New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4585270 = | 51 (0.870) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 6.4% | coding (314/1986 nt) | glgE | alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
? | NC_002947 | 4585326 = | 39 (0.690) | coding (258/1986 nt) | glgE | alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
CTCGAGCGCCTCGCGCAGGGCGCCGCTGCACAGCTCGATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTG > NC_002947/4585125‑4585418 | cTCGAGCGCCTCGCGCAGGGCGCCGCTGCACAGCTCGATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAgg > 5:191928/1‑149 (MQ=255) ccgtcagcggccagcctgtggccgtcagcaccaaggcctacagcgacggccacgaccgcctggcggtgatgctcaactggcgccaggcccacagccggcgctggcattgcgtgccgatgcagtcggcgggcaacgacctgtggCAGGcc > 8:176354‑M1/144‑149 (MQ=255) gAGCGCCTCGCGCAGGGCGCCGCTGCACAGCTCGATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCt < 8:315369/149‑1 (MQ=255) cgtcagcggccagcctgtggccgtcagcaccaaggcctacagcgacggccacgaccgcctggcggtgatgctcaactggcgccaggcccacagccggcgctggcattgcgtgccgatgcagtcggcgggcaacgacctgtggCAGGcc < 5:290440‑M1/6‑1 (MQ=255) gcgcCTCGCGCAGGGCGCCGCTGCACAGCTCGATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTc > 2:302841/1‑148 (MQ=255) cTCGCGCAGGGCGCCGCTGCACAGCTCGATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATAc > 5:251829/1‑149 (MQ=255) cTCGCGCAGGGCGCCGCTGCACAGCTCGATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATAc > 3:234491/1‑149 (MQ=255) gccgcTGCACAGCTCGATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCATCTTCCAGTTCCAGTTTTCCCACGACGCCGGCGTGCTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCg > 5:259360/1‑149 (MQ=255) ccgcTGCACAGCTCGATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCgg > 7:23995/1‑149 (MQ=255) gCACAGCTCGATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGcc > 3:250052/1‑147 (MQ=255) acaGCTCGATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGc > 4:326291/1‑149 (MQ=255) acaGCTCGATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGc > 3:348216/1‑149 (MQ=255) acaGCTCGATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGc < 6:191928/149‑1 (MQ=255) caGCTCGATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCt < 6:251829/149‑1 (MQ=255) cGATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTg < 4:348216/149‑1 (MQ=255) gATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGTTGCGGGCCCAGCTCGGTg < 1:129854/148‑1 (MQ=255) tGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTgggg < 3:326291/149‑1 (MQ=255) cTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGt > 5:96743/1‑148 (MQ=255) tttGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGAGACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTg > 2:68423/1‑148 (MQ=255) ccAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCTATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTgggg > 4:356954/1‑140 (MQ=255) ccAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGAGACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCg > 8:157704/1‑149 (MQ=255) ccAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGGGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTgggg < 3:356954/140‑1 (MQ=255) cAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGTCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCgg < 7:40981/149‑1 (MQ=255) cAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCgg > 8:166335/1‑149 (MQ=255) cATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAAAAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATAATGAACCGGTCCGGGCCCAGCTCGGTCGGGGTGAATTAGGc > 7:338387/1‑147 (MQ=255) acgaccgcctggcggtgatgctcaactggcgccaggcccacagccggcgctggcattgcgtgccgatgcagtcggcgggcaacgacctgtggCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGc > 1:9994‑M1/93‑149 (MQ=255) accgcctggcggtgatgctcaactggcgccaggcccacagccggcgctggcattgcgtgccgatgcagtcggcgggcaacgacctgtggCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCca < 4:296058‑M1/59‑1 (MQ=255) aGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCAAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGATCGGTGGGGGTGATTTCGGCCAGcaa > 2:273446/1‑146 (MQ=255) cgcctggcggtgatgctcaactggcgccaggcccacagccggcgctggcattgcgtgccgatgcagtcggcgggcaacgacctgtggCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAg > 3:296058‑M1/88‑149 (MQ=255) ttcttcCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTgg > 6:204712/1‑122 (MQ=255) ttcttcCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTgg < 5:204712/122‑1 (MQ=255) cctggtccagtgTTACCTAGCCGCCGGCGTGGGACTTCATCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGcc < 6:259360/143‑1 (MQ=255) ccagttccagttTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGATGCAATTGGTTGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTg < 1:302841/146‑1 (MQ=255) ttttGCCTCGACGGCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGGCGATCCAGGCCGCGAGACTGAACCGTTGCGGGCCCCCCACGGTGGGGGTGATTGCGGCGAGCCACAGGTCGTTGCCCGCGGagagca > 2:177344/1‑144 (MQ=255) cTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCcac > 6:323558/1‑121 (MQ=255) cTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCcac < 5:323558/121‑1 (MQ=255) cTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGc > 5:19987/1‑148 (MQ=255) cTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGc < 6:19987/148‑1 (MQ=255) tCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCCGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCAc > 5:61017/1‑149 (MQ=255) tCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCAc > 6:290440/1‑149 (MQ=255) cGCCGGCGTGGTACTTCTTGTCCATATCGGTGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCTGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCaa < 5:378661/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAAt < 7:166335/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAAt < 1:68423/149‑1 (MQ=255) ggCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGcc > 4:42091/1‑149 (MQ=255) gTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGGGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAgc < 4:167288/149‑1 (MQ=255) cttcttCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGc < 4:72015/139‑1 (MQ=255) cttcttCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGc > 3:72015/1‑139 (MQ=255) ctcCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCtgtg < 2:79335/147‑1 (MQ=255) ctcCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTgg < 7:225611/148‑1 (MQ=255) tcCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTAGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGc > 3:323473/1‑149 (MQ=255) cactAGGTGGGAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAAGCGGTGCGGGCCCTGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGtt < 1:273446/146‑1 (MQ=255) cAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGtt < 4:234491/149‑1 (MQ=255) aaTAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGtt > 5:197023/1‑148 (MQ=255) aTAGGTGGCAATCGGGGCGATCCAGGCGTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCTGTGGGGGTGAATTCGGCCTGGCACTGGTAGTTGCCCGCCGACTTCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGa < 1:177344/149‑1 (MQ=255) aaaCGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTAGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCAGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTCGAGCATCACCg > 5:146275/1‑149 (MQ=255) aCGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAACTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGc > 4:247596/1‑148 (MQ=255) gggTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAg < 6:96743/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCg > 4:345567/1‑149 (MQ=255) CAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTg > 4:323473‑M1/1‑149 (MQ=255) CAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTg > 3:42091‑M1/1‑149 (MQ=255) | CTCGAGCGCCTCGCGCAGGGCGCCGCTGCACAGCTCGATGCCTTTGCCCAGCATCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTG > NC_002947/4585125‑4585418 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |