New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 831591 | 72 (1.220) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 5.3% | coding (865/1515 nt) | PP_0715 | outer membrane efflux protein |
? | NC_002947 | = 831649 | 74 (1.280) | coding (923/1515 nt) | PP_0715 | outer membrane efflux protein |
CCAGCTCAACGCCCTGCGCAACATACTGTGCTCGCTGCTTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCG > NC_002947/831446‑831738 | ccAGCTCAACGCCCTGCGCAACATACTGTGCTCGCTGCTTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCACCTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGGACCTGCCCGCCTGCTGCAGCgccgcc > 3:13/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCAACGCCCTGCGCAACATACTGTGCTCGCTGCTTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCgccgcc > 2:185608/1‑149 (MQ=255) cAGCTCAACGCCCTGCGCAACATACTGTGCTCGCTGCTTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGccc < 8:98153/149‑1 (MQ=255) gCTCAACGCCCTGCGCAACATCCTGTGCTCGCTGCTTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCg > 5:307942/1‑148 (MQ=255) aaCGCCCTGCGCAACATACTGTGCTCGCTGCTTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACAt > 6:135129/1‑149 (MQ=255) gCCCTGCGCAACATACTGTGCTCGCTGCTTGGCCGCCCGCCCGGACCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCcg > 7:171260/1‑149 (MQ=255) gcAACATACTGTGCTCGCTGCTTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAACTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCgccgcc > 1:88336/1‑149 (MQ=255) aCTGTGCTCGCTGCTTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGccc < 2:77930/126‑1 (MQ=255) cTGTGCTCGCTGCTTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAgcaggc < 6:38370/149‑1 (MQ=255) cTGTGCTCGCTGCTTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAgcagg < 4:326339/148‑1 (MQ=255) tgtgCTCGCTGCTTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAgcagg > 7:51728/1‑147 (MQ=255) tgCTCGCTGCTTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAgcaggca < 1:185608/147‑1 (MQ=255) cTCGCTGCTTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTgg > 4:26024/1‑149 (MQ=255) gctgctTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTggcgg > 5:123494/1‑149 (MQ=255) ctgctTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTggcggc < 5:135129/149‑1 (MQ=255) tgctTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGgcggcg < 8:53518/149‑1 (MQ=255) ctTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGgcggcg > 3:254368/1‑147 (MQ=255) ctTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCa < 6:280502/149‑1 (MQ=255) ttGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCGCAACCGGGCAGGGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGGCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAg > 6:307159/1‑149 (MQ=255) ttGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGgcggcg > 5:148350/1‑146 (MQ=255) ggCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCa < 6:148350/146‑1 (MQ=255) gccgccCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCg < 1:160522/149‑1 (MQ=255) gccgccCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCg < 8:206746/149‑1 (MQ=255) ccgcccgcCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCaccccgaccagcgccgactgcgccgccactgcctgctcggcggcg > 8:24830‑M1/1‑104 (MQ=255) cgcccgccCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACAGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGgc > 1:275724/1‑149 (MQ=255) gcccgcccGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGgcg > 7:49669/1‑149 (MQ=255) cccgcccgGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGgcgc < 2:85378/149‑1 (MQ=255) cgcccgGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCCACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTg > 3:87594/1‑149 (MQ=255) gcccgGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCaccccgaccagcgccgactgcgccgccactgcctgctcggcggcgcggatg > 4:278896‑M1/1‑98 (MQ=255) ccgGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTc < 8:51728/149‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCaccccgaccagcgccgactgcgccgccactgcctgctcggcggcgcggatgtccgggcggcgct < 3:278896‑M1/149‑65 (MQ=255) ccGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggcc < 4:68753/147‑1 (MQ=255) gCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggccgagg < 3:26024/149‑1 (MQ=255) cAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCaccccgaccagcgccgactgcgccgccactgcctgctcggcggcgcggatgtccgggcggcgctgca < 7:24830‑M1/149‑68 (MQ=255) cTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggccgaggccga > 4:54575/1‑149 (MQ=255) gAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGAt < 8:20455/147‑1 (MQ=255) ggCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCttt < 5:199777/149‑1 (MQ=255) gCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTa > 5:139733/1‑149 (MQ=255) ggCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCcgc < 3:315415/83‑1 (MQ=255) ggCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCcgc > 4:315415/1‑83 (MQ=255) aTGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGTGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAg > 4:175684/1‑149 (MQ=255) aaCTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTc > 1:244633/1‑103 (MQ=255) aaCTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTc < 2:244633/103‑1 (MQ=255) aaCTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGc < 2:88336/149‑1 (MQ=255) aCTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCt < 6:123494/149‑1 (MQ=255) cccTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTg < 6:245698/147‑1 (MQ=255) cccTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTg < 6:139733/147‑1 (MQ=255) cccTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTg < 3:54575/147‑1 (MQ=255) cTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCg > 6:363738/1‑149 (MQ=255) ccAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAg > 4:121609/1‑148 (MQ=255) cAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTa > 5:5238/1‑149 (MQ=255) ccGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCg < 8:750/149‑1 (MQ=255) gCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTg < 8:171260/149‑1 (MQ=255) aGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGa < 3:121609/149‑1 (MQ=255) aGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGa > 2:13343/1‑149 (MQ=255) ttGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGATATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAg < 8:4460/122‑1 (MQ=255) ttGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAg > 7:4460/1‑122 (MQ=255) aGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggccg > 2:360890/1‑93 (MQ=255) aGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggccg < 1:360890/93‑1 (MQ=255) ggATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTAt < 1:283832/149‑1 (MQ=255) gATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATc < 2:275724/149‑1 (MQ=255) gTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGc > 4:322716/1‑149 (MQ=255) aCCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCa > 8:34362/1‑122 (MQ=255) aCCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCa < 7:34362/122‑1 (MQ=255) aCCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGcc > 3:275985/1‑148 (MQ=255) aCCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGCACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGcc > 1:214904/1‑148 (MQ=255) ccTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGAAGTGGCGGCGCAGTCGGCGGTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTGTATCCAGAGCTGAGCTTGGTCGGGAGTGTCGGGTGGAGCTTCGTATccgggat > 4:272347/1‑143 (MQ=255) cTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAat > 5:150086/1‑149 (MQ=255) gCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATc > 5:12464/1‑97 (MQ=255) gCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATc < 6:12464/97‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAatca < 6:150086/148‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAatc < 1:13343/147‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTg > 5:346454/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAatcatc > 5:24756/1‑146 (MQ=255) ccTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAatcatc < 6:24756/146‑1 (MQ=255) ccTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGc < 4:275985/149‑1 (MQ=255) tgctgcAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTg < 1:219667/121‑1 (MQ=255) tgctgcAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTg > 2:219667/1‑121 (MQ=255) tgctgcAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGccc > 7:349890/1‑149 (MQ=255) tgcAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggcgctgcagcaggctggcaggtacatcctgcaacactgcccggttgggcaagggcagttggccatgcccggcctccagctg < 7:24830‑M2/149‑83 (MQ=255) gcAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGaca > 7:350248/1‑149 (MQ=255) gcAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGaca > 5:84087/1‑149 (MQ=255) aGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggcgctgcagcaggctggcaggtacatcctgcaacactgcccggttgggcaagggcagttggccatgcccggcctccagctgcgg < 3:278896‑M2/149‑86 (MQ=255) cgccgcCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCtt > 5:91443/1‑149 (MQ=255) ccgccCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCg < 6:5238/149‑1 (MQ=255) | CCAGCTCAACGCCCTGCGCAACATACTGTGCTCGCTGCTTGGCCGCCCGCCCGGGCCGCTGCCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCG > NC_002947/831446‑831738 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |