New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4679619 | 43 (0.730) | 4 (0.070) | 3/246 | NT | 9.0% | coding (338/447 nt) | rnhA | ribonuclease H |
? | NC_002947 | = 4679643 | 41 (0.740) | coding (314/447 nt) | rnhA | ribonuclease H |
CGATTGTACCCCAGCTCAACGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCACGCTTGAGCGA > NC_002947/4679495‑4679785 | cgATTGTACCCCAGCTCAACGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAgctgct < 8:54854/149‑1 (MQ=255) gATTGTACCCCAGCTCAACGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTg < 7:289721‑M2/149‑2 (MQ=255) ttGTACCCCAGCTCAACGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATTTGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTgcc > 1:196054‑M2/1‑146 (MQ=255) gCTCAACGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGc < 4:301050/149‑1 (MQ=255) tCAACGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGt > 6:229440/1‑149 (MQ=255) cGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGttctt > 5:297724/1‑149 (MQ=255) gggCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCAcc < 4:286206/149‑1 (MQ=255) ggCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCAcc < 5:203940/148‑1 (MQ=255) gcgcgcACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCgg < 5:229440/149‑1 (MQ=255) cTCATCGACCCCATGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACGTCGAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTgg > 1:300468/1‑149 (MQ=255) cTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTgg > 1:339206/1‑149 (MQ=255) cTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTgg > 5:372220/1‑149 (MQ=255) aTCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTggcgg > 1:307356/1‑149 (MQ=255) gACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTAGCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAgctgct > 1:118535/1‑110 (MQ=255) gACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAgctgct < 2:118535/110‑1 (MQ=255) cACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTc > 1:51925/1‑149 (MQ=255) ctgTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTTGCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACACACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCa < 6:141997/147‑1 (MQ=255) ggcGGAGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCTCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGcttctt < 4:225730/145‑1 (MQ=255) gTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCttcttc < 3:281922/148‑1 (MQ=255) cgcgTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGtt > 8:232606/1‑148 (MQ=255) ccGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTc < 6:297724/149‑1 (MQ=255) ccGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTc < 2:307356/149‑1 (MQ=255) tGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGAt < 8:289721/149‑1 (MQ=255) gCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGAccatcc < 6:306853/137‑1 (MQ=255) gCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCACGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGAccatcc > 5:306853/1‑137 (MQ=255) cAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGGTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGccc < 6:73163/149‑1 (MQ=255) ggCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTtcat > 8:341997/1‑148 (MQ=255) ccGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCAc > 8:14260/1‑149 (MQ=255) cgcACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGt > 3:155891/1‑148 (MQ=255) ttCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCGAGTc > 3:173298/1‑149 (MQ=255) aGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCCGACACGCTTCTTCCAGTTGCCCATCCATTCGGTGATGCCCTTCATCACGTACTGCGAGTAggtg > 7:87948/1‑149 (MQ=255) aGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCGAGTCggtg < 2:300468/149‑1 (MQ=255) aGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCGAGTCggtg < 7:341997/149‑1 (MQ=255) aGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGACCTTCATCACGTACTGCGAGTCggtg > 4:59432/1‑149 (MQ=255) ggTTACCTTGTGGCGGTTGACCTCCTCATCGAGCTGCTgccacaaggtaacctggaagtgggtgcgcggccatattggccaccccggcaacgaacgcgccgaccagctggccaaccgtggggtcgatgaggtgcgcgcccagcgttgag < 6:121787‑M2/149‑112 (MQ=255) gTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCg < 7:35647/139‑1 (MQ=255) gTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCg > 8:35647/1‑139 (MQ=255) cTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTgccacaaggtaacctggaagtgggtgcgcggccatattggccaccccggcaacgaacgcgccgaccagctggccaaccgtggggtcgatgaggtgcgcgcccagcgttgagctgggg < 2:337333‑M2/149‑118 (MQ=255) cTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTgccacaaggtaacctggaagtgggtgcgcggccatattggccaccccggcaacgaacgcgccgaccagctggccaaccgtggggtcgatgaggtgcgcgcccagcgttgagctgggg < 3:10668‑M2/149‑118 (MQ=255) cTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTgccacaaggtaacctggaagtgggtgcgcggccatattggccaccccggcaacgaacgcgccgaccagctggccaaccgtggggtcgatgaggtgcgcgcccagcg > 4:74165‑M2/1‑32 (MQ=255) cTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCAc < 6:326175/126‑1 (MQ=255) cTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCAc > 5:326175/1‑126 (MQ=255) aCCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCAtt > 6:229894/1‑148 (MQ=255) cTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCAc > 1:113918/1‑149 (MQ=255) cTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCACGc < 2:51925/148‑1 (MQ=255) aTCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCACGCtt > 5:31580/1‑147 (MQ=255) aGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCAc > 1:65661/1‑139 (MQ=255) aGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCAc < 2:65661/139‑1 (MQ=255) aGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCACGc < 1:191353/141‑1 (MQ=255) aGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCACGc > 2:191353/1‑141 (MQ=255) aGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCACGCTTGAGCGa < 4:155891/149‑1 (MQ=255) | CGATTGTACCCCAGCTCAACGCTGGGCGCGCACCTCATCGACCCCACGGTTGGCCAGCTGGTCGGCGCGTTCGTTGCCGGGGTGGCCAATATGGCCGCGCACCCACTTCCAGGTTACCTTGTGGCGGTTGACCTGCTCATCGAGCTGCTGCCACAAGTCAGCGTTCTTCACCGGCTCCTTGGCGGCGGTCTTCCAGCCACGCTTCTTCCAGTTGACCATCCATTCGTTGATGCCCTTCATCACGTACTGCGAGTCGGTGGTCAGCACCACCTCGCATTCACGCTTGAGCGA > NC_002947/4679495‑4679785 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |