New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 496732 = | 57 (0.960) | 4 (0.070) | 4/242 | NT | 6.7% | coding (604/2388 nt) | PP_0409 | two‑component system sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | 496774 = | 57 (1.020) | coding (646/2388 nt) | PP_0409 | two‑component system sensor histidine kinase |
GCGTGGCGGTGCGCATGCCCAGCCCGCTGGCGGATTACCTGCGCGGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑CTGGCCGATGCTGGCCGATGTACTTGAACGTGGCTTGCAGGCCGTGCCG > NC_002947/496586‑496878 | ggctgcaaccagcgctgatgcagttgctccagctccttggccggcacggcctgcaagccacgttcaagtacatcggccagcatcggccagtcgcgccgcgaaccgatacgcaacagttgcggcaggccaatatcgccgaccaccgcCAg < 2:256516‑M1/3‑1 (MQ=255) ctgcaaccagcgctgatgcagttgctccagctccttggccggcacggcctgcaagccacgttcaagtacatcggccagcatcggccagtcgcgccgcgaaccgatacgcaacagttgcggcaggccaatatcgccgaccaccgcCAGCt < 4:50023‑M1/5‑1 (MQ=255) ctgcaaccagcgctgatgcagttgctccagctccttggccggcacggcctgcaagccacgttcaagtacatcggccagcatcggccagtcgcgccgcgaaccgatacgcaacagttgcggcaggccaatatcgccgaccaccgcCAGCt > 7:296018‑M1/145‑149 (MQ=255) cgcATGCCCAGCCCGCTGGCGGATTACCTGCGCGGCAACTACGGCAACCGCACCCTGCAGGGGGGGCCCGACGAGCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCt < 3:331818/149‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCGCTGGCGGATTACCTGCGCGGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTc < 2:44785/147‑1 (MQ=255) gCCCAGCCCGCTGGCGGATTACCTGCGCGGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTc > 1:44785/1‑147 (MQ=255) ccAGCCCGCTGGCGGATTACCTGCGCGGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCa > 7:346785/1‑130 (MQ=255) ccAGCCCGCTGGCGGATTACCTGCGCGGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCa < 8:346785/130‑1 (MQ=255) cAGCCCGCTGGCGGATTACCTGCGCGGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTcgcgc > 2:193456/1‑148 (MQ=255) ccGCTGGCGGATTACCTGCGCGGCAACTACAGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGagag < 3:30117/149‑1 (MQ=255) tGGCGGATTACCTGCGCGGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCgaga > 7:13631/1‑144 (MQ=255) tGGCGGATTACCTGCGCGGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCgaga < 8:13631/144‑1 (MQ=255) ccTGCGCGGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGc < 5:361880/149‑1 (MQ=255) ccTGCGCGGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGc > 2:243268/1‑149 (MQ=255) gcgcGGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTcgc < 5:335191/125‑1 (MQ=255) gcgcGGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTcgc > 6:335191/1‑125 (MQ=255) gcgcGGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTgg > 3:74206/1‑149 (MQ=255) ccggcacggcctgcaagccacgttcaagtacatcggccagcatcggccagtcgcgccgcgaaccgatacgcaacagttgcggcaggccaatatcgccgaccaccgcCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTgg > 1:256516‑M1/107‑149 (MQ=255) cggcacggcctgcaagccacgttcaagtacatcggccagcatcggccagtcgcgccgcgaacctatacgcaacagttgcggcaggccaatatcgccgaccaccgcCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGc > 6:183910‑M1/106‑149 (MQ=255) cgcgGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTgg < 4:74206/148‑1 (MQ=255) cgcgGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTg < 4:369683/147‑1 (MQ=255) cAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCggtgg > 3:112038/1‑149 (MQ=255) ctcaacctGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTgg > 4:173670/1‑149 (MQ=255) tcaacctGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGc > 5:54775/1‑149 (MQ=255) aacctGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTTGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCt > 3:285311/1‑149 (MQ=255) cctGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGc > 6:36763/1‑149 (MQ=255) cctGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGc > 6:31229/1‑149 (MQ=255) cctGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGc < 3:339166/149‑1 (MQ=255) ctGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCAGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGcc > 5:103021/1‑149 (MQ=255) aGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCaa < 3:92080/149‑1 (MQ=255) tGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGa < 2:311417/127‑1 (MQ=255) tGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTg < 1:29750/149‑1 (MQ=255) tGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAATGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGa > 1:311417/1‑127 (MQ=255) cccGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGc < 1:243268/148‑1 (MQ=255) cccGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGc < 3:173670/148‑1 (MQ=255) gacgaTCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTAt > 3:34399/1‑149 (MQ=255) gacgaTCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTAt > 1:249684/1‑149 (MQ=255) gccagtcgcgccgcgaaccgatacgcaacagttgcggcaggccaatatcgccgaccaccgcCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCg > 6:12314‑M1/62‑106 (MQ=255) gccagtcgcgccgcgaaccgatacgcaacagttgcggcaggccaatatcgccgaccaccgcCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCg < 5:12314‑M1/45‑1 (MQ=255) tGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTcgc > 5:308915/1‑149 (MQ=255) tGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTcgc > 7:307812/1‑149 (MQ=255) ttGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGa > 2:113172/1‑149 (MQ=255) gCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCaa < 1:285552/121‑1 (MQ=255) gCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCaa > 2:285552/1‑121 (MQ=255) gCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑c < 1:193456/148‑1 (MQ=255) aCTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑ctggc < 1:238339/149‑1 (MQ=255) gtggtAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑ctggccgat > 1:297789/1‑149 (MQ=255) gtggtAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑ctggccgat > 2:279392/1‑149 (MQ=255) gtggtAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑ctggccg < 5:31229/147‑1 (MQ=255) gtggtAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑ctggccg < 5:36763/147‑1 (MQ=255) ctGGCGAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGTTGAAGCGGAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGGGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATGGGTGCGCGGCGCGA‑ctggccgatgctggc < 7:61115/147‑1 (MQ=255) gccaggcgagTTTCGGCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGGTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCGGCTGCTGGTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑ctggccgatgctggc > 8:61115/1‑145 (MQ=255) caggccagTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑ctggccgatgctggccgatg > 2:266510/1‑148 (MQ=255) ggccagTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑CTGGCCGATGCTGGCCGATGTAc > 4:231590/1‑149 (MQ=255) gccagTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑CTGGCCGATGCTGGCCGATGTACt > 6:205550/1‑149 (MQ=255) ccagTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑CTGGCCGATGCTGGCCGATGTACtt > 6:304061/1‑149 (MQ=255) gTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGc < 8:78979/93‑1 (MQ=255) gTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGc > 7:78979/1‑93 (MQ=255) gCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑CTGGCCGATGCTGGCCGATGTACTTGAACGTgg < 4:285311/149‑1 (MQ=255) gCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑CTGGCCGATGCTGGCCGATGTACTTGAACGTgg < 2:249684/149‑1 (MQ=255) ccGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑CTGGCCGATGCTGGCCGATGTACTTGAACGTGGc > 8:5228/1‑149 (MQ=255) gTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑CTGGCCGATGCTGGCCGATGTACTTGAACGTGGCtt < 6:54775/149‑1 (MQ=255) cTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑CTGGCCGATGCTGGCCGATGTACTTGAACGTGGCTTGc < 3:231590/148‑1 (MQ=255) ggATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑CTGGCCGATGCTGGCCGATGTACTTGAACGTGGCTTGCAgg > 4:330203/1‑149 (MQ=255) gAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCg < 2:120673/91‑1 (MQ=255) gAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCg > 1:120673/1‑91 (MQ=255) aaGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑CTGGCCGATGCTGGCCGATGTACTTGAACGTGGCTTGCAGGCCGt < 4:34399/148‑1 (MQ=255) aaGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑CTGGCCGATGCTGGCCGATGTACTTGAACGTGGCTTGCAGGCCGTg > 5:180322/1‑149 (MQ=255) aaGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑CTGGCCGATGCTGGCCGATGTACTTGAACGTGGCTTGCAGGCCGTg < 7:5228/149‑1 (MQ=255) gcAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGACCTGGCCGATGCTGGCCGATGTACTTGAACGTGGCTTGCAGGCCGTGCCg < 1:279392/149‑1 (MQ=255) | GCGTGGCGGTGCGCATGCCCAGCCCGCTGGCGGATTACCTGCGCGGCAACTACGGCAACCTCAACCTGCAGGGGGTGCCCGACGATCGTGAGGCCTTGCAACTGGTGGTAGGTGGCCAGGCCAGTTTCGCCGTGCTGGATGAAGCGCAGCTCAGCCGCCTGTCGCGCGAGAGCGAGTTCGGTGAGCTGGCGGTGGTCGGCGATATTGGCCTGCCGCAACTGTTGCGTATCGGTTCGCGGCGCGA‑CTGGCCGATGCTGGCCGATGTACTTGAACGTGGCTTGCAGGCCGTGCCG > NC_002947/496586‑496878 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |