New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4986305 | 53 (0.900) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 5.1% | coding (547/753 nt) | flgA | flagella basal body P‑ring formation protein |
? | NC_002947 | = 4986339 | 61 (1.090) | coding (581/753 nt) | flgA | flagella basal body P‑ring formation protein |
AAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGGTGACGTGGCCCTGCGCGAGCGCGATGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTC > NC_002947/4986161‑4986453 | aaGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGGTGACGTGGCCCTGCGCGAGCGCGATGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCCCACCCCg < 4:82739/147‑1 (MQ=255) gcgcGACAACACGGTCGGCGAAGGTGACGTGGCCCTGCGCGAGCGCGATGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCaa > 1:22152/1‑148 (MQ=255) gACAACACGGTCGGCGAAGGTGACGTGGCCCTGCGCGAGCGCGATGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCt < 1:298120/149‑1 (MQ=255) acacGGTCGGCGAAGGTGACGTGGCCCTGCGCGAGCGCGATGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGaa > 1:176252/1‑149 (MQ=255) ggTCGGCGAAGGTGACGTGGCCCTGCGCGAGCGCGATGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGCCCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAgg > 2:12820/1‑149 (MQ=255) tCGGCGAAGGTGACGTGGCCCTGCGCGAGCGCGATGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGcc > 1:234385/1‑149 (MQ=255) tCGGCGAAGGTGACGTGGCCCTGCGCGAGCGCGATGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGcc < 4:73077/149‑1 (MQ=255) gCGAAGGTGACGTGGCCCTGCGCGAGCGCGATGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAg < 2:176252/149‑1 (MQ=255) ccccGCGCGAGCGCGATGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCttgcgcaccacctcggcctgttccagatgttgcggggt < 1:158485‑M1/149‑39 (MQ=255) ccTGCGCGAGCGCGATGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCttgcgcaccacctcggcctgttccagatgttgcggggtg > 8:186356‑M1/1‑110 (MQ=255) cgcgagcgcgaTGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGGAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGAcc < 2:15738/148‑1 (MQ=255) cgcgagcgcgaTGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCttgcgcaccacctcggcctgttccagatgttgcggggtgagc < 7:186356‑M1/148‑43 (MQ=255) gcgcgaTGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAggtgg < 6:46562/149‑1 (MQ=255) gcgaTGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGAGCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAggtggt > 5:880/1‑148 (MQ=255) gcgaTGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAggtggt > 5:83680/1‑148 (MQ=255) gaTGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGAt > 1:93561/1‑149 (MQ=255) gaTGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGAt > 1:191958/1‑149 (MQ=255) tGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCa > 1:138979/1‑149 (MQ=255) ctCGGCACCCTCGGCCACCGCTTTCTGACCGACCTGGACCAGGCGGTGGGAATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGAGCTCACCCACCACCATCAGGAATAGGCCGACGTCGTCCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGAtaaa > 6:312036/2‑146 (MQ=255) gCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGcc > 5:95069/1‑149 (MQ=255) aCCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCg > 2:138766/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCa < 3:246793/149‑1 (MQ=255) tGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAgggtga > 6:15276‑M2/1‑118 (MQ=255) ccAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTTCCCGCATTggaa > 3:201788/1‑147 (MQ=255) cAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAg > 4:327484/1‑149 (MQ=255) cTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCTGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCTACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTTACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTTGCAGCCTGa < 8:112111/149‑1 (MQ=255) cTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCt > 5:377291/1‑147 (MQ=255) tCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTGACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCTCAAGGGAGACCAGGTTGTGATCATTGCGCGCAGTGGCAGCCTGAgt < 8:93533/148‑1 (MQ=255) tCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAgt < 7:212910/148‑1 (MQ=255) ccGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTg > 8:330896/1‑132 (MQ=255) ccGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTg < 7:330896/132‑1 (MQ=255) gACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCgg < 1:273761/148‑1 (MQ=255) gACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCCCATGCCgg < 2:234385/148‑1 (MQ=255) gACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGAGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCgg > 2:273761/1‑148 (MQ=255) aGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGaa < 2:191958/149‑1 (MQ=255) gTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCtt > 3:109812/1‑149 (MQ=255) tGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTg < 6:95069/149‑1 (MQ=255) ggCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCCTTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGa < 6:880/148‑1 (MQ=255) cATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGc > 3:174575/1‑148 (MQ=255) aTGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGc > 7:216594/1‑147 (MQ=255) aTGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCaa < 1:12820/149‑1 (MQ=255) gAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAgg > 8:312448/1‑149 (MQ=255) gAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAgg > 7:266901/1‑149 (MQ=255) tgcGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGGTCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCt > 3:352546/1‑148 (MQ=255) tgcGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCt > 4:347896/1‑148 (MQ=255) cgcCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTga < 2:22152/148‑1 (MQ=255) cgacccACGGTGATCGACGAGGTGCTGACCCCGCTTCATCTGGAATAGGCCGAGGTGGTGAGCAAGGGTGTCCAGGTGGTTATGTTTGCGCGGAGTGGCAGGCTTTGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGTGCAAGGGCGGCATgag < 5:312036/146‑1 (MQ=255) cccACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTgagcga < 8:266901/149‑1 (MQ=255) cccACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTgagc > 3:114678/1‑147 (MQ=255) cACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGa > 8:215984/1‑128 (MQ=255) cACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGa < 7:215984/128‑1 (MQ=255) cACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCCTGAGCAAGGGCGGCCTgagcgag > 8:22210/1‑148 (MQ=255) aTCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCg > 4:185105/1‑149 (MQ=255) cGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGCTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGAGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCgg > 3:155325/1‑148 (MQ=255) ccAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCCTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTAc < 7:22210/149‑1 (MQ=255) gTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCaa > 1:289456/1‑149 (MQ=255) gTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCaa > 3:353827/1‑149 (MQ=255) tGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAAc < 3:327484/149‑1 (MQ=255) gCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAgggtgagcacctggtcgatcaccgtggggcgcagcatcttcatgcccaccgcctggtccagctcggtcagaaagccctggcccagggtgccgacatcgcgctcgcg < 7:186356‑M2/148‑107 (MQ=255) tCACCCttgcgcaccacctcggcctgttccagatgttgcggggtgagcacctggtcgatcaccgtggggcgcagcatcttcatgcccaccgcctggtccagctcggtcagaaagccctggccca > 6:15276‑M1/1‑6 (MQ=255) tCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCt > 8:117783/1‑148 (MQ=255) cACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAgggtgagcacctggtcgatcaccgtggggcgcagcatcttcatgcccaccgcctggtccagctcggtcagaaagccctggcccagggtgccgacatcgcgctcgcgcagg > 8:186356‑M2/1‑39 (MQ=255) aCCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAgggtgagcacctggtcgatcaccgtggggcgcagcatcttcatgcccaccgcctggtccagctcggtcagaaagccctggcccagggtgccgacatcgcgctcgcgcgggg < 1:158485‑M2/149‑112 (MQ=255) aCCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCaa < 4:109812/149‑1 (MQ=255) aCCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCaa > 1:294332/1‑149 (MQ=255) ccGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGGTCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTc < 4:352546/149‑1 (MQ=255) | AAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGGTGACGTGGCCCTGCGCGAGCGCGATGTCGGCACCCTGGGCCAGGGCTTTCTGACCGAGCTGGACCAGGCGGTGGGCATGAAGATGCTGCGCCCCACGGTGATCGACCAGGTGCTCACCCCGCAACATCTGGAACAGGCCGAGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTC > NC_002947/4986161‑4986453 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |