| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4350267 = | 39 (0.660) | 5 (0.090) | 4/248 | NT | 10.9% | coding (833/915 nt) | PP_3822 | cytochrome c family protein |
| ? | NC_002947 | 4350307 = | 45 (0.810) | coding (793/915 nt) | PP_3822 | cytochrome c family protein | |||||
CCAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCCGCGGTATTGATGCGGTGCATGCCAGCCCCCCAGTTGTAG > NC_002947/4350161‑4350452 | gcgtcgttcatcaagtacaacatgccgctgggcaagccgggcagcctcagcgatcagcaggcctgggacgtggcggcgtggatcaaccgccacgagcggccacaggACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCt > 5:61379‑M1/107‑149 (MQ=255)gcgtcgttcatcaagtacaacatgccgctgggcaagccgggcagcctcagcgatcagcaggcctgggacgtggcggcgtggatcaaccgccacgagcggccacaggACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCt > 6:194888‑M1/107‑149 (MQ=255) cgtcgttcatcaagtacaacatgccgctgggcaagccgggcagcctcagcgatcagcaggcctgggacgtggcggcgtggatcaaccgccacgagcggccacaggACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCtg > 4:240460‑M1/106‑149 (MQ=255) agagGACGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACATGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGTATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCtgtg < 7:243861/149‑1 (MQ=255) ccgccACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGc > 8:272178/1‑149 (MQ=255) ccgccACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGc < 8:132067/149‑1 (MQ=255) gccACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTc > 5:254181/1‑149 (MQ=255) gCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCgg > 3:107969/1‑149 (MQ=255) cTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACGCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGt < 7:37362/149‑1 (MQ=255) ttACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGtt > 7:192583/1‑149 (MQ=255) tACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGtt > 8:22541/1‑148 (MQ=255) ccTCAGCTACCCGTCCCTTGTCTGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGTTGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGa < 1:271745/148‑1 (MQ=255) ccTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGa < 7:48460/148‑1 (MQ=255) ccTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGAt < 7:247405/149‑1 (MQ=255) ccTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGAt < 8:192583/149‑1 (MQ=255) aCCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATGATTGGCATGAAACTTCACGCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCg < 5:108083/135‑1 (MQ=255) aCCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCg > 6:108083/1‑135 (MQ=255) ccGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGAt > 6:123893/1‑139 (MQ=255) ccGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGAt < 5:123893/139‑1 (MQ=255) gTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTg > 6:140060/1‑128 (MQ=255) gTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTg < 5:140060/128‑1 (MQ=255) tCCGATCATCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCTCCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCGGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAg < 5:20463/148‑1 (MQ=255) cGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGTCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGcc < 1:34630/149‑1 (MQ=255) tCAGCACGCCATGAACCTGGTTACGATACAGGTTAAGCCCATCTTTGGCATGTAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCATCCGGGGGTCCTGTGGGCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCG‑‑‑ACGTCCGAGGCctg < 8:63943/148‑1 (MQ=255) ccccATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCg < 7:272178/149‑1 (MQ=255) cccATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGc > 1:124954/1‑149 (MQ=255) cccATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGc > 5:96305/1‑149 (MQ=255) aaCCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGc < 4:107969/149‑1 (MQ=255) ccTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCTGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGAC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTg > 3:191586/1‑149 (MQ=255) aTACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCTCGGCTTGc < 2:124954/149‑1 (MQ=255) aGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCgg > 8:291800/1‑140 (MQ=255) aGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCgg < 7:291800/140‑1 (MQ=255) aaCCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGc < 7:22541/148‑1 (MQ=255) aaCCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGc < 6:254181/148‑1 (MQ=255) aaaCTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCCCGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGCCTTGCCCAGCGCCAGGTTGTACTTGATGAac > 5:167676/1‑148 (MQ=255) caggacccgcggttggtagagggatccatcgagaagacgcgggtCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAacgacg > 4:240460‑M2/45‑149 (MQ=255) cTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAacgacg > 3:19257/1‑149 (MQ=255) ttCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTtgat > 6:192424/1‑140 (MQ=255) ttCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTtgat < 5:192424/140‑1 (MQ=255) ttCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGAcgc > 1:30082/1‑149 (MQ=255) aggacccgcggttggtagagggatccatcgagaagacgcgggtCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGAcgc > 5:61379‑M2/44‑149 (MQ=255) aggacccgcggttggtagagggatccatcgagaagacgcgggtCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGAcgc > 6:194888‑M2/44‑149 (MQ=255) cccgcggttggtagagggatccatcgagaagacgcgggtCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCcgcg < 6:61379‑M2/110‑1 (MQ=255) gcgTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCCTGTAGGACCCAGGCCTGGAGTCATCGCTGAGGCTCCCCGTCTACCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATAAACGccgccg > 1:115097/1‑149 (MQ=255) GCGTCTCCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCCGCGGTa < 4:237999‑M1/149‑1 (MQ=255) tcttctCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCCGCGGTATTg < 4:19257/149‑1 (MQ=255) ctcGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGCCGCCGCGGTATTGATGc > 3:20671/1‑149 (MQ=255) atcGATTGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCGGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCA‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCTCTGAGGCTTCCCTGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCCGCGGTATTGATg < 4:191586/147‑1 (MQ=255) gagggatccatcgagaagacgctggtCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCCGCGGTATTGATGCGGt < 5:194888‑M2/123‑1 (MQ=255) gATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCCGCGGTATTGATGCGGt < 3:237999/149‑1 (MQ=255) gATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGGTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGAGCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCCGCGGTATTGATGCGGt < 4:352224/149‑1 (MQ=255) ccTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTtga < 4:235561/114‑1 (MQ=255) ccTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTtga > 3:235561/1‑114 (MQ=255) ccTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCAGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCCGCGGTATTGATGCGGTGCATGCCa < 6:96305/149‑1 (MQ=255) ccAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCCGCGGTATTGATGCGGTGCATGCCAGccc < 2:115097/147‑1 (MQ=255) cAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCCGCGGTATTGATGCGGTGCATGCCAGcccc < 8:107743/147‑1 (MQ=255) cAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCCGCGGTATTGATGCGGTGCATGCCAGcccc > 7:107743/1‑147 (MQ=255) aaCCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCCGCGGTATTGATGCGGTGCATGCCAGccccc > 3:57112/1‑147 (MQ=255) ccGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCCGCGGTATTGATGCGGTGCATGCCAGCCCCCCAGt > 4:121469/1‑149 (MQ=255) ggtCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCCGCGGTATTGATGCGGTGCATGCCAGCCCCCCAGTTGTAg < 2:30082‑M2/146‑1 (MQ=255) | CCAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGGTTGATCCACGCCGCC‑‑‑ACGTCCCAGGCCTG‑‑CTGATCGCTGAGGCTGCCCGGCTTGCCCAGCGGCATGTTGTACTTGATGAACGACGCCGCGGTATTGATGCGGTGCATGCCAGCCCCCCAGTTGTAG > NC_002947/4350161‑4350452 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |