New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4986472 | 50 (0.850) | 4 (0.070) | 3/254 | NT | 7.2% | coding (714/753 nt) | flgA | flagella basal body P‑ring formation protein |
? | NC_002947 | = 4986487 | 54 (0.950) | coding (729/753 nt) | flgA | flagella basal body P‑ring formation protein |
AGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGCCGACAGGCGGCAATGCATTTGTGCCTAAAGTTT > NC_002947/4986327‑4986620 | aGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAgg < 3:185105/149‑1 (MQ=255) aGGTGGTGCGCAAGGGGGACCAGGGGGTGATCATTGCCCGCAGGGGCAGCCTGAGGGGGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGACCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAACGCCacg < 2:289456/149‑3 (MQ=255) tgCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCagggccgg > 5:34427‑M1/1‑140 (MQ=255) gcAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGc > 3:133424/1‑149 (MQ=255) cAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGcc > 7:292919/1‑149 (MQ=255) gggTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGg < 8:86887‑M2/149‑2 (MQ=255) gggTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGg > 4:133424‑M2/1‑148 (MQ=255) gACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGggc < 6:267103‑M2/147‑4 (MQ=255) aGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTc > 3:215235/1‑149 (MQ=255) ggtgATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAgg < 8:216594/149‑1 (MQ=255) gtgATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGt < 4:215235/149‑1 (MQ=255) aTCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCa < 6:83680/148‑1 (MQ=255) tCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAg < 2:294332/148‑1 (MQ=255) cGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGc < 4:174575/149‑1 (MQ=255) gCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAgg > 8:343334/1‑110 (MQ=255) gCAGGGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAgg < 7:343334/110‑1 (MQ=255) gTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGc < 3:347896/149‑1 (MQ=255) gCAGCCTTTGTGTGCGGATGCCGGGCGAAGCGTTGAGCTAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGTTTCGGGTACCCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCcgggcgggtcaccctggccttgaccacgcgtttggaattgaggttgcg < 6:34427‑M1/149‑49 (MQ=255) gCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGccac > 6:125829/1‑149 (MQ=255) cAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGccacc < 6:377291/149‑1 (MQ=255) aGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGccacc > 1:301232/1‑148 (MQ=255) aGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGccacc < 2:301232/148‑1 (MQ=255) tGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGAtt > 1:7345/1‑149 (MQ=255) gAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTg > 3:333345/1‑149 (MQ=255) aGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTgc > 7:123822/1‑149 (MQ=255) tgCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCt < 4:225693/148‑1 (MQ=255) aTGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGt > 5:36597/1‑149 (MQ=255) tGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTg < 4:353827/149‑1 (MQ=255) cGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAgg < 8:123822/149‑1 (MQ=255) cGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAg > 3:189490/1‑148 (MQ=255) gAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAgg < 5:63909/115‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAgg > 6:63909/1‑115 (MQ=255) aGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCt > 6:11915/1‑149 (MQ=255) cTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCcgggccggtcaccctggccttgaccac < 6:179368‑M1/97‑28 (MQ=255) cTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCcgggccggtcaccctggccttgaccac > 5:179368‑M1/1‑70 (MQ=255) ttGAGCTAGGGCGGCCTGTGCGAGCAGATTGGGGTACGGTTCCTGAATTGCAAACGCGTGGTCTAGGCGTGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGt < 8:223684/102‑1 (MQ=255) ttGAGCAAGGGCGGCCTGAGAGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTCGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGCTCGAGGTCAGt > 7:223684/1‑102 (MQ=255) gCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTaa < 5:17787/149‑1 (MQ=255) gcAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGt > 3:311587/1‑149 (MQ=255) cAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGtt > 1:29891/1‑149 (MQ=255) gATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTcg < 5:267103/149‑1 (MQ=255) gATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTcg > 8:104171/1‑149 (MQ=255) aTTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTcgc > 5:187141/1‑149 (MQ=255) tACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTTAGAACACGGGTTCGCGGGCTTg > 2:129738/1‑149 (MQ=255) aCGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGc > 6:159664/1‑149 (MQ=255) cGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGc < 6:36597/148‑1 (MQ=255) cGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCCGCCCGggccttgaccacgcgtttggaattgaggttgggtacccgaaactgctcgctcaggccgccctagctcaacgcttcgcccggcatccgcacacaaaggctgc < 6:34427‑M2/149‑102 (MQ=255) gCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGcc > 4:94477/1‑148 (MQ=255) gCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGcc > 1:346687/1‑148 (MQ=255) ccTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGCCGACAg > 2:11665/1‑149 (MQ=255) ccTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGCCGACAg > 8:185071/1‑149 (MQ=255) tCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGCCGACAGGCGGCaa > 5:73497/1‑149 (MQ=255) cAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGCCGACAGGCGGCAAt < 5:125829/148‑1 (MQ=255) aCGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCgg > 1:212462/1‑125 (MQ=255) aCGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCgg < 2:212462/125‑1 (MQ=255) gcgTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGCCGACAGGCGGCAATGCAttt < 6:73497/149‑1 (MQ=255) gcgTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGCCGACAGGCGGCAATGCAttt < 4:311587/149‑1 (MQ=255) gcgTGGGCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGCACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGCCGACAGGCGGCAATGCAttt < 2:93561/149‑1 (MQ=255) cgTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGCCGACAGGCGGCAATGCATTtg > 3:137915/1‑149 (MQ=255) gTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGggccttgaccacgcgtttggaattgaggttgcgtacccgaatctgctcgctcaggccgcccttgctcaag < 6:179368‑M2/97‑71 (MQ=255) gTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGggccttgaccacgcgtttggaattgaggttgcgtacccgaatctgctcgctcaggccgcccttgctcaag > 5:179368‑M2/1‑27 (MQ=255) gTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGCCGACAGGCGGCAATGCATTtgt < 2:346687/149‑1 (MQ=255) ggTCCAGGCCAGGGTGCCCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGCCGACAGGCGGCAATGCATTTGTGc < 8:292919/149‑1 (MQ=255) ggTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGCCGACAGGCGGCAATGCATTTGTGc < 7:86887/149‑1 (MQ=255) aGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAATACGGGTTCGCGGGCTTGCCGACAGGCGGCAATGCATTTGTGCCTa > 2:196421/1‑147 (MQ=255) gCCcgggccggtcaccctggccttgaccacgcgtttggaattgaggttgcgtacccgaatctgctcgctcaggccgcccttgctcaaggcttcgcccggcatgcgcacactcaggctgccactgcgggcaatgatcaccacctggtc < 6:267103‑M1/147‑145 (MQ=255) ccAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGCCGACTGGCGGCAATGCATTTGTGCCTAAAGtt < 1:11665/149‑1 (MQ=255) ccgggccggtcaccctggccttgaccacgcgtttggaattgaggttgcgtacccgaatctgctcgctcaggccgcccttgctcaaggcttcgcccggcatgcgcacactcaggctgccactgcgggcaatgatcaccacctggtcaccc > 4:133424‑M1/1‑1 (MQ=255) ccgggccggtcaccctggccttgaccacgcgtttggaattgaggttgcgtacccgaatctgctcgctcaggccgcccttgctcaaggcttcgcccggcatgcgcacactcaggctgccactgcgggcaatgatcaccacctggtcaccc < 8:86887‑M1/149‑149 (MQ=255) | AGGTGGTGCGCAAGGGTGACCAGGTGGTGATCATTGCCCGCAGTGGCAGCCTGAGTGTGCGCATGCCGGGCGAAGCCTTGAGCAAGGGCGGCCTGAGCGAGCAGATTCGGGTACGCAACCTCAATTCCAAACGCGTGGTCAAGGCCAGGGTGACCGGCCCGGGCCAGGTCGAGGTCAGTATGTAGGCTAGCCACCAGATTGCGCTGGCAGTGAGGAACCGCTTTTCCTAAACTGTGTCAGAACACGGGTTCGCGGGCTTGCCGACAGGCGGCAATGCATTTGTGCCTAAAGTTT > NC_002947/4986327‑4986620 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |