New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4585270 = | 51 (0.870) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 6.4% | coding (314/1986 nt) | glgE | alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
? | NC_002947 | 4585326 = | 39 (0.690) | coding (258/1986 nt) | glgE | alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
TCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGG > NC_002947/4585178‑4585474 | acgaccgcctggcggtgatgctcaactggcgccaggcccacagccggcgctggcattgcgtgccgatgcagtcggcgggcaacgacctgtggCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGc > 1:9994‑M1/93‑149 (MQ=255) accgcctggcggtgatgctcaactggcgccaggcccacagccggcgctggcattgcgtgccgatgcagtcggcgggcaacgacctgtggCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCca < 4:296058‑M1/59‑1 (MQ=255) aGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCAAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGATCGGTGGGGGTGATTTCGGCCAGcaa > 2:273446/1‑146 (MQ=255) cgcctggcggtgatgctcaactggcgccaggcccacagccggcgctggcattgcgtgccgatgcagtcggcgggcaacgacctgtggCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAg > 3:296058‑M1/88‑149 (MQ=255) cctggtccagtgTTACCTAGCCGCCGGCGTGGGACTTCATCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGcc < 6:259360/143‑1 (MQ=255) ccagttccagttTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGATGCAATTGGTTGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTg < 1:302841/146‑1 (MQ=255) ttttGCCTCGACGGCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGGCGATCCAGGCCGCGAGACTGAACCGTTGCGGGCCCCCCACGGTGGGGGTGATTGCGGCGAGCCACAGGTCGTTGCCCGCGGagagca > 2:177344/1‑144 (MQ=255) cTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCcac > 6:323558/1‑121 (MQ=255) cTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCcac < 5:323558/121‑1 (MQ=255) cTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGc > 5:19987/1‑148 (MQ=255) cTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGc < 6:19987/148‑1 (MQ=255) tCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCCGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCAc > 5:61017/1‑149 (MQ=255) tCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCAc > 6:290440/1‑149 (MQ=255) cGCCGGCGTGGTACTTCTTGTCCATATCGGTGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCTGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCaa < 5:378661/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAAt < 1:68423/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAAt < 7:166335/149‑1 (MQ=255) ggCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGcc > 4:42091/1‑149 (MQ=255) gTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGGGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAgc < 4:167288/149‑1 (MQ=255) cttcttCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGc > 3:72015/1‑139 (MQ=255) cttcttCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGc < 4:72015/139‑1 (MQ=255) ctcCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCtgtg < 2:79335/147‑1 (MQ=255) ctcCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTgg < 7:225611/148‑1 (MQ=255) tcCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTAGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGc > 3:323473/1‑149 (MQ=255) cactAGGTGGGAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAAGCGGTGCGGGCCCTGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGtt < 1:273446/146‑1 (MQ=255) cAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGtt < 4:234491/149‑1 (MQ=255) aaTAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGtt > 5:197023/1‑148 (MQ=255) aTAGGTGGCAATCGGGGCGATCCAGGCGTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCTGTGGGGGTGAATTCGGCCTGGCACTGGTAGTTGCCCGCCGACTTCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGa < 1:177344/149‑1 (MQ=255) aaaCGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTAGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCAGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTCGAGCATCACCg > 5:146275/1‑149 (MQ=255) aCGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAACTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGc > 4:247596/1‑148 (MQ=255) gggTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAg < 6:96743/149‑1 (MQ=255) ctgtggcaggccgaattcacccccaccgagctgggcccgcaccggttcagtatcgaggcctgCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCg > 3:296058‑M2/63‑149 (MQ=255) tggcaggccgaattcacccccaccgagctgggcccgcaccggttcagtatcgaggcctgCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGt < 4:296058‑M2/89‑1 (MQ=255) tCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCg > 4:345567/1‑149 (MQ=255) gcaggccgaattcacccccaccgagctgggcccgcaccggttcagtatcgaggcctgCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGt > 1:9994‑M2/58‑149 (MQ=255) CAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTg > 3:42091‑M1/1‑149 (MQ=255) CAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTg > 4:323473‑M1/1‑149 (MQ=255) GGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGc < 3:110023‑M1/149‑1 (MQ=255) CTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTgg < 2:273796‑M1/112‑1 (MQ=255) CTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTgg > 1:273796‑M1/1‑112 (MQ=255) aaCCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGc > 4:11744/1‑149 (MQ=255) gTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTgg < 3:11744/149‑1 (MQ=255) gTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTgg < 7:157704/149‑1 (MQ=255) cGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGc > 4:135767/1‑149 (MQ=255) gCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGa < 4:110023/149‑1 (MQ=255) cctgCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTg < 3:164919/137‑1 (MQ=255) ccAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTg > 4:164919/1‑140 (MQ=255) gCTAGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGc > 8:64108/1‑148 (MQ=255) cTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCca > 7:118784/1‑149 (MQ=255) cgggtggggTGATTTCGGCGGGGCTGAGGTCGGGGCCGGCGGACTGCATCTGCACTGAATGCCAGCGCCGTCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGGATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCGTTGGTGCTGACGGCcac < 8:338387/143‑1 (MQ=255) ggTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCcac < 8:23995/147‑1 (MQ=255) ggTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCca > 2:258262/1‑146 (MQ=255) ggTGGGGGGGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCcaca < 1:258262/148‑1 (MQ=255) ggTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGc > 8:225730/1‑149 (MQ=255) ggcctgCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACgg > 8:176354‑M2/7‑149 (MQ=255) ggcctgCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACg < 5:290440‑M2/142‑1 (MQ=255) ccACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTgg < 6:61017/149‑1 (MQ=255) | TCAAGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGG > NC_002947/4585178‑4585474 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |