New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1775341 | 44 (0.750) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 9.3% | coding (521/1077 nt) | PP_1582 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1775416 | 37 (0.670) | coding (596/1077 nt) | PP_1582 | hypothetical protein |
GGTACCTGGCACCAGTCCGTACATCGGCATCTACGATGTGGTGAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCCTACTACGGGTCTGCAAAGATTCAGAACGGTGACGTGGTATGCGCTCCGTACACTGCCGCTACGATTG > NC_002947/1775270‑1775559 | ggTACCTGGCACCAGTCCGTACATCGGCATCTACGATGTGGTGAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGtg < 8:191396‑M2/149‑3 (MQ=255) cTGGCACCAGTCCGTACATCGGCATCTACGATGTGGTGAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGTTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCTGATTTTGTTGATCCCCTACGGtgcgcag < 6:43014‑M2/149‑8 (MQ=255) gCACCAGTCCGTACATCGGCATCTACGATGTGGTGAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGAGCATGGAGGTCCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGATGCCAGATGGCCGGATTTTTTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCa > 5:173883/1‑149 (MQ=255) cGTACATCGGCATCTACGATGTGGTGAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGCCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCAt > 8:332314/1‑148 (MQ=255) tACATCGGCATCTACGATGTGGTGAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTa > 8:128758/1‑149 (MQ=255) aTCGTCATCTACGATGTGGTTAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGa < 6:173883/149‑1 (MQ=255) tCGGCATCTACGATGTGGTGAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGAc < 4:367491/149‑1 (MQ=255) ggCATCTACGATGTGGTGAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGAccc > 6:61036/1‑149 (MQ=255) aCGATGTGGTGAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGa > 8:113058/1‑139 (MQ=255) aCGATGTGGTGAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGa < 7:113058/139‑1 (MQ=255) cGATGTGGTGAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATc < 4:293423/145‑1 (MQ=255) gATGTGGTGAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCaa < 5:43014/149‑1 (MQ=255) tggtgAAGAATAGCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAacac < 3:142074/148‑1 (MQ=255) gtgAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCt < 5:73657/148‑1 (MQ=255) tgAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTg > 5:51736/1‑148 (MQ=255) ccTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTg < 5:8322/149‑1 (MQ=255) cTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTTCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGtgcgcaggcccttgggtgaaggtattcttcaccacatcgtagatgccgatgta < 7:240362‑M2/149‑54 (MQ=255) cTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGGCCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTgg > 5:330223/1‑149 (MQ=255) cAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCgg > 1:357908/1‑149 (MQ=255) aGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCTGTGTTGCCGAAGAGCTTCCAGATGGCCGGATTTTGTTGCTCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCATCACCTGTACCATAGTGGTCACCGTGa < 2:365138/149‑1 (MQ=255) gCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTa > 3:163925/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGtgcgcaggcccttgggtgaaggtattcttcaccacatcgtagatgccgatgtacggactggtgc < 4:44255‑M2/147‑65 (MQ=255) cgcATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTc < 4:163925/148‑1 (MQ=255) ctgGAGGGGCGGAGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCGGCCAGATCGCCGGATTTTGTTCCTCCCCTACGGtgcgcaggcccttgggtgaaggtattcttcaccacatcgtagatgccgatgtacggactggtgccaggtacca > 8:240362‑M2/2‑76 (MQ=255) gAGTTGCGGCGACCAGCTATTTCAGTGGTGCCGAATAGCTGCGAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTCCGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGTCCCGATGGCCAAGACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGTATTACCTCGGCTGcc < 8:165589/149‑1 (MQ=255) gAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGc < 7:128758/148‑1 (MQ=255) gTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCctac < 6:51736/149‑1 (MQ=255) cggcgACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGtgcgcaggcccttgggtgaaggtattcttcaccacatcgtagatgccgatgtacggactggtgccaggtaccagaatgacc > 3:44255‑M2/1‑67 (MQ=255) gACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCCTACTACGGGt > 8:37418/1‑149 (MQ=255) ccTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTAc > 4:295851/1‑124 (MQ=255) ccTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTAc < 3:295851/124‑1 (MQ=255) tttCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCCTACTACGGGTCTGCAAAGa < 6:330223/149‑1 (MQ=255) aGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCCTACTACGGGTCTGCAAAGATTCa < 7:191396/149‑1 (MQ=255) gtggtgCCGAAGAGCTGCGAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCCTACTACGGGTCTGCAAAGATTCAg < 7:332314/149‑1 (MQ=255) cGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCCTACTACGGGTCTGCAAAGATTCAGAACGGTg < 6:246571/149‑1 (MQ=255) gAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTAAGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGca > 8:134271/1‑116 (MQ=255) tGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCCTACTACGGGTCTGCAAAGATTCAGAACGGTGACGTGGTa > 7:216556/1‑149 (MQ=255) ccAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCCTACTACgg < 3:252039/116‑1 (MQ=255) ccAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCCTACTACgg > 4:252039/1‑116 (MQ=255) ccGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCCTACTACGGGTCTGCAAAGATTCAGAACGGTGACGTGGt > 3:195370/1‑138 (MQ=255) ccGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCCTACTACGGGTCTGCAAAGATTCAGAACGGTGACGTGGt < 4:195370/138‑1 (MQ=255) ccGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCCTACTACGGGTCTGCAAAGATTCAGAACGGTGACGTGGTATGCGCTCCg > 1:201005/1‑148 (MQ=255) ggATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACCCCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCCTACTACGGGTCTGCAAAGATTCAGAGCGGGGACGTGGTAGGCGCTCCGTac > 8:152872/1‑149 (MQ=255) cTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCCTACTACGGGTCTGCAAAGATTCAGAACGGTGACGTGGTATGCGCTCCGTACACTGCCGCTACGATTg > 1:44456/1‑149 (MQ=255) | GGTACCTGGCACCAGTCCGTACATCGGCATCTACGATGTGGTGAAGAATACCTTCACCCAAGGGCCTGCGCATGGAGGTGCGGCGACCACCTATTTCAGTGGTGCCGAAGAGCTGCCAGATGGCCGGATTTTGTTGATCCCCTACGGTGCGCAGGCATTCGTCATCTACGACCCGATCGCCAACACCTGTACCAAAGTGGTCACCGGGATTACCTCGGCTGCCTACTACGGGTCTGCAAAGATTCAGAACGGTGACGTGGTATGCGCTCCGTACACTGCCGCTACGATTG > NC_002947/1775270‑1775559 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |