MQ=255) ccgccACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGc > 8:272178/1‑149 (MQ=255) gccACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTc > 5:254181/1‑149 (MQ=255) gCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCgg > 3:107969/1‑149 (MQ=255) cTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACGCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGt < 7:37362/149‑1 (MQ=255) ttACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGtt > 7:192583/1‑149 (MQ=255) tACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGtt > 8:22541/1‑148 (MQ=255) ccTCAGCTACCCGTCCCTTGTCTGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGTTGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGa < 1:271745/148‑1 (MQ=255) ccTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGa < 7:48460/148‑1 (MQ=255) ccTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGAt < 8:192583/149‑1 (MQ=255) ccTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGAt < 7:247405/149‑1 (MQ=255) aCCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATGATTGGCATGAAACTTCACGCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCg < 5:108083/135‑1 (MQ=255) aCCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCg > 6:108083/1‑135 (MQ=255) ccGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGAt > 6:123893/1‑139 (MQ=255) ccGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGAt < 5:123893/139‑1 (MQ=255) gTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTg < 5:140060/128‑1 (MQ=255) gTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTg > 6:140060/1‑128 (MQ=255) tCCGATCATCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCTCCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCGGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAg < 5:20463/148‑1 (MQ=255) cGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGTCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGcc < 1:34630/149‑1 (MQ=255) tCAGCACGCCATGAACCTGGTTACGATACAGGTTAAGCCCATCTTTGGCATGTAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCATCCGGGGGTCCTGTGGGCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCGACGTCCGAGGCctg < 8:63943/148‑1 (MQ=255) ccccATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCg < 7:272178/149‑1 (MQ=255) cccATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCGc > 5:96305/1‑149 (MQ=255) cccATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCGc > 1:124954/1‑149 (MQ=255) aaCCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCGCTGAGGc < 4:107969/149‑1 (MQ=255) ccTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCTGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGACACGTCCCAGGCCTGCTGATCGCTGAGGCTg > 3:191586/1‑149 (MQ=255) aTACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCGCTGAGGCTGCTCGGCTTGc < 2:124954/149‑1 (MQ=255) aGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCGCTGAGGCTGCCCgg < 7:291800/140‑1 (MQ=255) aGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCGCTGAGGCTGCCCgg > 8:291800/1‑140 (MQ=255) aaCCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGc < 7:22541/148‑1 (MQ=255) aaCCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGc < 6:254181/148‑1 (MQ=255) aaaCTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCCCGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCGCTGAGGCTGCCCGCCTTGCCCAGCGCCAGGTTGTACTTGATGAac > 5:167676/1‑148 (MQ=255) cTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAacgacg > 3:19257/1‑149 (MQ=255) ttCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTtgat > 6:192424/1‑140 (MQ=255) ttCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTtgat < 5:192424/140‑1 (MQ=255) ttCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGAcgc > 1:30082/1‑149 (MQ=255) | AAATCAGCGTGCCGGTGGCGGCCTCTTCGACGGGCTCACGCGCCAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCACGTCCCAGGCCTGCTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGC > NC_002947/4350119‑4350412 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |